ZIC1

ZIC1
Ідентифікатори
Символи	ZIC1, ZIC, ZNF201, CRS6, Zic family member 1, BAIDCS
Зовнішні ІД	OMIM: 600470 MGI: 106683 HomoloGene: 2562 GeneCards: ZIC1
Пов'язані генетичні захворювання
craniosynostosis 6
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • nucleic acid binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • pattern specification process • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • regulation of smoothened signaling pathway • central nervous system development • brain development • inner ear morphogenesis • spinal cord development • positive regulation of protein import into nucleus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • adult walking behavior Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7545	22771
Ensembl	ENSG00000152977	ENSMUSG00000032368
UniProt	Q15915	P46684
RefSeq (мРНК)	NM_003412	NM_009573 NM_001376941
RefSeq (білок)	NP_003403	NP_033599 NP_001363870
Локус (UCSC)	Хр. 3: 147.39 – 147.51 Mb	Хр. 9: 91.24 – 91.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZIC1 (англ. Zic family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот, а молекулярна маса — 48 309.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLDAGPQYP		AIGVTTFGAS		RHHSAGDVAE		RDVGLGINPF		ADGMGAFKLN
PSSHELASAG		QTAFTSQAPG		YAAAAALGHH		HHPGHVGSYS		SAAFNSTRDF
LFRNRGFGDA		AAAASAQHSL		FAASAGGFGG		PHGHTDAAGH		LLFPGLHEQA
AGHASPNVVN		GQMRLGFSGD		MYPRPEQYGQ		VTSPRSEHYA		APQLHGYGPM
NVNMAAHHGA		GAFFRYMRQP		IKQELICKWI		EPEQLANPKK		SCNKTFSTMH
ELVTHVTVEH		VGGPEQSNHI		CFWEECPREG		KPFKAKYKLV		NHIRVHTGEK
PFPCPFPGCG		KVFARSENLK		IHKRTHTGEK		PFKCEFEGCD		RRFANSSDRK
KHMHVHTSDK		PYLCKMCDKS		YTHPSSLRKH		MKVHESSSQG		SQPSPAASSG
YESSTPPTIV		SPSTDNPTTS		SLSPSSSAVH		HTAGHSALSS		NFNEWYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3