SPEN

SPEN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OW1, 2RT5, 4P6Q
Ідентифікатори
Символи	SPEN, HIAA0929, MINT, RBM15C, SHARP, spen family transcriptional repressor, RATARS
Зовнішні ІД	OMIM: 613484 MGI: 1891706 HomoloGene: 124461 GeneCards: SPEN
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • transcription repressor complex • екзосома • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • positive regulation of neurogenesis • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23013	56381
Ensembl	ENSG00000065526	ENSMUSG00000040761
UniProt	Q96T58	Q62504
RefSeq (мРНК)	NM_015001	NM_019763 NM_001347235
RefSeq (білок)	NP_055816	NP_001334164 NP_062737
Локус (UCSC)	Хр. 1: 15.84 – 15.94 Mb	Хр. 4: 141.2 – 141.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPEN (англ. Spen family transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 664 амінокислот, а молекулярна маса — 402 248.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRETRHLWV		GNLPENVREE		KIIEHFKRYG		RVESVKILPK		RGSEGGVAAF
VDFVDIKSAQ		KAHNSVNKMG		DRDLRTDYNE		PGTIPSAARG		LDDTVSIASR
SREVSGFRGG		GGGPAYGPPP		SLHAREGRYE		RRLDGASDNR		ERAYEHSAYG
HHERGTGGFD		RTRHYDQDYY		RDPRERTLQH		GLYYASRSRS		PNRFDAHDPR
YEPRAREQFT		LPSVVHRDIY		RDDITREVRG		RRPERNYQHS		RSRSPHSSQS
RNQSPQRLAS		QASRPTRSPS		GSGSRSRSSS		SDSISSSSST		SSDSSDSSSS
SSDDSPARSV		QSAAVPAPTS		QLLSSLEKDE		PRKSFGIKVQ		NLPVRSTDTS
LKDGLFHEFK		KFGKVTSVQI		HGTSEERYGL		VFFRQQEDQE		KALTASKGKL
FFGMQIEVTA		WIGPETESEN		EFRPLDERID		EFHPKATRTL		FIGNLEKTTT
YHDLRNIFQR		FGEIVDIDIK		KVNGVPQYAF		LQYCDIASVC		KAIKKMDGEY
LGNNRLKLGF		GKSMPTNCVW		LDGLSSNVSD		QYLTRHFCRY		GPVVKVVFDR
LKGMALVLYN		EIEYAQAAVK		ETKGRKIGGN		KIKVDFANRE		SQLAFYHCME
KSGQDIRDFY		EMLAERREER		RASYDYNQDR		TYYESVRTPG		TYPEDSRRDY
PARGREFYSE		WETYQGDYYE		SRYYDDPREY		RDYRNDPYEQ		DIREYSYRQR
ERERERERFE		SDRDRDHERR		PIERSQSPVH		LRRPQSPGAS		PSQAERLPSD
SERRLYSRSS		DRSGSCSSLS		PPRYEKLDKS		RLERYTKNEK		TDKERTFDPE
RVERERRLIR		KEKVEKDKTD		KQKRKGKVHS		PSSQSSETDQ		ENEREQSPEK
PRSCNKLSRE		KADKEGIAKN		RLELMPCVVL		TRVKEKEGKV		IDHTPVEKLK
AKLDNDTVKS		SALDQKLQVS		QTEPAKSDLS		KLESVRMKVP		KEKGLSSHVE
VVEKEGRLKA		RKHLKPEQPA		DGVSAVDLEK		LEARKRRFAD		SNLKAEKQKP
EVKKSSPEME		DARVLSKKQP		DVSSREVILL		REGEAERKPV		RKEILKRESK
KIKLDRLNTV		ASPKDCQELA		SISVGSGSRP		SSDLQARLGE		LAGESVENQE
VQSKKPIPSK		PQLKQLQVLD		DQGPEREDVR		KNYCSLRDET		PERKSGQEKS
HSVNTEEKIG		IDIDHTQSYR		KQMEQSRRKQ		QMEMEIAKSE		KFGSPKKDVD
EYERRSLVHE		VGKPPQDVTD		DSPPSKKKRM		DHVDFDICTK		RERNYRSSRQ
ISEDSERTGG		SPSVRHGSFH		EDEDPIGSPR		LLSVKGSPKV		DEKVLPYSNI
TVREESLKFN		PYDSSRREQM		ADMAKIKLSV		LNSEDELNRW		DSQMKQDAGR
FDVSFPNSII		KRDSLRKRSV		RDLEPGEVPS		DSDEDGEHKS		HSPRASALYE
SSRLSFLLRD		REDKLRERDE		RLSSSLERNK		FYSFALDKTI		TPDTKALLER
AKSLSSSREE		NWSFLDWDSR		FANFRNNKDK		EKVDSAPRPI		PSWYMKKKKI
RTDSEGKMDD		KKEDHKEEEQ		ERQELFASRF		LHSSIFEQDS		KRLQHLERKE
EDSDFISGRI		YGKQTSEGAN		STTDSIQEPV		VLFHSRFMEL		TRMQQKEKEK
