CHD3
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
CHD3 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 000 амінокислот, а молекулярна маса — 226 592[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKAADTVILW | ARSKNDQLRI | SFPPGLCWGD | RMPDKDDIRL | LPSALGVKKR | ||||
KRGPKKQKEN | KPGKPRKRKK | RDSEEEFGSE | RDEYREKSES | GGSEYGTGPG | ||||
RKRRRKHREK | KEKKTKRRKK | GEGDGGQKQV | EQKSSATLLL | TWGLEDVEHV | ||||
FSEEDYHTLT | NYKAFSQFMR | PLIAKKNPKI | PMSKMMTILG | AKWREFSANN | ||||
PFKGSAAAVA | AAAAAAAAAV | AEQVSAAVSS | ATPIAPSGPP | ALPPPPAADI | ||||
QPPPIRRAKT | KEGKGPGHKR | RSKSPRVPDG | RKKLRGKKMA | PLKIKLGLLG | ||||
GKRKKGGSYV | FQSDEGPEPE | AEESDLDSGS | VHSASGRPDG | PVRTKKLKRG | ||||
RPGRKKKKVL | GCPAVAGEEE | VDGYETDHQD | YCEVCQQGGE | IILCDTCPRA | ||||
YHLVCLDPEL | DRAPEGKWSC | PHCEKEGVQW | EAKEEEEEYE | EEGEEEGEKE | ||||
EEDDHMEYCR | VCKDGGELLC | CDACISSYHI | HCLNPPLPDI | PNGEWLCPRC | ||||
TCPVLKGRVQ | KILHWRWGEP | PVAVPAPQQA | DGNPDVPPPR | PLQGRSEREF | ||||
FVKWVGLSYW | HCSWAKELQL | EIFHLVMYRN | YQRKNDMDEP | PPLDYGSGED | ||||
DGKSDKRKVK | DPHYAEMEEK | YYRFGIKPEW | MTVHRIINHS | VDKKGNYHYL | ||||
VKWRDLPYDQ | STWEEDEMNI | PEYEEHKQSY | WRHRELIMGE | DPAQPRKYKK | ||||
KKKELQGDGP | PSSPTNDPTV | KYETQPRFIT | ATGGTLHMYQ | LEGLNWLRFS | ||||
WAQGTDTILA | DEMGLGKTIQ | TIVFLYSLYK | EGHTKGPFLV | SAPLSTIINW | ||||
EREFQMWAPK | FYVVTYTGDK | DSRAIIRENE | FSFEDNAIKG | GKKAFKMKRE | ||||
AQVKFHVLLT | SYELITIDQA | ALGSIRWACL | VVDEAHRLKN | NQSKFFRVLN | ||||
GYKIDHKLLL | TGTPLQNNLE | ELFHLLNFLT | PERFNNLEGF | LEEFADISKE | ||||
DQIKKLHDLL | GPHMLRRLKA | DVFKNMPAKT | ELIVRVELSP | MQKKYYKYIL | ||||
TRNFEALNSR | GGGNQVSLLN | IMMDLKKCCN | HPYLFPVAAM | ESPKLPSGAY | ||||
EGGALIKSSG | KLMLLQKMLR | KLKEQGHRVL | IFSQMTKMLD | LLEDFLDYEG | ||||
YKYERIDGGI | TGALRQEAID | RFNAPGAQQF | CFLLSTRAGG | LGINLATADT | ||||
VIIFDSDWNP | HNDIQAFSRA | HRIGQANKVM | IYRFVTRASV | EERITQVAKR | ||||
KMMLTHLVVR | PGLGSKAGSM | SKQELDDILK | FGTEELFKDE | NEGENKEEDS | ||||
SVIHYDNEAI | ARLLDRNQDA | TEDTDVQNMN | EYLSSFKVAQ | YVVREEDKIE | ||||
EIEREIIKQE | ENVDPDYWEK | LLRHHYEQQQ | EDLARNLGKG | KRVRKQVNYN | ||||
DAAQEDQDNQ | SEYSVGSEEE | DEDFDERPEG | RRQSKRQLRN | EKDKPLPPLL | ||||
ARVGGNIEVL | GFNTRQRKAF | LNAVMRWGMP | PQDAFTTQWL | VRDLRGKTEK | ||||
EFKAYVSLFM | RHLCEPGADG | SETFADGVPR | EGLSRQQVLT | RIGVMSLVKK | ||||
KVQEFEHING | RWSMPELMPD | PSADSKRSSR | ASSPTKTSPT | TPEASATNSP | ||||
CTSKPATPAP | SEKGEGIRTP | LEKEEAENQE | EKPEKNSRIG | EKMETEADAP | ||||
SPAPSLGERL | EPRKIPLEDE | VPGVPGEMEP | EPGYRGDREK | SATESTPGER | ||||
GEEKPLDGQE | HRERPEGETG | DLGKREDVKG | DRELRPGPRD | EPRSNGRREE | ||||
KTEKPRFMFN | IADGGFTELH | TLWQNEERAA | ISSGKLNEIW | HRRHDYWLLA | ||||
GIVLHGYARW | QDIQNDAQFA | IINEPFKTEA | NKGNFLEMKN | KFLARRFKLL | ||||
EQALVIEEQL | RRAAYLNLSQ | EPAHPAMALH | ARFAEAECLA | ESHQHLSKES | ||||
LAGNKPANAV | LHKVLNQLEE | LLSDMKADVT | RLPATLSRIP | PIAARLQMSE | ||||
RSILSRLASK | GTEPHPTPAY | PPGPYATPPG | YGAAFSAAPV | GALAAAGANY | ||||
SQMPAGSFIT | AATNGPPVLV | KKEKEMVGAL | VSDGLDRKEP | RAGEVICIDD | ||||
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
- Aubry F., Mattei M.-G., Galibert F. (1998). Identification of a human 17p-located cDNA encoding a protein of the Snf2-like helicase family. Eur. J. Biochem. 254: 558—564. PMID 9688266 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2540558.x
- Woodage T., Basrai M.A., Baxevanis A.D., Hieter P., Collins F.S. (1997). Characterization of the CHD family of proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11472—11477. PMID 9326634 DOI:10.1073/pnas.94.21.11472
- Ge Q., Nilasena D.S., O'Brien C.A., Frank M.B., Targoff I.N. (1995). Molecular analysis of a major antigenic region of the 240 kD protein of Mi-2 autoantigen. J. Clin. Invest. 96: 1730—1737. PMID 7560064 DOI:10.1172/JCI118218
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. (1998). Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. Nature. 395: 917—921. PMID 9804427 DOI:10.1038/27699
- Schultz D.C., Friedman J.R., Rauscher F.J. III (2001). Targeting histone deacetylase complexes via KRAB-zinc finger proteins: the PHD and bromodomains of KAP-1 form a cooperative unit that recruits a novel isoform of the Mi-2alpha subunit of NuRD. Genes Dev. 15: 428—443. PMID 11230151 DOI:10.1101/gad.869501
- Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. (2003). Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. FEBS Lett. 533: 14—20. PMID 12505151 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03737-7
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1918 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12873 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |