ZXDC

ZXDC
Ідентифікатори
Символи	ZXDC, ZXDL, ZXD family zinc finger C
Зовнішні ІД	OMIM: 615746 MGI: 1933108 HomoloGene: 82340 GeneCards: ZXDC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • LRR domain binding • C2H2 zinc finger domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • компонент клітини Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79364	80292
Ensembl	ENSG00000070476	ENSMUSG00000034430
UniProt	Q2QGD7	Q8C8V1
RefSeq (мРНК)	NM_001040653 NM_025112	NM_030260 NM_173002
RefSeq (білок)	NP_001035743 NP_079388	NP_084536 NP_766590
Локус (UCSC)	Хр. 3: 126.44 – 126.48 Mb	Хр. 6: 90.35 – 90.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZXDC (англ. ZXD family zinc finger C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 89 988.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLPALLPAP		TARGGQHGGG		PGPLRRAPAP		LGASPARRRL		LLVRGPEDGG
PGARPGEASG		PSPPPAEDDS		DGDSFLVLLE		VPHGGAAAEA		AGSQEAEPGS
RVNLASRPEQ		GPSGPAAPPG		PGVAPAGAVT		ISSQDLLVRL		DRGVLALSAP
PGPATAGAAA		PRRAPQASGP		STPGYRCPEP		QCALAFAKKH		QLKVHLLTHG
GGQGRRPFKC		PLEGCGWAFT		TSYKLKRHLQ		SHDKLRPFGC		PVGGCGKKFT
TVYNLKAHMK		GHEQESLFKC		EVCAERFPTH		AKLSSHQRSH		FEPERPYKCD
FPGCEKTFIT		VSALFSHNRA		HFREQELFSC		SFPGCSKQYD		KACRLKIHLR
SHTGERPFIC		DSDSCGWTFT		SMSKLLRHRR		KHDDDRRFTC		PVEGCGKSFT
RAEHLKGHSI		THLGTKPFEC		PVEGCCARFS		ARSSLYIHSK		KHVQDVGAPK
SRCPVSTCNR		LFTSKHSMKA		HMVRQHSRRQ		DLLPQLEAPS		SLTPSSELSS
PGQSELTNMD		LAALFSDTPA		NASGSAGGSD		EALNSGILTI		DVTSVSSSLG
GNLPANNSSL		GPMEPLVLVA		HSDIPPSLDS		PLVLGTAATV		LQQGSFSVDD
VQTVSAGALG		CLVALPMKNL		SDDPLALTSN		SNLAAHITTP		TSSSTPRENA
SVPELLAPIK		VEPDSPSRPG		AVGQQEGSHG		LPQSTLPSPA		EQHGAQDTEL
SAGTGNFYLE		SGGSARTDYR		AIQLAKEKKQ		RGAGSNAGAS		QSTQRKIKEG
KMSPPHFHAS		QNSWLCGSLV		VPSGGRPGPA		PAAGVQCGAQ		GVQVQLVQDD
PSGEGVLPSA		RGPATFLPFL		TVDLPVYVLQ		EVLPSSGGPA		GPEATQFPGS
TINLQDLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Aleksandrova A., Galkin O., Koneni R., Fontes J.D. (2010). An N- and C-terminal truncated isoform of zinc finger X-linked duplicated C protein represses MHC class II transcription. Mol. Cell. Biochem. 337: 1—7. PMID 19777325 DOI:10.1007/s11010-009-0280-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jambunathan S., Fontes J.D. (2007). Sumoylation of the zinc finger protein ZXDC enhances the function of its transcriptional activation domain. Biol. Chem. 388: 965—972. PMID 17696781 DOI:10.1515/BC.2007.106

Див. також

• Хромосома 3