DQKPKEVEKQ		EDTENHPKTP		ESAPENKDSE		LKTPPSVGPP		SVTVVTLESA
PSALEKTTGD		KTVEAPLVTE		EKTVEPATVS		EEAKPASEPA		PAPVEQLEQV
DLPPGADPDK		EAAMMPAGVE		EGSSGDQPPY		LDAKPPTPGA		SFSQAESNVD
PEPDSTQPLS		KPAQKSEEAN		EPKAEKPDAT		ADAEPDANQK		AEAAPESQPP
ASEDLEVDPP		VAAKDKKPNK		SKRSKTPVQA		AAVSIVEKPV		TRKSERIDRE
KLKRSNSPRG		EAQKLLELKM		EAEKITRTAS		KNSAADLEHP		EPSLPLSRTR
RRNVRSVYAT		MGDHENRSPV		KEPVEQPRVT		RKRLERELQE		AAAVPTTPRR
GRPPKTRRRA		DEEEENEAKE		PAETLKPPEG		WRSPRSQKTA		AGGGPQGKKG
KNEPKVDATR		PEATTEVGPQ		IGVKESSMEP		KAAEEEAGSE		QKRDRKDAGT
DKNPPETAPV		EVVEKKPAPE		KNSKSKRGRS		RNSRLAVDKS		ASLKNVDAAV
SPRGAAAQAG		ERESGVVAVS		PEKSESPQKE		DGLSSQLKSD		PVDPDKEPEK
EDVSASGPSP		EATQLAKQME		LEQAVEHIAK		LAEASASAAY		KADAPEGLAP
EDRDKPAHQA		SETELAAAIG		SIINDISGEP		ENFPAPPPYP		GESQTDLQPP
AGAQALQPSE		EGMETDEAVS		GILETEAATE		SSRPPVNAPD		PSAGPTDTKE
ARGNSSETSH		SVPEAKGSKE		VEVTLVRKDK		GRQKTTRSRR		KRNTNKKVVA
PVESHVPESN		QAQGESPAAN		EGTTVQHPEA		PQEEKQSEKP		HSTPPQSCTS
DLSKIPSTEN		SSQEISVEER		TPTKASVPPD		LPPPPQPAPV		DEEPQARFRV
HSIIESDPVT		PPSDPSIPIP		TLPSVTAAKL		SPPVASGGIP		HQSPPTKVTE
WITRQEEPRA		QSTPSPALPP		DTKASDVDTS		SSTLRKILMD		PKYVSATSVT
STSVTTAIAE		PVSAAPCLHE		APPPPVDSKK		PLEEKTAPPV		TNNSEIQASE
VLVAADKEKV		APVIAPKITS		VISRMPVSID		LENSQKITLA		KPAPQTLTGL
VSALTGLVNV		SLVPVNALKG		PVKGSVTTLK		SLVSTPAGPV		NVLKGPVNVL
TGPVNVLTTP		VNATVGTVNA		APGTVNAAAS		AVNATASAVT		VTAGAVTAAS
GGVTATTGTV		TMAGAVIAPS		TKCKQRASAN		ENSRFHPGSM		PVIDDRPADA
GSGAGLRVNT		SEGVVLLSYS		GQKTEGPQRI		SAKISQIPPA		SAMDIEFQQS
VSKSQVKPDS		VTASQPPSKG		PQAPAGYANV		ATHSTLVLTA		QTYNASPVIS
SVKADRPSLE		KPEPIHLSVS		TPVTQGGTVK		VLTQGINTPP		VLVHNQLVLT
PSIVTTNKKL		ADPVTLKIET		KVLQPANLGS		TLTPHHPPAL		PSKLPTEVNH
VPSGPSIPAD		RTVSHLAAAK		LDAHSPRPSG		PGPSSFPRAS		HPSSTASTAL
STNATVMLAA		GIPVPQFISS		IHPEQSVIMP		PHSITQTVSL		SHLSQGEVRM
NTPTLPSITY		SIRPEALHSP		RAPLQPQQIE		VRAPQRASTP		QPAPAGVPAL
ASQHPPEEEV		HYHLPVARAT		APVQSEVLVM		QSEYRLHPYT		VPRDVRIMVH
PHVTAVSEQP		RAADGVVKVP		PASKAPQQPG		KEAAKTPDAK		AAPTPTPAPV
PVPVPLPAPA		PAPHGEARIL		TVTPSNQLQG		LPLTPPVVVT		HGVQIVHSSG
ELFQEYRYGD		IRTYHPPAQL		THTQFPAASS		VGLPSRTKTA		AQGPPPEGEP
LQPPQPVQST		QPAQPAPPCP		PSQLGQPGQP		PSSKMPQVSQ		EAKGTQTGVE
QPRLPAGPAN		RPPEPHTQVQ		RAQAETGPTS		FPSPVSVSMK		PDLPVSLPTQ
TAPKQPLFVP		TTSGPSTPPG		LVLPHTEFQP		APKQDSSPHL		TSQRPVDMVQ
LLKKYPIVWQ		GLLALKNDTA		AVQLHFVSGN		NVLAHRSLPL		SEGGPPLRIA
QRMRLEATQL		EGVARRMTVE		TDYCLLLALP		CGRDQEDVVS		QTESLKAAFI
TYLQAKQAAG		IINVPNPGSN		QPAYVLQIFP		PCEFSESHLS		RLAPDLLASI
SNISPHLMIV		IASV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Shi Y., Hon M., Evans R.M. (2002). The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 2613—2618. PMID 11867749 DOI:10.1073/pnas.052707099
• Ariyoshi M., Schwabe J.W.R. (2003). A conserved structural motif reveals the essential transcriptional repression function of Spen proteins and their role in developmental signaling. Genes Dev. 17: 1909—1920. PMID 12897056 DOI:10.1101/gad.266203

Див. також

• Хромосома 1