ZFPM1

ZFPM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XU7
Ідентифікатори
Символи	ZFPM1, FOG, FOG1, ZC2HC11A, ZNF408, ZNF89A, zinc finger protein, FOG family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601950 MGI: 1095400 HomoloGene: 7606 GeneCards: ZFPM1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • transcription repressor complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • megakaryocyte development • megakaryocyte differentiation • negative regulation of mast cell differentiation • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • homeostasis of number of cells • ventricular septum morphogenesis • outflow tract morphogenesis • Тромбоцитопоез • зсідання крові • cardiac muscle tissue morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of protein binding • transcription, DNA-templated • regulation of chemokine production • atrial septum morphogenesis • heart development • atrioventricular valve morphogenesis • granulocyte differentiation • embryonic hemopoiesis • regulation of definitive erythrocyte differentiation • T-helper cell lineage commitment • primitive erythrocyte differentiation • mitral valve formation • tricuspid valve formation • definitive erythrocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • erythrocyte differentiation • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	161882	22761
Ensembl	ENSG00000179588	ENSMUSG00000049577
UniProt	Q8IX07	O35615
RefSeq (мРНК)	NM_153813	NM_009569
RefSeq (білок)	NP_722520	NP_033595
Локус (UCSC)	Хр. 16: 88.45 – 88.54 Mb	Хр. 8: 123.01 – 123.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZFPM1 (англ. Zinc finger protein, FOG family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 006 амінокислот, а молекулярна маса — 104 888.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRRKQSNPR		QIKRSLGDME		AREEVQLVGA		SHMEQKATAP		EAPSPPSADV
NSPPPLPPPT		SPGGPKELEG		QEPEPRPTEE		EPGSPWSGPD		ELEPVVQDGQ
RRIRARLSLA		TGLSWGPFHG		SVQTRASSPR		QAEPSPALTL		LLVDEACWLR
TLPQALTEAE		ANTEIHRKDD		ALWCRVTKPV		PAGGLLSVLL		TAEPHSTPGH
PVKKEPAEPT		CPAPAHDLQL		LPQQAGMASI		LATAVINKDV		FPCKDCGIWY
RSERNLQAHL		LYYCASRQGT		GSPAAAATDE		KPKETYPNER		VCPFPQCRKS
CPSASSLEIH		MRSHSGERPF		VCLICLSAFT		TKANCERHLK		VHTDTLSGVC
HSCGFISTTR		DILYSHLVTN		HMVCQPGSKG		EIYSPGAGHP		ATKLPPDSLG
SFQQQHTALQ		GPLASADLGL		APTPSPGLDR		KALAEATNGE		ARAEPLAQNG
GSSEPPAAPR		SIKVEAVEEP		EAAPILGPGE		PGPQAPSRTP		SPRSPAPARV
KAELSSPTPG		SSPVPGELGL		AGALFLPQYV		FGPDAAPPAS		EILAKMSELV
HSRLQQGAGA		GAGGAQTGLF		PGAPKGATCF		ECEITFSNVN		NYYVHKRLYC
SGRRAPEDAP		AARRPKAPPG		PARAPPGQPA		EPDAPRSSPG		PGAREEGAGG
AATPEDGAGG		RGSEGSQSPG		SSVDDAEDDP		SRTLCEACNI		RFSRHETYTV
HKRYYCASRH		DPPPRRPAAP		PGPPGPAAPP		APSPAAPVRT		RRRRKLYELH
AAGAPPPPPP		GHAPAPESPR		PGSGSGSGPG		LAPARSPGPA		ADGPIDLSKK
PRRPLPGAPA		PALADYHECT		ACRVSFHSLE		AYLAHKKYSC		PAAPPPGALG
LPAAACPYCP		PNGPVRGDLL		EHFRLAHGLL		LGAPLAGPGV		EARTPADRGP
SPAPAPAASP		QPGSRGPRDG		LGPEPQEPPP		GPPPSPAAAP		EAVPPPPAPP
SYSDKGVQTP		SKGTPAPLPN		GNHRYCRLCN		IKFSSLSTFI		AHKKYYCSSH
AAEHVK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Див. також

• Хромосома 16