CDX4

CDX4
Ідентифікатори
Символи	CDX4, caudal type homeobox 4
Зовнішні ІД	OMIM: 300025 MGI: 88362 HomoloGene: 3806 GeneCards: CDX4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • animal organ morphogenesis • multicellular organism development • labyrinthine layer development • диференціація клітин • blood vessel development • anterior/posterior axis specification • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • anterior/posterior pattern specification • placenta development • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1046	12592
Ensembl	ENSG00000131264	ENSMUSG00000031326
UniProt	O14627	Q07424
RefSeq (мРНК)	NM_005193	NM_007674
RefSeq (білок)	NP_005184	NP_031700
Локус (UCSC)	Хр. X: 73.45 – 73.46 Mb	Хр. X: 102.37 – 102.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDX4 (англ. Caudal type homeobox 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 30 480.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYGSCLLEKE		AGMYPGTLMS		PGGDGTAGTG		GTGGGGSPMP		ASNFAAAPAF
SHYMGYPHMP		SMDPHWPSLG		VWGSPYSPPR		EDWSVYPGPS		STMGTVPVND
VTSSPAAFCS		TDYSNLGPVG		GGTSGSSLPG		QAGGSLVPTD		AGAAKASSPS
RSRHSPYAWM		RKTVQVTGKT		RTKEKYRVVY		TDHQRLELEK		EFHCNRYITI
QRKSELAVNL		GLSERQVKIW		FQNRRAKERK		MIKKKISQFE		NSGGSVQSDS
DSISPGELPN		TFFTTPSAVR		GFQPIEIQQV		IVSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X