WWP2

WWP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4Y07
Ідентифікатори
Символи	WWP2, AIP2, WWp2-like, WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602308 MGI: 1914144 HomoloGene: 48490 GeneCards: WWP2
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • мембрана • ubiquitin ligase complex • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of gene expression • negative regulation of protein transport • regulation of potassium ion transmembrane transporter activity • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transporter activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein K63-linked ubiquitination • extracellular transport • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • negative regulation of Notch signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11060	66894
Ensembl	ENSG00000198373	ENSMUSG00000031930
UniProt	O00308	Q9DBH0
RefSeq (мРНК)	NM_001270453 NM_001270454 NM_001270455 NM_007014 NM_199424	NM_025830
RefSeq (білок)	NP_001257382 NP_001257383 NP_001257384 NP_008945 NP_955456	NP_080106
Локус (UCSC)	Хр. 16: 69.76 – 69.94 Mb	Хр. 8: 108.16 – 108.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WWP2 (англ. WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870 амінокислот, а молекулярна маса — 98 912.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASASSSRAG		VALPFEKSQL		TLKVVSAKPK		VHNRQPRINS		YVEVAVDGLP
SETKKTGKRI		GSSELLWNEI		IILNVTAQSH		LDLKVWSCHT		LRNELLGTAS
VNLSNVLKNN		GGKMENMQLT		LNLQTENKGS		VVSGGELTIF		LDGPTVDLGN
VPNGSALTDG		SQLPSRDSSG		TAVAPENRHQ		PPSTNCFGGR		SRTHRHSGAS
ARTTPATGEQ		SPGARSRHRQ		PVKNSGHSGL		ANGTVNDEPT		TATDPEEPSV
VGVTSPPAAP		LSVTPNPNTT		SLPAPATPAE		GEEPSTSGTQ		QLPAAAQAPD
ALPAGWEQRE		LPNGRVYYVD		HNTKTTTWER		PLPPGWEKRT		DPRGRFYYVD
HNTRTTTWQR		PTAEYVRNYE		QWQSQRNQLQ		GAMQHFSQRF		LYQSSSASTD
HDPLGPLPPG		WEKRQDNGRV		YYVNHNTRTT		QWEDPRTQGM		IQEPALPPGW
EMKYTSEGVR		YFVDHNTRTT		TFKDPRPGFE		SGTKQGSPGA		YDRSFRWKYH
QFRFLCHSNA		LPSHVKISVS		RQTLFEDSFQ		QIMNMKPYDL		RRRLYIIMRG
EEGLDYGGIA		REWFFLLSHE		VLNPMYCLFE		YAGKNNYCLQ		INPASSINPD
HLTYFRFIGR		FIAMALYHGK		FIDTGFTLPF		YKRMLNKRPT		LKDLESIDPE
FYNSIVWIKE		NNLEECGLEL		YFIQDMEILG		KVTTHELKEG		GESIRVTEEN
KEEYIMLLTD		WRFTRGVEEQ		TKAFLDGFNE		VAPLEWLRYF		DEKELELMLC
GMQEIDMSDW		QKSTIYRHYT		KNSKQIQWFW		QVVKEMDNEK		RIRLLQFVTG
TCRLPVGGFA		ELIGSNGPQK		FCIDKVGKET		WLPRSHTCFN		RLDLPPYKSY
EQLREKLLYA		IEETEGFGQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Galinier R., Gout E., Lortat-Jacob H., Wood J., Chroboczek J. (2002). Adenovirus protein involved in virus internalization recruits ubiquitin-protein ligases. Biochemistry. 41: 14299—14305. PMID 12450395 DOI:10.1021/bi020125b
• Harvey K.F., Shearwin-Whyatt L.M., Fotia A., Parton R.G., Kumar S. (2002). N4WBP5, a potential target for ubiquitination by the Nedd4 family of proteins, is a novel Golgi-associated protein. J. Biol. Chem. 277: 9307—9317. PMID 11748237 DOI:10.1074/jbc.M110443200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Mund T., Pelham H.R. (2009). Control of the activity of WW-HECT domain E3 ubiquitin ligases by NDFIP proteins. EMBO Rep. 10: 501—507. PMID 19343052 DOI:10.1038/embor.2009.30
• Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways. Mol. Cancer Res. 8: 1388—1398. PMID 20858735 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042

Див. також

• Хромосома 16