ZNF93

ZNF93
Ідентифікатори
Символи	ZNF93, HPF34, HTF34, TF34, ZNF505, zinc finger protein 93
Зовнішні ІД	OMIM: 603975 MGI: 2664334 HomoloGene: 75311 GeneCards: ZNF93
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • zinc ion binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • внутрішньоклітинний Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transposon integration • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81931	431706
Ensembl	ENSG00000184635	ENSMUSG00000055341
UniProt	P35789	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001004126 NM_031218	NM_001003666
RefSeq (білок)	NP_112495	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 19.9 – 19.96 Mb	Хр. 13: 67.44 – 67.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF93 (англ. Zinc finger protein 93) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот, а молекулярна маса — 70 971.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPLQFRDVA		IEFSLEEWHC		LDTAQRNLYR		NVMLENYSNL		VFLGIVVSKP
DLIAHLEQGK		KPLTMKRHEM		VANPSVICSH		FAQDLWPEQN		IKDSFQKVIL
RRYEKRGHGN		LQLIKRCESV		DECKVHTGGY		NGLNQCSTTT		QSKVFQCDKY
GKVFHKFSNS		NRHNIRHTEK		KPFKCIECGK		AFNQFSTLIT		HKKIHTGEKP
YICEECGKAF		KYSSALNTHK		RIHTGEKPYK		CDKCDKAFIA		SSTLSKHEII
HTGKKPYKCE		ECGKAFNQSS		TLTKHKKIHT		GEKPYKCEEC		GKAFNQSSTL
TKHKKIHTGE		KPYVCEECGK		AFKYSRILTT		HKRIHTGEKP		YKCNKCGKAF
IASSTLSRHE		FIHMGKKHYK		CEECGKAFIW		SSVLTRHKRV		HTGEKPYKCE
ECGKAFKYSS		TLSSHKRSHT		GEKPYKCEEC		GKAFVASSTL		SKHEIIHTGK
KPYKCEECGK		AFNQSSSLTK		HKKIHTGEKP		YKCEECGKAF		NQSSSLTKHK
KIHTGEKPYK		CEECGKAFNQ		SSTLIKHKKI		HTREKPYKCE		ECGKAFHLST
HLTTHKILHT		GEKPYRCREC		GKAFNHSATL		SSHKKIHSGE		KPYECDKCGK
AFISPSSLSR		HEIIHTGEKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bellefroid E.J., Poncelet D.A., Lecocq P.J., Revelant O., Martial J.A. (1991). The evolutionarily conserved Kruppel-associated box domain defines a subfamily of eukaryotic multifingered proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 3608—3612. PMID 2023909 DOI:10.1073/pnas.88.9.3608

Див. також

• Хромосома 19