ZBED1

ZBED1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CT5
Ідентифікатори
Символи	ZBED1, ALTE, DREF, TRAMP, hDREF, zinc finger BED-type containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 300178 HomoloGene: 123965 GeneCards: ZBED1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • transposase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • identical protein binding • SUMO transferase activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • nuclear chromosome • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein sumoylation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9189	101884285
Ensembl	ENSG00000214717	н/д
UniProt	O96006	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_004729 NM_001171135 NM_001171136	XM_017357882
RefSeq (білок)	NP_001164606 NP_001164607 NP_004720	н/д
Локус (UCSC)	Хр. X: 2.49 – 2.5 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZBED1 (англ. Zinc finger BED-type containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 694 амінокислот, а молекулярна маса — 78 156.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENKSLESSQ		TDLKLVAHPR		AKSKVWKYFG		FDTNAEGCIL		QWKKIYCRIC
MAQIAYSGNT		SNLSYHLEKN		HPEEFCEFVK		SNTEQMREAF		ATAFSKLKPE
SSQQPGQDAL		AVKAGHGYDS		KKQQELTAAV		LGLICEGLYP		ASIVDEPTFK
VLLKTADPRY		ELPSRKYIST		KAIPEKYGAV		REVILKELAE		ATWCGISTDM
WRSENQNRAY		VTLAAHFLGL		GAPNCLSMGS		RCLKTFEVPE		ENTAETITRV
LYEVFIEWGI		SAKVFGATTN		YGKDIVKACS		LLDVAVHMPC		LGHTFNAGIQ
QAFQLPKLGA		LLSRCRKLVE		YFQQSAVAMY		MLYEKQKQQN		VAHCMLVSNR
VSWWGSTLAM		LQRLKEQQFV		IAGVLVEDSN		NHHLMLEASE		WATIEGLVEL
LQPFKQVAEM		LSASRYPTIS		MVKPLLHMLL		NTTLNIKETD		SKELSMAKEV
IAKELSKTYQ		ETPEIDMFLN		VATFLDPRYK		RLPFLSAFER		QQVENRVVEE
AKGLLDKVKD		GGYRPAEDKI		FPVPEEPPVK		KLMRTSTPPP		ASVINNMLAE
IFCQTGGVED		QEEWHAQVVE		ELSNFKSQKV		LGLNEDPLKW		WSDRLALFPL
LPKVLQKYWC		VTATRVAPER		LFGSAANVVS		AKRNRLAPAH		VDEQVFLYEN
ARSGAEAEPE		DQDEGEWGLD		QEQVFSLGDG		VSGGFFGIRD		SSFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ohshima N., Takahashi M., Hirose F. (2003). Identification of a human homologue of the DREF transcription factor with a potential role in regulation of the histone H1 gene. J. Biol. Chem. 278: 22928—22938. PMID 12663651 DOI:10.1074/jbc.M303109200

Див. також

• Хромосома X