ZNF408

ZNF408
Ідентифікатори
Символи	ZNF408, EVR6, RP72, zinc finger protein 408
Зовнішні ІД	OMIM: 616454 MGI: 2685857 HomoloGene: 11687 GeneCards: ZNF408
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 72
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79797	381410
Ensembl	ENSG00000175213	ENSMUSG00000075040
UniProt	Q9H9D4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_024741 NM_001184751	NM_001033451 NM_001347175
RefSeq (білок)	NP_001171680 NP_079017	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 46.7 – 46.71 Mb	Хр. 2: 91.47 – 91.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF408 (англ. Zinc finger protein 408) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 720 амінокислот, а молекулярна маса — 78 439.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEAEELLLE		GKKALQLARE		PRLGLDLGWN		PSGEGCTQGL		KDVPPEPTRD
ILALKSLPRG		LALGPSLAKE		QRLGVWCVGD		PLQPGLLWGP		LEEESASKEK
GEGVKPRQEE		NLSLGPWGDV		CACEQSSGWT		SLVQRGRLES		EGNVAPVRIS
ERLHLQVYQL		VLPGSELLLW		PQPSSEGPSL		TQPGLDKEAA		VAVVTEVESA
VQQEVASPGE		DAAEPCIDPG		SQSPSGIQAE		NMVSPGLKFP		TQDRISKDSQ
PLGPLLQDGD		VDEECPAQAQ		MPPELQSNSA		TQQDPDGSGA		SFSSSARGTQ
PHGYLAKKLH		SPSDQCPPRA		KTPEPGAQQS		GFPTLSRSPP		GPAGSSPKQG
RRYRCGECGK		AFLQLCHLKK		HAFVHTGHKP		FLCTECGKSY		SSEESFKAHM
LGHRGVRPFP		CPQCDKAYGT		QRDLKEHQVV		HSGARPFACD		QCGKAFARRP
SLRLHRKTHQ		VPAAPAPCPC		PVCGRPLANQ		GSLRNHMRLH		TGEKPFLCPH
CGRAFRQRGN		LRGHLRLHTG		ERPYRCPHCA		DAFPQLPELR		RHLISHTGEA
HLCPVCGKAL		RDPHTLRAHE		RLHSGERPFP		CPQCGRAYTL		ATKLRRHLKS
HLEDKPYRCP		TCGMGYTLPQ		SLRRHQLSHR		PEAPCSPPSV		PSAASEPTVV
LLQAEPQLLD		THREEEVSPA		RDVVEVTISE		SQEKCFVVPE		EPDAAPSLVL
IHKDMGLGAW		AEVVEVEMGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11