WWC1

WWC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Z0U
Ідентифікатори
Символи	WWC1, HBEBP3, HBEBP36, KIBRA, MEMRYQTL, PPP1R168, WW and C2 domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610533 MGI: 2388637 HomoloGene: 69180 GeneCards: WWC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032947 molecular adaptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • ruffle membrane • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hippo signaling • transcription, DNA-templated • negative regulation of hippo signaling • establishment of cell polarity • regulation of hippo signaling • negative regulation of organ growth • cell migration • positive regulation of MAPK cascade • regulation of intracellular transport • positive regulation of transcription of Notch receptor target Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23286	211652
Ensembl	ENSG00000113645	ENSMUSG00000018849
UniProt	Q8IX03	Q5SXA9
RefSeq (мРНК)	NM_001161661 NM_001161662 NM_015238	NM_170779
RefSeq (білок)	NP_001155133 NP_001155134 NP_056053	NP_740749
Локус (UCSC)	Хр. 5: 168.29 – 168.47 Mb	Хр. 11: 35.73 – 35.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WWC1 (англ. WW and C2 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 113 амінокислот, а молекулярна маса — 125 301.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRPELPLPE		GWEEARDFDG		KVYYIDHTNR		TTSWIDPRDR		YTKPLTFADC
ISDELPLGWE		EAYDPQVGDY		FIDHNTKTTQ		IEDPRVQWRR		EQEHMLKDYL
VVAQEALSAQ		KEIYQVKQQR		LELAQQEYQQ		LHAVWEHKLG		SQVSLVSGSS
SSSKYDPEIL		KAEIATAKSR		VNKLKREMVH		LQHELQFKER		GFQTLKKIDK
KMSDAQGSYK		LDEAQAVLRE		TKAIKKAITC		GEKEKQDLIK		SLAMLKDGFR
TDRGSHSDLW		SSSSSLESSS		FPLPKQYLDV		SSQTDISGSF		GINSNNQLAE
KVRLRLRYEE		AKRRIANLKI		QLAKLDSEAW		PGVLDSERDR		LILINEKEEL
LKEMRFISPR		KWTQGEVEQL		EMARKRLEKD		LQAARDTQSK		ALTERLKLNS
KRNQLVRELE		EATRQVATLH		SQLKSLSSSM		QSLSSGSSPG		SLTSSRGSLV
ASSLDSSTSA		SFTDLYYDPF		EQLDSELQSK		VEFLLLEGAT		GFRPSGCITT
IHEDEVAKTQ		KAEGGGRLQA		LRSLSGTPKS		MTSLSPRSSL		SSPSPPCSPL
MADPLLAGDA		FLNSLEFEDP		ELSATLCELS		LGNSAQERYR		LEEPGTEGKQ
LGQAVNTAQG		CGLKVACVSA		AVSDESVAGD		SGVYEASVQR		LGASEAAAFD
SDESEAVGAT		RIQIALKYDE		KNKQFAILII		QLSNLSALLQ		QQDQKVNIRV
AVLPCSESTT		CLFRTRPLDA		SDTLVFNEVF		WVSMSYPALH		QKTLRVDVCT
TDRSHLEECL		GGAQISLAEV		CRSGERSTRW		YNLLSYKYLK		KQSRELKPVG
VMAPASGPAS		TDAVSALLEQ		TAVELEKRQE		GRSSTQTLED		SWRYEETSEN
EAVAEEEEEE		VEEEEGEEDV		FTEKASPDMD		GYPALKVDKE		TNTETPAPSP
TVVRPKDRRV		GTPSQGPFLR		GSTIIRSKTF		SPGPQSQYVC		RLNRSDSDSS
TLSKKPPFVR		NSLERRSVRM		KRPSSVKSLR		SERLIRTSLD		LELDLQATRT
WHSQLTQEIS		VLKELKEQLE		QAKSHGEKEL		PQWLREDERF		RLLLRMLEKR
QMDRAEHKGE		LQTDKMMRAA		AKDVHRLRGQ		SCKEPPEVQS		FREKMAFFTR
PRMNIPALSA		DDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Buether K., Plaas C., Barnekow A., Kremerskothen J. (2004). KIBRA is a novel substrate for protein kinase Czeta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 317: 703—707. PMID 15081397 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.03.107
• Johannsen S., Duning K., Pavenstaedt H., Kremerskothen J., Boeckers T.M. (2008). Temporal-spatial expression and novel biochemical properties of the memory-related protein KIBRA. Neuroscience. 155: 1165—1173. PMID 18672031 DOI:10.1016/j.neuroscience.2008.06.054
• Genevet A., Wehr M.C., Brain R., Thompson B.J., Tapon N. (2010). Kibra Is a regulator of the Salvador/Warts/Hippo signaling network. Dev. Cell. 18: 300—308. PMID 20159599 DOI:10.1016/j.devcel.2009.12.011

Див. також

• Хромосома 5