ZNF175

ZNF175
Ідентифікатори
Символи	ZNF175, OTK18, zinc finger protein 175
Зовнішні ІД	OMIM: 601139 MGI: 1917180 HomoloGene: 74591 GeneCards: ZNF175
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • intermediate filament cytoskeleton • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинний • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • defense response to virus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7728	69930
Ensembl	ENSG00000105497	ENSMUSG00000012640
UniProt	Q9Y473	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_007147	NM_027264 NM_001357811 NM_001357812
RefSeq (білок)	NP_009078	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 51.57 – 51.59 Mb	Хр. 7: 42.95 – 42.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF175 (англ. Zinc finger protein 175) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 711 амінокислот, а молекулярна маса — 81 609.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPADVNLSQK		PQVLGPEKQD		GSCEASVSFE		DVTVDFSREE		WQQLDPAQRC
LYRDVMLELY		SHLFAVGYHI		PNPEVIFRML		KEKEPRVEEA		EVSHQRCQER
EFGLEIPQKE		ISKKASFQKD		MVGEFTRDGS		WCSILEELRL		DADRTKKDEQ
NQIQPMSHSA		FFNKKTLNTE		SNCEYKDPGK		MIRTRPHLAS		SQKQPQKCCL
FTESLKLNLE		VNGQNESNDT		EQLDDVVGSG		QLFSHSSSDA		CSKNIHTGET
FCKGNQCRKV		CGHKQSLKQH		QIHTQKKPDG		CSECGGSFTQ		KSHLFAQQRI
HSVGNLHECG		KCGKAFMPQL		KLSVYLTDHT		GDIPCICKEC		GKVFIQRSEL
LTHQKTHTRK		KPYKCHDCGK		AFFQMLSLFR		HQRTHSREKL		YECSECGKGF
SQNSTLIIHQ		KIHTGERQYA		CSECGKAFTQ		KSTLSLHQRI		HSGQKSYVCI
ECGQAFIQKA		HLIVHQRSHT		GEKPYQCHNC		GKSFISKSQL		DIHHRIHTGE
KPYECSDCGK		TFTQKSHLNI		HQKIHTGERH		HVCSECGKAF		NQKSILSMHQ
RIHTGEKPYK		CSECGKAFTS		KSQFKEHQRI		HTGEKPYVCT		ECGKAFNGRS
NFHKHQITHT		RERPFVCYKC		GKAFVQKSEL		ITHQRTHMGE		KPYECLDCGK
SFSKKPQLKV		HQRIHTGERP		YVCSECGKAF		NNRSNFNKHQ		TTHTRDKSYK
CSYSVKGFTK		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19