WBP11

WBP11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JMQ, 1K5R
Ідентифікатори
Символи	WBP11, NPWBP, PPP1R165, SIPP1, WBP-11, WW domain binding protein 11, CFAP90, BUG13, FAP90, VCTERL, VCTRL
Зовнішні ІД	OMIM: 618083 MGI: 1891823 HomoloGene: 134037 GeneCards: WBP11
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • WW domain binding • RNA binding • protein phosphatase regulator activity Клітинна компонента • nuclear speck • spliceosomal complex • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • Нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • rRNA processing • mRNA cis splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0048552 regulation of catalytic activity • regulation of autophagy of mitochondrion • Сплайсинг РНК • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51729	60321
Ensembl	ENSG00000084463	ENSMUSG00000030216
UniProt	Q9Y2W2	Q923D5
RefSeq (мРНК)	NM_016312	NM_021714
RefSeq (білок)	NP_057396	NP_068360
Локус (UCSC)	Хр. 12: 14.78 – 14.8 Mb	Хр. 6: 136.79 – 136.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WBP11 (англ. WW domain binding protein 11) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 641 амінокислот, а молекулярна маса — 69 998.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRRSTSSTK		SGKFMNPTDQ		ARKEARKREL		KKNKKQRMMV		RAAVLKMKDP
KQIIRDMEKL		DEMEFNPVQQ		PQLNEKVLKD		KRKKLRETFE		RILRLYEKEN
PDIYKELRKL		EVEYEQKRAQ		LSQYFDAVKN		AQHVEVESIP		LPDMPHAPSN
ILIQDIPLPG		AQPPSILKKT		SAYGPPTRAV		SILPLLGHGV		PRLPPGRKPP
GPPPGPPPPQ		VVQMYGRKVG		FALDLPPRRR		DEDMLYSPEL		AQRGHDDDVS
STSEDDGYPE		DMDQDKHDDS		TDDSDTDKSD		GESDGDEFVH		RDNGERDNNE
EKKSGLSVRF		ADMPGKSRKK		KKNMKELTPL		QAMMLRMAGQ		EIPEEGREVE
EFSEDDDEDD		SDDSEAEKQS		QKQHKEESHS		DGTSTASSQQ		QAPPQSVPPS
QIQAPPMPGP		PPLGPPPAPP		LRPPGPPTGL		PPGPPPGAPP		FLRPPGMPGL
RGPLPRLLPP		GPPPGRPPGP		PPGPPPGLPP		GPPPRGPPPR		LPPPAPPGIP
PPRPGMMRPP		LVPPLGPAPP		GLFPPAPLPN		PGVLSAPPNL		IQRPKADDTS
AATIEKKATA		TISAKPQITN		PKAEITRFVP		TALRVRRENK		GATAAPQRKS
EDDSAVPLAK		AAPKSGPSVP		VSVQTKDDVY		EAFMKEMEGL		L

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, процесмнг рРНК, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Komuro A., Saeki M., Kato S. (1999). Association of two nuclear proteins, Npw38 and NpwBP, via the interaction between the WW domain and a novel proline-rich motif containing glycine and arginine. J. Biol. Chem. 274: 36513—36519. PMID 10593949 DOI:10.1074/jbc.274.51.36513
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Llorian M., Beullens M., Andres I., Ortiz J.M., Bollen M. (2004). SIPP1, a novel pre-mRNA splicing factor and interactor of protein phosphatase-1. Biochem. J. 378: 229—238. PMID 14640981 DOI:10.1042/BJ20030950

Див. також

• Хромосома 12