CDK5RAP2

CDK5RAP2
Ідентифікатори
Символи	CDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, CDK5 regulatory subunit associated protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608201 MGI: 2384875 HomoloGene: 49533 GeneCards: CDK5RAP2
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • tubulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • calmodulin binding • gamma-tubulin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • mitotic spindle pole • центросома • комплекс Ґольджі • spindle pole • pericentriolar material • центр організації мікротрубочок • microtubule plus-end • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • мікротрубочка • екзосома Біологічний процес • regulation of neuron differentiation • negative regulation of centriole replication • Нейрогенез • negative regulation of neuron differentiation • chromosome segregation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • brain development • G2/M transition of mitotic cell cycle • microtubule bundle formation • regulation of spindle checkpoint • establishment of mitotic spindle orientation • centriole replication • microtubule organizing center organization • microtubule cytoskeleton organization • ciliary basal body-plasma membrane docking • centrosome cycle • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • positive regulation of microtubule polymerization • regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55755	214444
Ensembl	ENSG00000136861	ENSMUSG00000039298
UniProt	Q96SN8	P68254 Q8K389
RefSeq (мРНК)	NM_001011649 NM_001272039 NM_018249	NM_145990 NM_001313762
RefSeq (білок)	NP_001011649 NP_001258968 NP_060719	NP_035869 NP_001300691 NP_666102
Локус (UCSC)	Хр. 9: 120.39 – 120.58 Mb	Хр. 4: 70.14 – 70.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDK5RAP2 (англ. CDK5 regulatory subunit associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 893 амінокислот, а молекулярна маса — 215 038.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMDLVLEEDV		TVPGTLSGCS		GLVPSVPDDL		DGINPNAGLG		NGLLPNVSEE
TVSPTRARNM		KDFENQITEL		KKENFNLKLR		IYFLEERMQQ		EFHGPTEHIY
KTNIELKVEV		ESLKRELQER		EQLLIKASKA		VESLAEAGGS		EIQRVKEDAR
KKVQQVEDLL		TKRILLLEKD		VTAAQAELEK		AFAGTETEKA		LRLRLESKLS
EMKKMHEGDL		AMALVLDEKD		RLIEELKLSL		KSKEALIQCL		KEEKSQMACP
DENVSSGELR		GLCAAPREEK		ERETEAAQME		HQKERNSFEE		RIQALEEDLR
EKEREIATEK		KNSLKRDKAI		QGLTMALKSK		EKKVEELNSE		IEKLSAAFAK
AREALQKAQT		QEFQGSEDYE		TALSGKEALS		AALRSQNLTK		STENHRLRRS
IKKITQELSD		LQQERERLEK		DLEEAHREKS		KGDCTIRDLR		NEVEKLRNEV
NEREKAMENR		YKSLLSESNK		KLHNQEQVIK		HLTESTNQKD		VLLQKFNEKD
LEVIQQNCYL		MAAEDLELRS		EGLITEKCSS		QQPPGSKTIF		SKEKKQSSDY
EELIQVLKKE		QDIYTHLVKS		LQESDSINNL		QAELNKIFAL		RKQLEQDVLS
YQNLRKTLEE		QISEIRRREE		ESFSLYSDQT		SYLSICLEEN		NRFQVEHFSQ
EELKKKVSDL		IQLVKELYTD		NQHLKKTIFD		LSCMGFQGNG		FPDRLASTEQ
TELLASKEDE		DTIKIGEDDE		INFLSDQHLQ		QSNEIMKDLS		KGGCKNGYLR
HTESKISDCD		GAHAPGCLEE		GAFINLLAPL		FNEKATLLLE		SRPDLLKVVR
ELLLGQLFLT		EQEVSGEHLD		GKTEKTPKQK		GELVHFVQTN		SFSKPHDELK
LSCEAQLVKA		GEVPKVGLKD		ASVQTVATEG		DLLRFKHEAT		REAWEEKPIN
TALSAEHRPE		NLHGVPGWQA		ALLSLPGITN		REAKKSRLPI		LIKPSRSLGN
MYRLPATQEV		VTQLQSQILE		LQGELKEFKT		CNKQLHQKLI		LAEAVMEGRP
TPDKTLLNAQ		PPVGAAYQDS		PGEQKGIKTT		SSVWRDKEMD		SDQQRSYEID
SEICPPDDLA		SLPSCKENPE		DVLSPTSVAT		YLSSKSQPSA		KVSVMGTDQS
ESINTSNETE		YLKQKIHDLE		TELEGYQNFI		FQLQKHSQCS		EAIITVLCGT
EGAQDGLSKP		KNGSDGEEMT		FSSLHQVRYV		KHVKILGPLA		PEMIDSRVLE
NLKQQLEEQE		YKLQKEQNLN		MQLFSEIHNL		QNKFRDLSPP		RYDSLVQSQA
RELSLQRQQI		KDGHGICVIS		RQHMNTMIKA		FEELLQASDV		DYCVAEGFQE
QLNQCAELLE		KLEKLFLNGK		SVGVEMNTQN		ELMERIEEDN		LTYQHLLPES
PEPSASHALS		DYETSEKSFF		SRDQKQDNET		EKTSVMVNSF		SQDLLMEHIQ
EIRTLRKRLE		ESIKTNEKLR		KQLERQGSEF		VQGSTSIFAS		GSELHSSLTS
EIHFLRKQNQ		ALNAMLIKGS		RDKQKENDKL		RESLSRKTVS		LEHLQREYAS
VKEENERLQK		EGSEKERHNQ		QLIQEVRCSG		QELSRVQEEV		KLRQQLLSQN
DKLLQSLRVE		LKAYEKLDEE		HRRLREASGE		GWKGQDPFRD		LHSLLMEIQA
LRLQLERSIE		TSSTLQSRLK		EQLARGAEKA		QEGALTLAVQ		AVSIPEVPLQ
PDKHDGDKYP		MESDNSFDLF		DSSQAVTPKS		VSETPPLSGN		DTDSLSCDSG
SSATSTPCVS		RLVTGHHLWA		SKNGRHVLGL		IEDYEALLKQ		ISQGQRLLAE
MDIQTQEAPS		STSQELGTKG		PHPAPLSKFV		SSVSTAKLTL		EEAYRRLKLL
WRVSLPEDGQ		CPLHCEQIGE		MKAEVTKLHK		KLFEQEKKLQ		NTMKLLQLSK
RQEKVIFDQL		VVTHKILRKA		RGNLELRPGG		AHPGTCSPSR		PGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ching Y.-P., Qi Z., Wang J.H. (2000). Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins. Gene. 242: 285—294. PMID 10721722 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00499-0
• Graser S., Stierhof Y.D., Nigg E.A. (2007). Cep68 and Cep215 (Cdk5rap2) are required for centrosome cohesion. J. Cell Sci. 120: 4321—4331. PMID 18042621 DOI:10.1242/jcs.020248
• Fong K.W., Choi Y.K., Rattner J.B., Qi R.Z. (2008). CDK5RAP2 is a pericentriolar protein that functions in centrosomal attachment of the gamma-tubulin ring complex. Mol. Biol. Cell. 19: 115—125. PMID 17959831 DOI:10.1091/mbc.E07-04-0371
• Haren L., Stearns T., Lueders J. (2009). Plk1-dependent recruitment of gamma-tubulin complexes to mitotic centrosomes involves multiple PCM components. PLoS ONE. 4: E5976—E5976. PMID 19543530 DOI:10.1371/journal.pone.0005976

Див. також

• Хромосома 9