CHD2

CHD2
Ідентифікатори
Символи	CHD2, EEOC, chromodomain helicase DNA binding protein 2, DEE94
Зовнішні ІД	OMIM: 602119 MGI: 2448567 HomoloGene: 37462 GeneCards: CHD2
Пов'язані генетичні захворювання
хронічний лімфолейкоз
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0031493 histone binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • RNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • ядерце • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle organ development • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • hematopoietic stem cell differentiation • DNA duplex unwinding • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1106	244059
Ensembl	ENSG00000173575	ENSMUSG00000078671
UniProt	O14647	E9PZM4
RefSeq (мРНК)	NM_001271 NM_001042572	NM_001081345
RefSeq (білок)	NP_001036037 NP_001262	NP_001074814
Локус (UCSC)	Хр. 15: 92.9 – 93.03 Mb	Хр. 7: 73.08 – 73.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHD2 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 828 амінокислот, а молекулярна маса — 211 344.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMRNKDKSQE		EDSSLHSNAS		SHSASEEASG		SDSGSQSESE		QGSDPGSGHG
SESNSSSESS		ESQSESESES		AGSKSQPVLP		EAKEKPASKK		ERIADVKKMW
EEYPDVYGVR		RSNRSRQEPS		RFNIKEEASS		GSESGSPKRR		GQRQLKKQEK
WKQEPSEDEQ		EQGTSAESEP		EQKKVKARRP		VPRRTVPKPR		VKKQPKTQRG
KRKKQDSSDE		DDDDDEAPKR		QTRRRAAKNV		SYKEDDDFET		DSDDLIEMTG
EGVDEQQDNS		ETIEKVLDSR		LGKKGATGAS		TTVYAIEANG		DPSGDFDTEK
DEGEIQYLIK		WKGWSYIHST		WESEESLQQQ		KVKGLKKLEN		FKKKEDEIKQ
WLGKVSPEDV		EYFNCQQELA		SELNKQYQIV		ERVIAVKTSK		STLGQTDFPA
HSRKPAPSNE		PEYLCKWMGL		PYSECSWEDE		ALIGKKFQNC		IDSFHSRNNS
KTIPTRECKA		LKQRPRFVAL		KKQPAYLGGE		NLELRDYQLE		GLNWLAHSWC
KNNSVILADE		MGLGKTIQTI		SFLSYLFHQH		QLYGPFLIVV		PLSTLTSWQR
EFEIWAPEIN		VVVYIGDLMS		RNTIREYEWI		HSQTKRLKFN		ALITTYEILL
KDKTVLGSIN		WAFLGVDEAH		RLKNDDSLLY		KTLIDFKSNH		RLLITGTPLQ
NSLKELWSLL		HFIMPEKFEF		WEDFEEDHGK		GRENGYQSLH		KVLEPFLLRR
VKKDVEKSLP		AKVEQILRVE		MSALQKQYYK		WILTRNYKAL		AKGTRGSTSG
FLNIVMELKK		CCNHCYLIKP		PEENERENGQ		EILLSLIRSS		GKLILLDKLL
TRLRERGNRV		LIFSQMVRML		DILAEYLTIK		HYPFQRLDGS		IKGEIRKQAL
DHFNADGSED		FCFLLSTRAG		GLGINLASAD		TVVIFDSDWN		PQNDLQAQAR
AHRIGQKKQV		NIYRLVTKGT		VEEEIIERAK		KKMVLDHLVI		QRMDTTGRTI
LENNSGRSNS		NPFNKEELTA		ILKFGAEDLF		KELEGEESEP		QEMDIDEILR
LAETRENEVS		TSATDELLSQ		FKVANFATME		DEEELEERPH		KDWDEIIPEE
QRKKVEEEER		QKELEEIYML		PRIRSSTKKA		QTNDSDSDTE		SKRQAQRSSA
SESETEDSDD		DKKPKRRGRP		RSVRKDLVEG		FTDAEIRRFI		KAYKKFGLPL
ERLECIARDA		ELVDKSVADL		KRLGELIHNS		CVSAMQEYEE		QLKENASEGK
GPGKRRGPTI		KISGVQVNVK		SIIQHEEEFE		MLHKSIPVDP		EEKKKYCLTC
RVKAAHFDVE		WGVEDDSRLL		LGIYEHGYGN		WELIKTDPEL		KLTDKILPVE
TDKKPQGKQL		QTRADYLLKL		LRKGLEKKGA		VTGGEEAKLK		KRKPRVKKEN
KVPRLKEEHG		IELSSPRHSD		NPSEEGEVKD		DGLEKSPMKK		KQKKKENKEN
KEKQMSSRKD		KEGDKERKKS		KDKKEKPKSG		DAKSSSKSKR		SQGPVHITAG
SEPVPIGEDE		DDDLDQETFS		ICKERMRPVK		KALKQLDKPD		KGLNVQEQLE
HTRNCLLKIG		DRIAECLKAY		SDQEHIKLWR		RNLWIFVSKF		TEFDARKLHK
LYKMAHKKRS		QEEEEQKKKD		DVTGGKKPFR		PEASGSSRDS		LISQSHTSHN
LHPQKPHLPA		SHGPQMHGHP		RDNYNHPNKR		HFSNADRGDW		QRERKFNYGG
GNNNPPWGSD		RHHQYEQHWY		KDHHYGDRRH		MDAHRSGSYR		PNNMSRKRPY
DQYSSDRDHR		GHRDYYDRHH		HDSKRRRSDE		FRPQNYHQQD		FRRMSDHRPA
MGYHGQGPSD		HYRSFHTDKL		GEYKQPLPPL		HPAVSDPRSP		PSQKSPHDSK
SPLDHRSPLE		RSLEQKNNPD		YNWNVRKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, міогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Woodage T., Basrai M.A., Baxevanis A.D., Hieter P., Collins F.S. (1997). Characterization of the CHD family of proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11472—11477. PMID 9326634 DOI:10.1073/pnas.94.21.11472
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15