YAF2

YAF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D9G
Ідентифікатори
Символи	YAF2, YY1 associated factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607534 MGI: 1914307 HomoloGene: 136401 GeneCards: YAF2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of G0 to G1 transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10138	67057
Ensembl	ENSG00000015153	ENSMUSG00000022634
UniProt	Q8IY57	Q99LW6
RefSeq (мРНК)	NM_001012424 NM_001190977 NM_001190979 NM_001190980 NM_005748 NM_001320080	NM_024189
RefSeq (білок)	NP_001177906 NP_001177908 NP_001177909 NP_001307009 NP_005739	NP_077151
Локус (UCSC)	Хр. 12: 42.16 – 42.24 Mb	Хр. 15: 93.18 – 93.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

YAF2 (англ. YY1 associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 180 амінокислот, а молекулярна маса — 19 901.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDKKSPTRP		KRQPKPSSDE		GYWDCSVCTF		RNSAEAFKCM		MCDVRKGTST
RKPRPVSQLV		AQQVTQQFVP		PTQSKKEKKD		KVEKEKSEKE		TTSKKNSHKK
TRPRLKNVDR		SSAQHLEVTV		GDLTVIITDF		KEKTKSPPAS		SAASADQHSQ
SGSSSDNTER		GMSRSSSPRG		EASSLNGESH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Kalenik J.L., Chen D., Bradley M.E., Chen S.-J., Lee T.-C. (1997). Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1. Nucleic Acids Res. 25: 843—849. PMID 9016636 DOI:10.1093/nar/25.4.843
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bannasch D., Maedge B., Schwab M. (2001). Functional interaction of Yaf2 with the central region of MycN. Oncogene. 20: 5913—5919. PMID 11593398 DOI:10.1038/sj.onc.1204747
• Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 DOI:10.1126/science.1069861
• Maedge B., Geisen C., Moeroey T., Schwab M. (2003). Yaf2 inhibits Myc biological function. Cancer Lett. 193: 171—176. PMID 12706874 DOI:10.1016/S0304-3835(02)00696-1

Див. також

• Хромосома 12