ZSCAN21

ZSCAN21
Ідентифікатори
Символи	ZSCAN21, NY-REN-21, ZNF38, Zipro1, zinc finger and SCAN domain containing 21
Зовнішні ІД	OMIM: 601261 MGI: 99182 HomoloGene: 56530 GeneCards: ZSCAN21
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7589	22697
Ensembl	ENSG00000166529	ENSMUSG00000037017
UniProt	Q9Y5A6	Q07231
RefSeq (мРНК)	NM_145914 NM_001362779 NM_001362780 NM_001362781	NM_001044703 NM_001044704 NM_001044705 NM_011757
RefSeq (білок)	NP_666019 NP_001349708 NP_001349709 NP_001349710	NP_001038168 NP_001038169 NP_001038170 NP_035887
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.05 – 100.07 Mb	Хр. 5: 138.12 – 138.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZSCAN21 (англ. Zinc finger and SCAN domain containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 658.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMTKVLGMAP		VLGPRPPQEQ		VGPLMVKVEE		KEEKGKYLPS		LEMFRQRFRQ
FGYHDTPGPR		EALSQLRVLC		CEWLRPEIHT		KEQILELLVL		EQFLTILPQE
LQAWVQEHCP		ESAEEAVTLL		EDLERELDEP		GHQVSTPPNE		QKPVWEKISS
SGTAKESPSS		MQPQPLETSH		KYESWGPLYI		QESGEEQEFA		QDPRKVRDCR
LSTQHEESAD		EQKGSEAEGL		KGDIISVIIA		NKPEASLERQ		CVNLENEKGT
KPPLQEAGSK		KGRESVPTKP		TPGERRYICA		ECGKAFSNSS		NLTKHRRTHT
GEKPYVCTKC		GKAFSHSSNL		TLHYRTHLVD		RPYDCKCGKA		FGQSSDLLKH
QRMHTEEAPY		QCKDCGKAFS		GKGSLIRHYR		IHTGEKPYQC		NECGKSFSQH
AGLSSHQRLH		TGEKPYKCKE		CGKAFNHSSN		FNKHHRIHTG		EKPYWCHHCG
KTFCSKSNLS		KHQRVHTGEG		EAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7