CBX2

CBX2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D9U, 3H91, 5EPK
Ідентифікатори
Символи	CBX2, CDCA6, M33, SRXY5, chromobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602770 MGI: 88289 HomoloGene: 7256 GeneCards: CBX2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • methylated histone binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • GO:0035328 Гетерохроматин • GO:0035327 Еухроматин • PcG protein complex • PRC1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома Біологічний процес • диференціація клітин • development of primary sexual characteristics • sex differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84733	12416
Ensembl	ENSG00000173894	ENSMUSG00000025577
UniProt	Q14781	P30658
RefSeq (мРНК)	NM_005189 NM_032647	NM_007623
RefSeq (білок)	NP_005180 NP_116036	NP_031649
Локус (UCSC)	Хр. 17: 79.78 – 79.79 Mb	Хр. 11: 118.91 – 118.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CBX2 (англ. Chromobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 532 амінокислот, а молекулярна маса — 56 081.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEELSSVGEQ		VFAAECILSK		RLRKGKLEYL		VKWRGWSSKH		NSWEPEENIL
DPRLLLAFQK		KEHEKEVQNR		KRGKRPRGRP		RKLTAMSSCS		RRSKLKEPDA
PSKSKSSSSS		SSSTSSSSSS		DEEDDSDLDA		KRGPRGRETH		PVPQKKAQIL
VAKPELKDPI		RKKRGRKPLP		PEQKATRRPV		SLAKVLKTAR		KDLGAPASKL
PPPLSAPVAG		LAALKAHAKE		ACGGPSAMAT		PENLASLMKG		MASSPGRGGI
SWQSSIVHYM		NRMTQSQAQA		ASRLALKAQA		TNKCGLGLDL		KVRTQKGELG
MSPPGSKIPK		APSGGAVEQK		VGNTGGPPHT		HGASRVPAGC		PGPQPAPTQE
LSLQVLDLQS		VKNGMPGVGL		LARHATATKG		VPATNPAPGK		GTGSGLIGAS
GATMPTDTSK		SEKLASRAVA		PPTPASKRDC		VKGSATPSGQ		ESRTAPGEAR
KAATLPEMSA		GEESSSSDSD		PDSASPPSTG		QNPSVSVQTS		QDWKPTRSLI
EHVFVTDVTA		NLITVTVKES		PTSVGFFNLR		HY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Biason-Lauber A., Konrad D., Meyer M., DeBeaufort C., Schoenle E.J. (2009). Ovaries and female phenotype in a girl with 46,XY karyotype and mutations in the CBX2 gene. Am. J. Hum. Genet. 84: 658—663. PMID 19361780 DOI:10.1016/j.ajhg.2009.03.016
• Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Див. також

• Хромосома 17