ZRANB3

ZRANB3
Ідентифікатори
Символи	ZRANB3, 4933425L19Rik, AH2, zinc finger RANBP2-type containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 615655 MGI: 1918362 HomoloGene: 32770 GeneCards: ZRANB3
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP-dependent DNA/DNA annealing activity • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0004003 DNA helicase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • nucleic acid binding • nuclease activity • endonuclease activity • endodeoxyribonuclease activity • hydrolase activity • ATP binding Клітинна компонента • nuclear replication fork • хромосома • клітинне ядро Біологічний процес • replication fork protection • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • cellular response to DNA damage stimulus • DNA rewinding • replication fork processing • negative regulation of DNA recombination • обмін речовин • response to UV • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA duplex unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84083	226409
Ensembl	ENSG00000121988	ENSMUSG00000036086
UniProt	Q5FWF4	Q6NZP1
RefSeq (мРНК)	NM_001286568 NM_001286569 NM_032143	NM_001285945 NM_027678 NM_001357573
RefSeq (білок)	NP_001273497 NP_001273498 NP_115519	NP_001272874 NP_081954 NP_001344502
Локус (UCSC)	Хр. 2: 135.14 – 135.53 Mb	Хр. 1: 127.88 – 128.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZRANB3 (англ. Zinc finger RANBP2-type containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 079 амінокислот, а молекулярна маса — 123 248.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRVHNIKKS		LTPHISCVTN		ESDNLLDFLP		DRLRAKLLPF		QKDGIIFALK
RNGRCMVADE		MGLGKTIQAI		GITYFYKEEW		PLLIVVPSSL		RYPWTEEIEK
WIPELSPEEI		NVIQNKTDVR		RMSTSKVTVL		GYGLLTADAK		TLIDALNNQN
FKVVIVDESH		YMKSRNATRS		RILLPIVQKA		RRAILLTGTP		ALGRPEELFM
QIEALFPQKF		GRWTDYAKRY		CNAHIRYFGK		RPQWDCRGAS		NLNELHQLLS
DIMIRRLKTE		VLTQLPPKVR		QRIPFDLPSA		AAKELNTSFE		EWEKIMRTPN
SGAMETVMGL		ITRMFKQTAI		AKAGAVKDYI		KMMLQNDSLK		FLVFAHHLSM
LQACTEAVIE		NKTRYIRIDG		SVSSSERIHL		VNQFQKDPDT		RVAILSIQAA
GQGLTFTAAS		HVVFAELYWD		PGHIKQAEDR		AHRIGQCSSV		NIHYLIANGT
LDTLMWGMLN		RKAQVTGSTL		NGRKEKIQAE		EGDKEKWDFL		QFAEAWTPND
SSEELRKEAL		FTHFEKEKQH		DIRSFFVPQP		KKRQLMTSCD		ESKRFREENT
VVSSDPTKTA		ARDIIDYESD		VEPETKRLKL		AASEDHCSPS		EETPSQSKQI
RTPLVESVQE		AKAQLTTPAF		PVEGWQCSLC		TYINNSELPY		CEMCETPQGS
AVMQIDSLNH		IQDKNEKDDS		QKDTSKKVQT		ISDCEKQALA		QSEPGQLADS
KEETPKIEKE		DGLTSQPGNE		QWKSSDTLPV		YDTLMFCASR		NTDRIHIYTK
DGKQMSCNFI		PLDIKLDLWE		DLPASFQLKQ		YRSLILRFVR		EWSSLTAMKQ
RIIRKSGQLF		CSPILALEEI		TKQQTKQNCT		KRYITKEDVA		VASMDKVKNV
GGHVRLITKE		SRPRDPFTKK		LLEDGACVPF		LNPYTVQADL		TVKPSTSKGY
LQAVDNEGNP		LCLRCQQPTC		QTKQACKANS		WDSRFCSLKC		QEEFWIRSNN
SYLRAKVFET		EHGVCQLCNV		NAQELFLRLR		DAPKSQRKNL		LYATWTSKLP
LEQLNEMIRN		PGEGHFWQVD		HIKPVYGGGG		QCSLDNLQTL		CTVCHKERTA
RQAKERSQVR		RQSLASKHGS		DITRFLVKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yusufzai T., Kadonaga J.T. (2010). Annealing helicase 2 (AH2), a DNA-rewinding motor with an HNH motif. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 20970—20973. PMID 21078962 DOI:10.1073/pnas.1011196107
• Weston R., Peeters H., Ahel D. (2012). ZRANB3 is a structure-specific ATP-dependent endonuclease involved in replication stress response. Genes Dev. 26: 1558—1572. PMID 22759634 DOI:10.1101/gad.193516.112
• Yuan J., Ghosal G., Chen J. (2012). The HARP-like domain-containing protein AH2/ZRANB3 binds to PCNA and participates in cellular response to replication stress. Mol. Cell. 47: 410—421. PMID 22705370 DOI:10.1016/j.molcel.2012.05.025
• Badu-Nkansah A., Mason A.C., Eichman B.F., Cortez D. (2016). Identification of a substrate recognition domain in the replication stress response protein zinc finger Ran-binding domain-containing protein 3 (ZRANB3). J. Biol. Chem. 291: 8251—8257. PMID 26884333 DOI:10.1074/jbc.M115.709733

Див. також

• Хромосома 2