Рибосомний білок L11

Рибосомний білок L11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 4XXB, 5AJ0, 4V5Z, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC,%%s4UJE, 4XXB, 4UJD, 4D67, 4V5Z, 4V6X, 5AJ0, 4UJC, 4D5Y, 4UG0
Ідентифікатори
Символи	RPL11, DBA7, GIG34, L11, ribosomal protein L11, uL5
Зовнішні ІД	OMIM: 604175 MGI: 1914275 HomoloGene: 37376 GeneCards: RPL11
Пов'язані генетичні захворювання
Diamond-Blackfan anemia
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • structural constituent of ribosome • 5S rRNA binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity Клітинна компонента • гіалоплазма • рибосома • мембрана • внутрішньоклітинний • ядерце • cytosolic large ribosomal subunit • екзосома • клітинне ядро • GO:0005578 Позаклітинна матриця • нуклеоплазма • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • polysomal ribosome Біологічний процес • сортування білків • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • ribosomal large subunit biogenesis • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • rRNA processing • Біосинтез білків • ribosomal large subunit assembly • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of protein binding • protein stabilization • GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of protein neddylation • regulation of signal transduction by p53 class mediator • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein localization to nucleus • positive regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6135	67025
Ensembl	ENSG00000142676	ENSMUSG00000059291
UniProt	P62913 Q5VVD0	Q9CXW4
RefSeq (мРНК)	NM_001199802 NM_000975	NM_025919
RefSeq (білок)	NP_000966 NP_001186731 NP_000966.2	NP_080195
Локус (UCSC)	Хр. 1: 23.69 – 23.7 Mb	Хр. 4: 135.76 – 135.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок L11 (англ. Ribosomal protein L11) – білок, який кодується геном RPL11, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 178 амінокислот, а молекулярна маса — 20 252.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQDQGEKEN		PMRELRIRKL		CLNICVGESG		DRLTRAAKVL		EQLTGQTPVF
SKARYTVRSF		GIRRNEKIAV		HCTVRGAKAE		EILEKGLKVR		EYELRKNNFS
DTGNFGFGIQ		EHIDLGIKYD		PSIGIYGLDF		YVVLGRPGFS		IADKKRRTGC
IGAKHRISKE		EAMRWFQQKY		DGIILPGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mishin V.P., Filipenko M.L., Muravlev A.I., Karpova G.G., Mertvetsov N.P. (1995). Cloning and determination of the primary structure of DNA complementary to the mRNA of human ribosomal protein L11. Bioorg. Khim. 21: 158—160. PMID 7748210
• Voronina E.N., Kolokol'tsova T.D., Nechaeva E.A., Filipenko M.L. (2003). Structural and functional analysis of the human ribosomal protein L11 gene. Mol. Biol. (Mosk.). 37: 425—435. PMID 12815950

Див. також

• Хромосома 1