BRWD1

BRWD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3Q2E
Ідентифікатори
Символи	BRWD1, C21orf107, N143, WDR9, DCAF19, bromodomain and WD repeat domain containing 1, WRD9
Зовнішні ІД	OMIM: 617824 MGI: 1890651 HomoloGene: 23130 GeneCards: BRWD1
Пов'язані генетичні захворювання
біполярний афективний розлад
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cytoskeleton organization • transcription, DNA-templated • regulation of cell shape • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • interleukin-7-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54014	93871
Ensembl	ENSG00000185658	ENSMUSG00000022914
UniProt	Q9NSI6	Q921C3
RefSeq (мРНК)	NM_001007246 NM_018963 NM_033656	NM_001103179 NM_145125 NM_176928
RefSeq (білок)	NP_001007247 NP_061836 NP_387505	NP_001096649 NP_660107 NP_795902
Локус (UCSC)	Хр. 21: 39.18 – 39.32 Mb	Хр. 16: 95.79 – 95.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BRWD1 (англ. Bromodomain and WD repeat domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 320 амінокислот, а молекулярна маса — 262 936.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPSSARRP		VPLIESELYF		LIARYLSAGP		CRRAAQVLVQ		ELEQYQLLPK
RLDWEGNEHN		RSYEELVLSN		KHVAPDHLLQ		ICQRIGPMLD		KEIPPSISRV
TSLLGAGRQS		LLRTAKDCRH		TVWKGSAFAA		LHRGRPPEMP		VNYGSPPNLV
EIHRGKQLTG		CSTFSTAFPG		TMYQHIKMHR		RILGHLSAVY		CVAFDRTGHR
IFTGSDDCLV		KIWSTHNGRL		LSTLRGHSAE		ISDMAVNYEN		TMIAAGSCDK
IIRVWCLRTC		APVAVLQGHT		GSITSLQFSP		MAKGSQRYMV		STGADGTVCF
WQWDLESLKF		SPRPLKFTEK		PRPGVQMLCS		SFSVGGMFLA		TGSTDHVIRM
YFLGFEAPEK		IAELESHTDK		VDSIQFCNNG		DRFLSGSRDG		TARIWRFEQL
EWRSILLDMA		TRISGDLSSE		EERFMKPKVT		MIAWNQNDSI		VVTAVNDHVL
KVWNSYTGQL		LHNLMGHADE		VFVLETHPFD		SRIMLSAGHD		GSIFIWDITK
GTKMKHYFNM		IEGQGHGAVF		DCKFSQDGQH		FACTDSHGHL		LIFGFGCSKP
YEKIPDQMFF		HTDYRPLIRD		SNNYVLDEQT		QQAPHLMPPP		FLVDVDGNPH
PTKYQRLVPG		RENSADEHLI		PQLGYVATSD		GEVIEQIISL		QTNDNDERSP
ESSILDGMIR		QLQQQQDQRM		GADQDTIPRG		LSNGEETPRR		GFRRLSLDIQ
SPPNIGLRRS		GQVEGVRQMH		QNAPRSQIAT		ERDLQAWKRR		VVVPEVPLGI
FRKLEDFRLE		KGEEERNLYI		IGRKRKTLQL		SHKSDSVVLV		SQSRQRTCRR
KYPNYGRRNR		SWRELSSGNE		SSSSVRHETS		CDQSEGSGSS		EEDEWRSDRK
SESYSESSSD		SSSRYSDWTA		DAGINLQPPL		RTSCRRRITR		FCSSSEDEIS
TENLSPPKRR		RKRKKENKPK		KENLRRMTPA		ELANMEHLYE		FHPPVWITDT
TLRKSPFVPQ		MGDEVIYFRQ		GHEAYIEAVR		RNNIYELNPN		KEPWRKMDLR
DQELVKIVGI		RYEVGPPTLC		CLKLAFIDPA		TGKLMDKSFS		IRYHDMPDVI
DFLVLRQFYD		EARQRNWQSC		DRFRSIIDDA		WWFGTVLSQE		PYQPQYPDSH
FQCYIVRWDN		TEIEKLSPWD		MEPIPDNVDP		PEELGASISV		TTDELEKLLY
KPQAGEWGQK		SRDEECDRII		SGIDQLLNLD		IAAAFAGPVD		LCTYPKYCTV
VAYPTDLYTI		RMRLVNRFYR		RLSALVWEVR		YIEHNARTFN		EPESVIARSA
KKITDQLLKF		IKNQHCTNIS		ELSNTSENDE		QNAEDLDDSD		LPKTSSGRRR
VHDGKKSIRA		TNYVESNWKK		QCKELVNLIF		QCEDSEPFRQ		PVDLVEYPDY
RDIIDTPMDF		GTVRETLDAG		NYDSPLEFCK		DIRLIFSNAK		AYTPNKRSKI
YSMTLRLSAL		FEEKMKKISS		DFKIGQKFNE		KLRRSQRFKQ		RQNCKGDSQP
NKSIRNLKPK		RLKSQTKIIP		ELVGSPTQST		SSRTAYLGTH		KTSAGISSGV
TSGDSSDSAE		SSERRKRNRP		ITNGSTLSES		EVEDSLATSL		SSSASSSSEE
SKESSRARES		SSRSGLSRSS		NLRVTRTRAA		QRKTGPVSLA		NGCGRKATRK
RVYLSDSDNN		SLETGEILKA		RAGNNRKVLR		KCAAVAANKI		KLMSDVEENS
SSESVCSGRK		LPHRNASAVA		RKKLLHNSED		EQSLKSEIEE		EELKDENQLL
PVSSSHTAQS		NVDESENRDS		ESESDLRVAR		KNWHANGYKS		HTPAPSKTKF
LKIESSEEDS		KSHDSDHACN		RTAGPSTSVQ		KLKAESISEE		ADSEPGRSGG
RKYNTFHKNA		SFFKKTKILS		DSEDSESEEQ		DREDGKCHKM		EMNPISGNLN
CDPIAMSQCS		SDHGCETDLD		SDDDKIEKPN		NFMKDSASQD		NGLSRKISRK
RVCSSDSDSS		LQVVKKSSKA		RTGLLRITRR		CAATAANKIK		LMSDVEDVSL
ENVHTRSKNG		RKKPLHLACT		TAKKKLSDCE		GSVHCEVPSE		QYACEGKPPD
PDSEGSTKVL		SQALNGDSDS		EDMLNSEHKH		RHTNIHKIDA		PSKRKSSSVT
SSGEDSKSHI		PGSETDRTFS		SESTLAQKAT		AENNFEVELN		YGLRRWNGRR
LRTYGKAPFS		KTKVIHDSQE		TAEKEVKRKR		SHPELENVKI		SETTGNSKFR
PDTSSKSSDL		GSVTESDIDC		TDNTKTKRRK		TKGKAKVVRK		EFVPRDREPN
TKVRTCMHNQ		KDAVQMPSET		LKAKMVPEKV		PRRCATVAAN		KIKIMSNLKE
TISGPENVWI		RKSSRKLPHR		NASAAAKKKL		LNVYKEDDTT		INSESEKELE
DINRKMLFLR		GFRSWKENAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 21