EIF6

EIF6
Ідентифікатори
Символи	EIF6, CAB, EIF3A, ITGB4BP, b(2)gcn, eIF-6, p27(BBP), p27BBP, eukaryotic translation initiation factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602912 MGI: 1196288 HomoloGene: 7135 GeneCards: EIF6
Онтологія гена Молекулярна функція • ribosome binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor activity • ribosomal large subunit binding Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • гіалоплазма • preribosome, large subunit precursor • lamin filament • Проміжні філаменти Біологічний процес • translational initiation • mature ribosome assembly • Біосинтез білків • ribosome biogenesis • response to insulin • maturation of LSU-rRNA • gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • assembly of large subunit precursor of preribosome • maturation of 5.8S rRNA • regulation of fatty acid biosynthetic process • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • positive regulation of translation • regulation of megakaryocyte differentiation • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • ribosomal subunit export from nucleus • ribosomal large subunit biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3692	16418
Ensembl	ENSG00000242372	ENSMUSG00000027613
UniProt	P56537	O55135
RefSeq (мРНК)	NM_001267810 NM_002212 NM_181466 NM_181467 NM_181468 NM_181469	NM_010579
RefSeq (білок)	NP_001254739 NP_002203 NP_852131 NP_852133	NP_034709
Локус (UCSC)	Хр. 20: 35.28 – 35.28 Mb	Хр. 2: 155.66 – 155.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF6 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 245 амінокислот, а молекулярна маса — 26 599.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVRASFENN		CEIGCFAKLT		NTYCLVAIGG		SENFYSVFEG		ELSDTIPVVH
ASIAGCRIIG		RMCVGNRHGL		LVPNNTTDQE		LQHIRNSLPD		TVQIRRVEER
LSALGNVTTC		NDYVALVHPD		LDRETEEILA		DVLKVEVFRQ		TVADQVLVGS
YCVFSNQGGL		VHPKTSIEDQ		DELSSLLQVP		LVAGTVNRGS		EVIAAGMVVN
DWCAFCGLDT		TSTELSVVES		VFKLNEAQPS		TIATSMRDSL		IDSLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів ініціації. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, біогенез рибосом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Si K., Chaudhuri J., Chevesich J., Maitra U. (1997). Molecular cloning and functional expression of a human cDNA encoding translation initiation factor 6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 14285—14290. PMID 9405604 DOI:10.1073/pnas.94.26.14285
• Donadini A., Giodini A., Sanvito F., Marchisio P.C., Biffo S. (2001). The human ITGB4BP gene is constitutively expressed in vitro, but highly modulated in vivo. Gene. 266: 35—43. PMID 11290417 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00370-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Basu U., Si K., Deng H., Maitra U. (2003). Phosphorylation of mammalian eukaryotic translation initiation factor 6 and its Saccharomyces cerevisiae homologue Tif6p: evidence that phosphorylation of Tif6p regulates its nucleocytoplasmic distribution and is required for yeast cell growth. Mol. Cell. Biol. 23: 6187—6199. PMID 12917340 DOI:10.1128/MCB.23.17.6187-6199.2003

Див. також

• Хромосома 20