ZMYND8

ZMYND8
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4COS
Ідентифікатори
Символи	ZMYND8, PRKCBP1, PRO2893, RACK7, zinc finger MYND-type containing 8
Зовнішні ІД	OMIM: 615713 MGI: 1918025 HomoloGene: 32679 GeneCards: ZMYND8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding • lysine-acetylated histone binding • protein N-terminus binding • zinc ion binding • protein domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • dendritic shaft • dendritic spine • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of postsynaptic density protein 95 clustering • positive regulation of filopodium assembly • positive regulation of dendritic spine development • positive regulation of dendritic spine maintenance • modulation of excitatory postsynaptic potential • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell migration • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23613	228880
Ensembl	ENSG00000101040	ENSMUSG00000039671
UniProt	Q9ULU4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001281769 NM_001281771 NM_001281772 NM_001281773 NM_001281774 NM_001281775 NM_001281776 NM_001281777 NM_001281778 NM_001281779 NM_001281780 NM_001281781 NM_001281782 NM_001281783 NM_001281784 NM_012408 NM_183047 NM_183048 NM_001363714 NM_001363741	NM_001252584 NM_001252585 NM_001252587 NM_001281926 NM_001291158 NM_027230 NM_172270 NM_001363018 NM_001363019 NM_001363020 NM_001363021
RefSeq (білок)	NP_001268698 NP_001268700 NP_001268701 NP_001268702 NP_001268703 NP_001268704 NP_001268705 NP_001268706 NP_001268707 NP_001268708 NP_001268709 NP_001268710 NP_001268711 NP_001268712 NP_001268713 NP_036540 NP_898868 NP_898869 NP_001350643 NP_001350670	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 20: 47.21 – 47.36 Mb	Хр. 2: 165.63 – 165.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZMYND8 (англ. Zinc finger MYND-type containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 186 амінокислот, а молекулярна маса — 131 692.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDISTRSKDP		GSAERTAQKR		KFPSPPHSSN		GHSPQDTSTS		PIKKKKKPGL
LNSNNKEQSE		LRHGPFYYMK		QPLTTDPVDV		VPQDGRNDFY		CWVCHREGQV
LCCELCPRVY		HAKCLRLTSE		PEGDWFCPEC		EKITVAECIE		TQSKAMTMLT
IEQLSYLLKF		AIQKMKQPGT		DAFQKPVPLE		QHPDYAEYIF		HPMDLCTLEK
NAKKKMYGCT		EAFLADAKWI		LHNCIIYNGG		NHKLTQIAKV		VIKICEHEMN
EIEVCPECYL		AACQKRDNWF		CEPCSNPHPL		VWAKLKGFPF		WPAKALRDKD
GQVDARFFGQ		HDRAWVPINN		CYLMSKEIPF		SVKKTKSIFN		SAMQEMEVYV
ENIRRKFGVF		NYSPFRTPYT		PNSQYQMLLD		PTNPSAGTAK		IDKQEKVKLN
FDMTASPKIL		MSKPVLSGGT		GRRISLSDMP		RSPMSTNSSV		HTGSDVEQDA
EKKATSSHFS		ASEESMDFLD		KSTASPASTK		TGQAGSLSGS		PKPFSPQLSA
PITTKTDKTS		TTGSILNLNL		DRSKAEMDLK		ELSESVQQQS		TPVPLISPKR
QIRSRFQLNL		DKTIESCKAQ		LGINEISEDV		YTAVEHSDSE		DSEKSDSSDS
EYISDDEQKS		KNEPEDTEDK		EGCQMDKEPS		AVKKKPKPTN		PVEIKEELKS
TSPASEKADP		GAVKDKASPE		PEKDFSEKAK		PSPHPIKDKL		KGKDETDSPT
VHLGLDSDSE		SELVIDLGED		HSGREGRKNK		KEPKEPSPKQ		DVVGKTPPST
TVGSHSPPET		PVLTRSSAQT		SAAGATATTS		TSSTVTVTAP		APAATGSPVK
KQRPLLPKET		APAVQRVVWN		SSSKFQTSSQ		KWHMQKMQRQ		QQQQQQQNQQ
QQPQSSQGTR		YQTRQAVKAV		QQKEITQSPS		TSTITLVTST		QSSPLVTSSG
SMSTLVSSVN		ADLPIATASA		DVAADIAKYT		SKMMDAIKGT		MTEIYNDLSK
NTTGSTIAEI		RRLRIEIEKL		QWLHQQELSE		MKHNLELTMA		EMRQSLEQER
DRLIAEVKKQ		LELEKQQAVD		ETKKKQWCAN		CKKEAIFYCC		WNTSYCDYPC
QQAHWPEHMK		SCTQSATAPQ		QEADAEVNTE		TLNKSSQGSS		SSTQSAPSET
ASASKEKETS		AEKSKESGST		LDLSGSRETP		SSILLGSNQG		SDHSRSNKSS
WSSSDEKRGS		TRSDHNTSTS		TKSLLPKESR		LDTFWD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 20