SPEN
SPEN (англ. Spen family transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 664 амінокислот, а молекулярна маса — 402 248[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVRETRHLWV | GNLPENVREE | KIIEHFKRYG | RVESVKILPK | RGSEGGVAAF | ||||
VDFVDIKSAQ | KAHNSVNKMG | DRDLRTDYNE | PGTIPSAARG | LDDTVSIASR | ||||
SREVSGFRGG | GGGPAYGPPP | SLHAREGRYE | RRLDGASDNR | ERAYEHSAYG | ||||
HHERGTGGFD | RTRHYDQDYY | RDPRERTLQH | GLYYASRSRS | PNRFDAHDPR | ||||
YEPRAREQFT | LPSVVHRDIY | RDDITREVRG | RRPERNYQHS | RSRSPHSSQS | ||||
RNQSPQRLAS | QASRPTRSPS | GSGSRSRSSS | SDSISSSSST | SSDSSDSSSS | ||||
SSDDSPARSV | QSAAVPAPTS | QLLSSLEKDE | PRKSFGIKVQ | NLPVRSTDTS | ||||
LKDGLFHEFK | KFGKVTSVQI | HGTSEERYGL | VFFRQQEDQE | KALTASKGKL | ||||
FFGMQIEVTA | WIGPETESEN | EFRPLDERID | EFHPKATRTL | FIGNLEKTTT | ||||
YHDLRNIFQR | FGEIVDIDIK | KVNGVPQYAF | LQYCDIASVC | KAIKKMDGEY | ||||
LGNNRLKLGF | GKSMPTNCVW | LDGLSSNVSD | QYLTRHFCRY | GPVVKVVFDR | ||||
LKGMALVLYN | EIEYAQAAVK | ETKGRKIGGN | KIKVDFANRE | SQLAFYHCME | ||||
KSGQDIRDFY | EMLAERREER | RASYDYNQDR | TYYESVRTPG | TYPEDSRRDY | ||||
PARGREFYSE | WETYQGDYYE | SRYYDDPREY | RDYRNDPYEQ | DIREYSYRQR | ||||
ERERERERFE | SDRDRDHERR | PIERSQSPVH | LRRPQSPGAS | PSQAERLPSD | ||||
SERRLYSRSS | DRSGSCSSLS | PPRYEKLDKS | RLERYTKNEK | TDKERTFDPE | ||||
RVERERRLIR | KEKVEKDKTD | KQKRKGKVHS | PSSQSSETDQ | ENEREQSPEK | ||||
PRSCNKLSRE | KADKEGIAKN | RLELMPCVVL | TRVKEKEGKV | IDHTPVEKLK | ||||
AKLDNDTVKS | SALDQKLQVS | QTEPAKSDLS | KLESVRMKVP | KEKGLSSHVE | ||||
VVEKEGRLKA | RKHLKPEQPA | DGVSAVDLEK | LEARKRRFAD | SNLKAEKQKP | ||||
EVKKSSPEME | DARVLSKKQP | DVSSREVILL | REGEAERKPV | RKEILKRESK | ||||
KIKLDRLNTV | ASPKDCQELA | SISVGSGSRP | SSDLQARLGE | LAGESVENQE | ||||
VQSKKPIPSK | PQLKQLQVLD | DQGPEREDVR | KNYCSLRDET | PERKSGQEKS | ||||
HSVNTEEKIG | IDIDHTQSYR | KQMEQSRRKQ | QMEMEIAKSE | KFGSPKKDVD | ||||
EYERRSLVHE | VGKPPQDVTD | DSPPSKKKRM | DHVDFDICTK | RERNYRSSRQ | ||||
ISEDSERTGG | SPSVRHGSFH | EDEDPIGSPR | LLSVKGSPKV | DEKVLPYSNI | ||||
TVREESLKFN | PYDSSRREQM | ADMAKIKLSV | LNSEDELNRW | DSQMKQDAGR | ||||
FDVSFPNSII | KRDSLRKRSV | RDLEPGEVPS | DSDEDGEHKS | HSPRASALYE | ||||
SSRLSFLLRD | REDKLRERDE | RLSSSLERNK | FYSFALDKTI | TPDTKALLER | ||||
AKSLSSSREE | NWSFLDWDSR | FANFRNNKDK | EKVDSAPRPI | PSWYMKKKKI | ||||
RTDSEGKMDD | KKEDHKEEEQ | ERQELFASRF | LHSSIFEQDS | KRLQHLERKE | ||||
EDSDFISGRI | YGKQTSEGAN | STTDSIQEPV | VLFHSRFMEL | TRMQQKEKEK | ||||
DQKPKEVEKQ | EDTENHPKTP | ESAPENKDSE | LKTPPSVGPP | SVTVVTLESA | ||||
PSALEKTTGD | KTVEAPLVTE | EKTVEPATVS | EEAKPASEPA | PAPVEQLEQV | ||||
DLPPGADPDK | EAAMMPAGVE | EGSSGDQPPY | LDAKPPTPGA | SFSQAESNVD | ||||
PEPDSTQPLS | KPAQKSEEAN | EPKAEKPDAT | ADAEPDANQK | AEAAPESQPP | ||||
ASEDLEVDPP | VAAKDKKPNK | SKRSKTPVQA | AAVSIVEKPV | TRKSERIDRE | ||||
KLKRSNSPRG | EAQKLLELKM | EAEKITRTAS | KNSAADLEHP | EPSLPLSRTR | ||||
RRNVRSVYAT | MGDHENRSPV | KEPVEQPRVT | RKRLERELQE | AAAVPTTPRR | ||||
GRPPKTRRRA | DEEEENEAKE | PAETLKPPEG | WRSPRSQKTA | AGGGPQGKKG | ||||
