WWP1

WWP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ND7, 5HPS, 5HPT
Ідентифікатори
Символи	WWP1, AIP5, Tiul1, hSDRP1, WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602307 MGI: 1861728 HomoloGene: 21385 GeneCards: WWP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • viral entry into host cell • central nervous system development • ion transmembrane transport • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11059	107568
Ensembl	ENSG00000123124	ENSMUSG00000041058
UniProt	Q9H0M0	Q8BZZ3
RefSeq (мРНК)	NM_007013	NM_001276292 NM_177327 NM_001355222
RefSeq (білок)	NP_008944	NP_001263221 NP_796301 NP_001342151
Локус (UCSC)	Хр. 8: 86.34 – 86.48 Mb	Хр. 4: 19.61 – 19.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WWP1 (англ. WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 922 амінокислот, а молекулярна маса — 105 202.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATASPRSDT		SNNHSGRLQL		QVTVSSAKLK		RKKNWFGTAI		YTEVVVDGEI
TKTAKSSSSS		NPKWDEQLTV		NVTPQTTLEF		QVWSHRTLKA		DALLGKATID
LKQALLIHNR		KLERVKEQLK		LSLENKNGIA		QTGELTVVLD		GLVIEQENIT
NCSSSPTIEI		QENGDALHEN		GEPSARTTAR		LAVEGTNGID		NHVPTSTLVQ
NSCCSYVVNG		DNTPSSPSQV		AARPKNTPAP		KPLASEPADD		TVNGESSSFA
PTDNASVTGT		PVVSEENALS		PNCTSTTVED		PPVQEILTSS		ENNECIPSTS
AELESEARSI		LEPDTSNSRS		SSAFEAAKSR		QPDGCMDPVR		QQSGNANTET
LPSGWEQRKD		PHGRTYYVDH		NTRTTTWERP		QPLPPGWERR		VDDRRRVYYV
DHNTRTTTWQ		RPTMESVRNF		EQWQSQRNQL		QGAMQQFNQR		YLYSASMLAA
ENDPYGPLPP		GWEKRVDSTD		RVYFVNHNTK		TTQWEDPRTQ		GLQNEEPLPE
GWEIRYTREG		VRYFVDHNTR		TTTFKDPRNG		KSSVTKGGPQ		IAYERGFRWK
LAHFRYLCQS		NALPSHVKIN		VSRQTLFEDS		FQQIMALKPY		DLRRRLYVIF
RGEEGLDYGG		LAREWFFLLS		HEVLNPMYCL		FEYAGKNNYC		LQINPASTIN
PDHLSYFCFI		GRFIAMALFH		GKFIDTGFSL		PFYKRMLSKK		LTIKDLESID
TEFYNSLIWI		RDNNIEECGL		EMYFSVDMEI		LGKVTSHDLK		LGGSNILVTE
ENKDEYIGLM		TEWRFSRGVQ		EQTKAFLDGF		NEVVPLQWLQ		YFDEKELEVM
LCGMQEVDLA		DWQRNTVYRH		YTRNSKQIIW		FWQFVKETDN		EVRMRLLQFV
TGTCRLPLGG		FAELMGSNGP		QKFCIEKVGK		DTWLPRSHTC		FNRLDLPPYK
SYEQLKEKLL		FAIEETEGFG		QE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Flasza M., Gorman P., Roylance R., Canfield A.E., Baron M. (2002). Alternative splicing determines the domain structure of WWP1, a Nedd4 family protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290: 431—437. PMID 11779188 DOI:10.1006/bbrc.2001.6206
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Galinier R., Gout E., Lortat-Jacob H., Wood J., Chroboczek J. (2002). Adenovirus protein involved in virus internalization recruits ubiquitin-protein ligases. Biochemistry. 41: 14299—14305. PMID 12450395 DOI:10.1021/bi020125b
• Mund T., Pelham H.R. (2009). Control of the activity of WW-HECT domain E3 ubiquitin ligases by NDFIP proteins. EMBO Rep. 10: 501—507. PMID 19343052 DOI:10.1038/embor.2009.30
• Li Y., Zhou Z., Alimandi M., Chen C. (2009). WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 targets the full-length ErbB4 for ubiquitin-mediated degradation in breast cancer. Oncogene. 28: 2948—2958. PMID 19561640 DOI:10.1038/onc.2009.162

Див. також

• Хромосома 8