EEF1A2

EEF1A2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4C0S, 3C5J
Ідентифікатори
Символи	EEF1A2, EEF1AL, EF-1-alpha-2, EF1A, HS1, STN, STNL, EIEE33, MRD38, eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2, DEE33
Зовнішні ІД	OMIM: 602959 MGI: 1096317 HomoloGene: 121568 GeneCards: EEF1A2
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 38, undetermined early-onset epileptic encephalopathy
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • translation factor activity, RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • GO:0006184 GTPase activity • translation elongation factor activity Клітинна компонента • myelin sheath • neuronal cell body • cytoplasmic side of lysosomal membrane • клітинне ядро • eukaryotic translation elongation factor 1 complex • цитоплазма • синапс Біологічний процес • positive regulation of apoptotic process • regulation of chaperone-mediated autophagy • translational elongation • positive regulation of lipid kinase activity • response to electrical stimulus • Біосинтез білків • response to inorganic substance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1917	13628
Ensembl	ENSG00000101210	ENSMUSG00000016349
UniProt	Q05639	P62631
RefSeq (мРНК)	NM_001958	NM_007906
RefSeq (білок)	NP_001949	NP_031932
Локус (UCSC)	Хр. 20: 63.49 – 63.5 Mb	Хр. 2: 180.79 – 180.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EEF1A2 (англ. Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 470.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKEKTHINI		VVIGHVDSGK		STTTGHLIYK		CGGIDKRTIE		KFEKEAAEMG
KGSFKYAWVL		DKLKAERERG		ITIDISLWKF		ETTKYYITII		DAPGHRDFIK
NMITGTSQAD		CAVLIVAAGV		GEFEAGISKN		GQTREHALLA		YTLGVKQLIV
GVNKMDSTEP		AYSEKRYDEI		VKEVSAYIKK		IGYNPATVPF		VPISGWHGDN
MLEPSPNMPW		FKGWKVERKE		GNASGVSLLE		ALDTILPPTR		PTDKPLRLPL
QDVYKIGGIG		TVPVGRVETG		ILRPGMVVTF		APVNITTEVK		SVEMHHEALS
EALPGDNVGF		NVKNVSVKDI		RRGNVCGDSK		SDPPQEAAQF		TSQVIILNHP
GQISAGYSPV		IDCHTAHIAC		KFAELKEKID		RRSGKKLEDN		PKSLKSGDAA
IVEMVPGKPM		CVESFSQYPP		LGRFAVRDMR		QTVAVGVIKN		VEKKSGGAGK
VTKSAQKAQK		AGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів елонгації. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

• Knudsen S.M., Frydenberg J., Clark B.F.C., Leffers H. (1993). Tissue-dependent variation in the expression of elongation factor-1 alpha isoforms: isolation and characterisation of a cDNA encoding a novel variant of human elongation-factor 1 alpha. Eur. J. Biochem. 215: 549—554. PMID 8354261 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb18064.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee S., Ann D.K., Wang E. (1994). Cloning of human and mouse brain cDNAs coding for S1, the second member of the mammalian elongation factor-1 alpha gene family: analysis of a possible evolutionary pathway. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1371—1377. PMID 7945283 DOI:10.1006/bbrc.1994.2336
• Dai S., Crawford F., Marrack P., Kappler J.W. (2008). The structure of HLA-DR52c: comparison to other HLA-DRB3 alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 11893—11897. PMID 18697946 DOI:10.1073/pnas.0805810105

Див. також

• Хромосома 20