XRN2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
XRN2
Ідентифікатори
Символи XRN2, entrez:22803, 5'-3' exoribonuclease 2
Зовнішні ІД OMIM: 608851 MGI: 894687 HomoloGene: 6927 GeneCards: XRN2
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_012255
NM_001317960
NM_011917
NM_001356402
NM_001356403
RefSeq (білок)
NP_001304889
NP_036387
NP_036047
NP_001343331
NP_001343332
Локус (UCSC) Хр. 20: 21.3 – 21.39 Mb Хр. 2: 146.85 – 146.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

XRN2 (англ. 5'-3' exoribonuclease 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 108 582[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASKPNPNDVEFDN
LYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFSIVRPRRLLYM
AIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEE
IKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASA
PGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTI
IREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEGE
FIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHL
PSLEIRENAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVE
DSIFKKRKDDEDSFRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPSGILTPHALGSRNSPG
SQVASNPRQAAYEMRMQNNSSPSISPNTSFTSDGSPSPLGGIKRKAEDSD
SEPEPEDNVRLWEAGWKQRYYKNKFDVDAADEKFRRKVVQSYVEGLCWVL
RYYYQGCASWKWYYPFHYAPFASDFEGIADMPSDFEKGTKPFKPLEQLMG
VFPAASGNFLPPSWRKLMSDPDSSIIDFYPEDFAIDLNGKKYAWQGVALL
PFVDERRLRAALEEVYPDLTPEETRRNSLGGDVLFVGKHHPLHDFILELY
QTGSTEPVEVPPELCHGIQGKFSLDEEAILPDQIVCSPVPMLRDLTQNTV
VSINFKDPQFAEDYIFKAVMLPGARKPAAVLKPSDWEKSSNGRQWKPQLG
FNRDRRPVHLDQAAFRTLGHVMPRGSGTGIYSNAAPPPVTYQGNLYRPLL
RGQAQIPKLMSNMRPQDSWRGPPPLFQQQRFDRGVGAEPLLPWNRMLQTQ
NAAFQPNQYQMLAGPGGYPPRRDDRGGRQGYPREGRKYPLPPPSGRYNWN

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • West S., Gromak N., Proudfoot N.J. (2004). Human 5' -> 3' exonuclease Xrn2 promotes transcription termination at co-transcriptional cleavage sites. Nature. 432: 522—525. PMID 15565158 DOI:10.1038/nature03035
  • Gromak N., West S., Proudfoot N.J. (2006). Pause sites promote transcriptional termination of mammalian RNA polymerase II. Mol. Cell. Biol. 26: 3986—3996. PMID 16648491 DOI:10.1128/MCB.26.10.3986-3996.2006
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Skourti-Stathaki K., Proudfoot N.J., Gromak N. (2011). Human senataxin resolves RNA/DNA hybrids formed at transcriptional pause sites to promote Xrn2-dependent termination. Mol. Cell. 42: 794—805. PMID 21700224 DOI:10.1016/j.molcel.2011.04.026
  • Miki T.S., Richter H., Rueegger S., Grosshans H. (2014). PAXT-1 promotes XRN2 activity by stabilizing it through a conserved domain. Mol. Cell. 53: 351—360. PMID 24462208 DOI:10.1016/j.molcel.2014.01.001

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12836 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q9H0D6 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]