ZNF618

ZNF618
Ідентифікатори
Символи	ZNF618, FP13169, NEDD10, zinc finger protein 618
Зовнішні ІД	OMIM: 617077 MGI: 1919950 HomoloGene: 18975 GeneCards: ZNF618
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114991	72701
Ensembl	ENSG00000157657	ENSMUSG00000028358
UniProt	Q5T7W0	Q80YY7
RefSeq (мРНК)	NM_001040063 NM_133374 NM_001318040 NM_001318041 NM_001318042	NM_028326 NM_001369113 NM_001369114 NM_001369115 NM_001369116 NM_001369117 NM_001369118 NM_001369119 NM_028327
RefSeq (білок)	NP_001304969 NP_001304970 NP_001304971 NP_588615	NP_082602 NP_001356042 NP_001356043 NP_001356044 NP_001356045 NP_001356046 NP_001356047 NP_001356048 NP_082603
Локус (UCSC)	Хр. 9: 113.88 – 114.06 Mb	Хр. 4: 62.88 – 63.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF618 (англ. Zinc finger protein 618) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 954 амінокислот, а молекулярна маса — 104 956.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNQPGGAAAP		QADGASAAGR		KSTASRERLK		RSQKSTKVEG		PEPVPAEASL
SAEQGTMTEV		KVKTELPDDY		IQEVIWQGEA		KEEKKAVSKD		GTSDVPAEIC
VVIGGVRNQQ		TLDGKAPEGS		PHGGSVRSRY		SGTWIFDQAL		RYASGSYECG
ICGKKYKYYN		CFQTHVRAHR		DTEATSGEGA		SQSNNFRYTC		DICGKKYKYY
SCFQEHRDLH		AVDVFSVEGA		PENRADPFDQ		GVVATDEVKE		EPPEPFQKIG
PKTGNYTCEF		CGKQYKYYTP		YQEHVALHAP		ISTAPGWEPP		DDPDTGSECS
HPEVSPSPRF		VAAKTQTNQS		GKKAPASVVR		CATLLHRTPP		ATQTQTFRTP
NSGSPASKAT		AAESAFSRRV		EGKAQNHFEE		TNSSSQNSSE		PYTCGACGIQ
FQFYNNLLEH		MQSHAADNEN		NIASNQSRSP		PAVVEEKWKP		QAQRNSANNT
TTSGLTPNSM		IPEKERQNIA		ERLLRVMCAD		LGALSVVSGK		EFLKLAQTLV
DSGARYGAFS		VTEILGNFNT		LALKHLPRMY		NQVKVKVTCA		LGSNACLGIG
VTCHSQSVGP		DSCYILTAYQ		AEGNHIKSYV		LGVKGADIRD		SGDLVHHWVQ
NVLSEFVMSE		IRTVYVTDCR		VSTSAFSKAG		MCLRCSACAL		NSVVQSVLSK
RTLQARSMHE		VIELLNVCED		LAGSTGLAKE		TFGSLEETSP		PPCWNSVTDS
LLLVHERYEQ		ICEFYSRAKK		MNLIQSLNKH		LLSNLAAILT		PVKQAVIELS
NESQPTLQLV		LPTYVRLEKL		FTAKANDAGT		VSKLCHLFLE		ALKENFKVHP
AHKVAMILDP		QQKLRPVPPY		QHEEIIGKVC		ELINEVKESW		AEEADFEPAA
KKPRSAAVEN		PAAQEDDRLG		KNEVYDYLQE		PLFQATPDLF		QYWSCVTQKH
TKLAKLAFWL		LAVPAVGARS		GCVNMCEQAL		LIKRRRLLSP		EDMNKLMFLK
SNML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 9