KNEPKVDATR | PEATTEVGPQ | IGVKESSMEP | KAAEEEAGSE | QKRDRKDAGT | ||||
DKNPPETAPV | EVVEKKPAPE | KNSKSKRGRS | RNSRLAVDKS | ASLKNVDAAV | ||||
SPRGAAAQAG | ERESGVVAVS | PEKSESPQKE | DGLSSQLKSD | PVDPDKEPEK | ||||
EDVSASGPSP | EATQLAKQME | LEQAVEHIAK | LAEASASAAY | KADAPEGLAP | ||||
EDRDKPAHQA | SETELAAAIG | SIINDISGEP | ENFPAPPPYP | GESQTDLQPP | ||||
AGAQALQPSE | EGMETDEAVS | GILETEAATE | SSRPPVNAPD | PSAGPTDTKE | ||||
ARGNSSETSH | SVPEAKGSKE | VEVTLVRKDK | GRQKTTRSRR | KRNTNKKVVA | ||||
PVESHVPESN | QAQGESPAAN | EGTTVQHPEA | PQEEKQSEKP | HSTPPQSCTS | ||||
DLSKIPSTEN | SSQEISVEER | TPTKASVPPD | LPPPPQPAPV | DEEPQARFRV | ||||
HSIIESDPVT | PPSDPSIPIP | TLPSVTAAKL | SPPVASGGIP | HQSPPTKVTE | ||||
WITRQEEPRA | QSTPSPALPP | DTKASDVDTS | SSTLRKILMD | PKYVSATSVT | ||||
STSVTTAIAE | PVSAAPCLHE | APPPPVDSKK | PLEEKTAPPV | TNNSEIQASE | ||||
VLVAADKEKV | APVIAPKITS | VISRMPVSID | LENSQKITLA | KPAPQTLTGL | ||||
VSALTGLVNV | SLVPVNALKG | PVKGSVTTLK | SLVSTPAGPV | NVLKGPVNVL | ||||
TGPVNVLTTP | VNATVGTVNA | APGTVNAAAS | AVNATASAVT | VTAGAVTAAS | ||||
GGVTATTGTV | TMAGAVIAPS | TKCKQRASAN | ENSRFHPGSM | PVIDDRPADA | ||||
GSGAGLRVNT | SEGVVLLSYS | GQKTEGPQRI | SAKISQIPPA | SAMDIEFQQS | ||||
VSKSQVKPDS | VTASQPPSKG | PQAPAGYANV | ATHSTLVLTA | QTYNASPVIS | ||||
SVKADRPSLE | KPEPIHLSVS | TPVTQGGTVK | VLTQGINTPP | VLVHNQLVLT | ||||
PSIVTTNKKL | ADPVTLKIET | KVLQPANLGS | TLTPHHPPAL | PSKLPTEVNH | ||||
VPSGPSIPAD | RTVSHLAAAK | LDAHSPRPSG | PGPSSFPRAS | HPSSTASTAL | ||||
STNATVMLAA | GIPVPQFISS | IHPEQSVIMP | PHSITQTVSL | SHLSQGEVRM | ||||
NTPTLPSITY | SIRPEALHSP | RAPLQPQQIE | VRAPQRASTP | QPAPAGVPAL | ||||
ASQHPPEEEV | HYHLPVARAT | APVQSEVLVM | QSEYRLHPYT | VPRDVRIMVH | ||||
PHVTAVSEQP | RAADGVVKVP | PASKAPQQPG | KEAAKTPDAK | AAPTPTPAPV | ||||
PVPVPLPAPA | PAPHGEARIL | TVTPSNQLQG | LPLTPPVVVT | HGVQIVHSSG | ||||
ELFQEYRYGD | IRTYHPPAQL | THTQFPAASS | VGLPSRTKTA | AQGPPPEGEP | ||||
LQPPQPVQST | QPAQPAPPCP | PSQLGQPGQP | PSSKMPQVSQ | EAKGTQTGVE | ||||
QPRLPAGPAN | RPPEPHTQVQ | RAQAETGPTS | FPSPVSVSMK | PDLPVSLPTQ | ||||
TAPKQPLFVP | TTSGPSTPPG | LVLPHTEFQP | APKQDSSPHL | TSQRPVDMVQ | ||||
LLKKYPIVWQ | GLLALKNDTA | AVQLHFVSGN | NVLAHRSLPL | SEGGPPLRIA | ||||
QRMRLEATQL | EGVARRMTVE | TDYCLLLALP | CGRDQEDVVS | QTESLKAAFI | ||||
TYLQAKQAAG | IINVPNPGSN | QPAYVLQIFP | PCEFSESHLS | RLAPDLLASI | ||||
SNISPHLMIV | IASV |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Shi Y., Hon M., Evans R.M. (2002). The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 2613—2618. PMID 11867749 DOI:10.1073/pnas.052707099
- Ariyoshi M., Schwabe J.W.R. (2003). A conserved structural motif reveals the essential transcriptional repression function of Spen proteins and their role in developmental signaling. Genes Dev. 17: 1909—1920. PMID 12897056 DOI:10.1101/gad.266203
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17575 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q96T58 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
![]() |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |