CDC5L

CDC5L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DIM, 2DIN
Ідентифікатори
Символи	CDC5L, CDC5, CDC5-LIKE, CEF1, PCDC5RP, dJ319D22.1, cell division cycle 5 like
Зовнішні ІД	OMIM: 602868 MGI: 1918952 HomoloGene: 13291 GeneCards: CDC5L
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein phosphatase 1 binding • leucine zipper domain binding • WD40-repeat domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription corepressor binding • protein kinase binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • Prp19 complex • нуклеоплазма • protein-DNA complex • perinuclear region of cytoplasm • DNA replication factor A complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • cellular response to nerve growth factor stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA processing • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • transcription, DNA-templated • cellular response to interleukin-2 • cellular response to prolactin • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to wortmannin • GO:0007067 мітоз • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • диференціація клітин • Сплайсинг РНК • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	988	71702
Ensembl	ENSG00000096401	ENSMUSG00000023932
UniProt	Q99459	Q6A068
RefSeq (мРНК)	NM_001253	NM_152810
RefSeq (білок)	NP_001244	NP_690023
Локус (UCSC)	Хр. 6: 44.39 – 44.45 Mb	Хр. 17: 45.7 – 45.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDC5L (англ. Cell division cycle 5 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 92 251.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRIMIKGGV		WRNTEDEILK		AAVMKYGKNQ		WSRIASLLHR		KSAKQCKARW
YEWLDPSIKK		TEWSREEEEK		LLHLAKLMPT		QWRTIAPIIG		RTAAQCLEHY
EFLLDKAAQR		DNEEETTDDP		RKLKPGEIDP		NPETKPARPD		PIDMDEDELE
MLSEARARLA		NTQGKKAKRK		AREKQLEEAR		RLAALQKRRE		LRAAGIEIQK
KRKRKRGVDY		NAEIPFEKKP		ALGFYDTSEE		NYQALDADFR		KLRQQDLDGE
LRSEKEGRDR		KKDKQHLKRK		KESDLPSAIL		QTSGVSEFTK		KRSKLVLPAP
QISDAELQEV		VKVGQASEIA		RQTAEESGIT		NSASSTLLSE		YNVTNNSVAL
RTPRTPASQD		RILQEAQNLM		ALTNVDTPLK		GGLNTPLHES		DFSGVTPQRQ
VVQTPNTVLS		TPFRTPSNGA		EGLTPRSGTT		PKPVINSTPG		RTPLRDKLNI
NPEDGMADYS		DPSYVKQMER		ESREHLRLGL		LGLPAPKNDF		EIVLPENAEK
ELEEREIDDT		YIEDAADVDA		RKQAIRDAER		VKEMKRMHKA		VQKDLPRPSE
VNETILRPLN		VEPPLTDLQK		SEELIKKEMI		TMLHYDLLHH		PYEPSGNKKG
KTVGFGTNNS		EHITYLEHNP		YEKFSKEELK		KAQDVLVQEM		EVVKQGMSHG
ELSSEAYNQV		WEECYSQVLY		LPGQSRYTRA		NLASKKDRIE		SLEKRLEINR
GHMTTEAKRA		AKMEKKMKIL		LGGYQSRAMG		LMKQLNDLWD		QIEQAHLELR
TFEELKKHED		SAIPRRLECL		KEDVQRQQER		EKELQHRYAD		LLLEKETLKS
KF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Bernstein H.S., Coughlin S.R. (1997). Pombe Cdc5-related protein. A putative human transcription factor implicated in mitogen-activated signaling. J. Biol. Chem. 272: 5833—5837. PMID 9038199 DOI:10.1074/jbc.272.9.5833
• Groenen P.M.A., Vanderlinden G., Devriendt K., Fryns J.-P., Van de Ven W.J.M. (1998). Rearrangement of the human CDC5L gene by a t(6;19)(p21;q13.1) in a patient with multicystic renal dysplasia. Genomics. 49: 218—229. PMID 9598309 DOI:10.1006/geno.1998.5254
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hirayama T., Shinozaki K. (1996). A cdc5+ homolog of a higher plant, Arabidopsis thaliana. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13371—13376. PMID 8917598 DOI:10.1073/pnas.93.23.13371
• Bernstein H.S., Coughlin S.R. (1998). A mammalian homolog of fission yeast Cdc5 regulates G2 progression and mitotic entry. J. Biol. Chem. 273: 4666—4671. PMID 9468527 DOI:10.1074/jbc.273.8.4666
• Burns C.G., Ohi R., Krainer A.R., Gould K.L. (1999). Evidence that Myb-related CDC5 proteins are required for pre-mRNA splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 13789—13794. PMID 10570151 DOI:10.1073/pnas.96.24.13789

Див. також

• Хромосома 6