AKAP8L

AKAP8L
Ідентифікатори
Символи	AKAP8L, HA95, HAP95, NAKAP, NAKAP95, A-kinase anchoring protein 8 like
Зовнішні ІД	OMIM: 609475 MGI: 1860606 HomoloGene: 8658 GeneCards: AKAP8L
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • lamin binding • histone deacetylase binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein kinase A regulatory subunit binding Клітинна компонента • nuclear matrix • Хроматин • nuclear speck • PML body • клітинне ядро • цитоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • positive regulation of histone deacetylation • nuclear membrane disassembly • regulation of mRNA export from nucleus • mitotic chromosome condensation • cell cycle G2/M phase transition • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26993	54194
Ensembl	ENSG00000011243	ENSMUSG00000002625
UniProt	Q9ULX6	Q9R0L7
RefSeq (мРНК)	NM_001291478 NM_014371	NM_017476
RefSeq (білок)	NP_001278407 NP_055186	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 15.38 – 15.42 Mb	Хр. 17: 32.32 – 32.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AKAP8L (англ. A-kinase anchoring protein 8 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 646 амінокислот, а молекулярна маса — 71 649.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYTGFVQGS		ETTLQSTYSD		TSAQPTCDYG		YGTWNSGTNR		GYEGYGYGYG
YGQDNTTNYG		YGMATSHSWE		MPSSDTNANT		SASGSASADS		VLSRINQRLD
MVPHLETDMM		QGGVYGSGGE		RYDSYESCDS		RAVLSERDLY		RSGYDYSELD
PEMEMAYEGQ		YDAYRDQFRM		RGNDTFGPRA		QGWARDARSG		RPMASGYGRM
WEDPMGARGQ		CMSGASRLPS		LFSQNIIPEY		GMFQGMRGGG		AFPGGSRFGF
GFGNGMKQMR		RTWKTWTTAD		FRTKKKKRKQ		GGSPDEPDSK		ATRTDCSDNS
DSDNDEGTEG		EATEGLEGTE		AVEKGSRVDG		EDEEGKEDGR		EEGKEDPEKG
ALTTQDENGQ		TKRKLQAGKK		SQDKQKKRQR		DRMVERIQFV		CSLCKYRTFY
EDEMASHLDS		KFHKEHFKYV		GTKLPKQTAD		FLQEYVTNKT		KKTEELRKTV
EDLDGLIHQI		YRDQDLTQEI		AMEHFVKKVE		AAHCAACDLF		IPMQFGIIQK
HLKTMDHNRN		RRLMMEQSKK		SSLMVARSIL		NNKLISKKLE		RYLKGENPFT
DSPEEEKEQE		EAEGGALDEG		AQGEAAGISE		GAEGVPAQPP		VPPEPAPGAV
SPPPPPPPEE		EEEGAVPLLG		GALQRQIRGI		PGLDVEDDEE		GGGGAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Westberg C., Yang J.-P., Tang H., Reddy T.R., Wong-Staal F. (2000). A novel shuttle protein binds to RNA helicase A and activates the retroviral constitutive transport element. J. Biol. Chem. 275: 21396—21401. PMID 10748171 DOI:10.1074/jbc.M909887199
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang J.P., Tang H., Reddy T.R., Wong-Staal F. (2001). Mapping the functional domains of HAP95, a protein that binds RNA helicase A and activates the constitutive transport element of type D retroviruses. J. Biol. Chem. 276: 30694—30700. PMID 11402034 DOI:10.1074/jbc.M102809200
• Martins S., Eikvar S., Furukawa K., Collas P. (2003). HA95 and LAP2 beta mediate a novel chromatin-nuclear envelope interaction implicated in initiation of DNA replication. J. Cell Biol. 160: 177—188. PMID 12538639 DOI:10.1083/jcb.200210026
• Martins S.B., Marstad A., Collas P. (2003). In vitro modulation of the interaction between HA95 and LAP2beta by cAMP signaling. Biochemistry. 42: 10456—10461. PMID 12950172 DOI:10.1021/bi0350699
• Sayer J.A., Manczak M., Akileswaran L., Reddy P.H., Coghlan V.M. (2005). Interaction of the nuclear matrix protein NAKAP with HypA and huntingtin: implications for nuclear toxicity in Huntington's disease pathogenesis. NeuroMolecular Med. 7: 297—310. PMID 16391387 DOI:10.1385/NMM:7:4:297

Див. також

• Хромосома 19