ZC3HAV1

ZC3HAV1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2X5Y, 4X52
Ідентифікатори
Символи	ZC3HAV1, ARTD13, FLB6421, PARP13, ZAP, ZC3H2, ZC3HDC2, zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607312 MGI: 1926031 HomoloGene: 10585 GeneCards: ZC3HAV1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • cadherin binding • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • NAD+ binding • protein ADP-ribosylase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of interferon-alpha production • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of mRNA catabolic process • negative regulation of viral genome replication • positive regulation of RIG-I signaling pathway • defense response to virus • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • positive regulation of interferon-beta production • protein poly-ADP-ribosylation • protein ADP-ribosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56829	78781
Ensembl	ENSG00000105939	ENSMUSG00000029826
UniProt	Q7Z2W4	Q3UPF5
RefSeq (мРНК)	NM_020119 NM_024625 NM_001363491	NM_028421 NM_028864 NM_001347122
RefSeq (білок)	NP_064504 NP_078901 NP_001350420	NP_001334051 NP_082697 NP_083140
Локус (UCSC)	Хр. 7: 139.04 – 139.13 Mb	Хр. 6: 38.28 – 38.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZC3HAV1 (англ. Zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 902 амінокислот, а молекулярна маса — 101 431.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADPEVCCFI		TKILCAHGGR		MALDALLQEI		ALSEPQLCEV		LQVAGPDRFV
VLETGGEAGI		TRSVVATTRA		RVCRRKYCQR		PCDNLHLCKL		NLLGRCNYSQ
SERNLCKYSH		EVLSEENFKV		LKNHELSGLN		KEELAVLLLQ		SDPFFMPEIC
KSYKGEGRQQ		ICNQQPPCSR		LHICDHFTRG		NCRFPNCLRS		HNLMDRKVLA
IMREHGLNPD		VVQNIQDICN		SKHMQKNPPG		PRAPSSHRRN		MAYRARSKSR
DRFFQGSQEF		LASASASAER		SCTPSPDQIS		HRASLEDAPV		DDLTRKFTYL
GSQDRARPPS		GSSKATDLGG		TSQAGTSQRF		LENGSQEDLL		HGNPGSTYLA
SNSTSAPNWK		SLTSWTNDQG		ARRKTVFSPT		LPAARSSLGS		LQTPEAVTTR
KGTGLLSSDY		RIINGKSGTQ		DIQPGPLFNN		NADGVATDIT		STRSLNYKST
SSGHREISSP		RIQDAGPASR		DVQATGRIAD		DADPRVALVN		DSLSDVTSTT
SSRVDDHDSE		EICLDHLCKG		CPLNGSCSKV		HFHLPYRWQM		LIGKTWTDFE
HMETIEKGYC		NPGIHLCSVG		SYTINFRVMS		CDSFPIRRLS		TPSSVTKPAN
SVFTTKWIWY		WKNESGTWIQ		YGEEKDKRKN		SNVDSSYLES		LYQSCPRGVV
PFQAGSRNYE		LSFQGMIQTN		IASKTQKDVI		RRPTFVPQWY		VQQMKRGPDH
QPAKTSSVSL		TATFRPQEDF		CFLSSKKYKL		SEIHHLHPEY		VRVSEHFKAS
MKNFKIEKIK		KIENSELLDK		FTWKKSQMKE		EGKLLFYATS		RAYVESICSN
NFDSFLHETH		ENKYGKGIYF		AKDAIYSHKN		CPYDAKNVVM		FVAQVLVGKF
TEGNITYTSP		PPQFDSCVDT		RSNPSVFVIF		QKDQVYPQYV		IEYTEDKACV
IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kerns J.A., Emerman M., Malik H.S. (2008). Positive selection and increased antiviral activity associated with the PARP-containing isoform of human zinc-finger antiviral protein. PLoS Genet. 4: E21—E21. PMID 18225958 DOI:10.1371/journal.pgen.0040021
• Zhu Y., Gao G. (2008). ZAP-mediated mRNA degradation. RNA Biol. 5: 65—67. PMID 18418085 DOI:10.4161/rna.5.2.6044
• Jeong M.S., Kim E.J., Jang S.B. (2010). Expression and RNA-binding of human zinc-finger antiviral protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 396: 696—702. PMID 20451500 DOI:10.1016/j.bbrc.2010.04.164
• Ye P., Liu S., Zhu Y., Chen G., Gao G. (2010). DEXH-Box protein DHX30 is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Protein Cell. 1: 956—964. PMID 21204022 DOI:10.1007/s13238-010-0117-8

Див. також

• Хромосома 7