CTBP1

CTBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MX3, 4LCE, 4U6Q
Ідентифікатори
Символи	CTBP1, C-terminal binding protein 1, BARS, HADDTS
Зовнішні ІД	OMIM: 602618 MGI: 1201685 HomoloGene: 1015 GeneCards: CTBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • NAD binding • transcription factor binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • identical protein binding • hydroxypyruvate reductase activity • glyoxylate reductase (NADP+) activity • protein homodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • transcription repressor complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • presynaptic active zone cytoplasmic component • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse Біологічний процес • positive regulation of histone deacetylation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral genome replication • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • negative regulation of histone H4 acetylation • protein phosphorylation • white fat cell differentiation • обмін речовин • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of histone acetylation • negative regulation of cell population proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1487	13016
Ensembl	ENSG00000159692	ENSMUSG00000037373
UniProt	Q13363	O88712
RefSeq (мРНК)	NM_001012614 NM_001328 NM_001377186 NM_001377187 NM_001377188 NM_001377189 NM_001377190 NM_001377191 NM_001377192 NM_001377193	NM_001198859 NM_001198860 NM_001198861 NM_013502 NM_001310535
RefSeq (білок)	NP_001012632 NP_001319 NP_001364115 NP_001364116 NP_001364117 NP_001364118 NP_001364119 NP_001364120 NP_001364121 NP_001364122	NP_001185788 NP_001185789 NP_001185790 NP_001297464 NP_038530
Локус (UCSC)	Хр. 4: 1.21 – 1.25 Mb	Хр. 5: 33.41 – 33.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTBP1 (англ. C-terminal binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 47 535.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSSHLLNKG		LPLGVRPPIM		NGPLHPRPLV		ALLDGRDCTV		EMPILKDVAT
VAFCDAQSTQ		EIHEKVLNEA		VGALMYHTIT		LTREDLEKFK		ALRIIVRIGS
GFDNIDIKSA		GDLGIAVCNV		PAASVEETAD		STLCHILNLY		RRATWLHQAL
REGTRVQSVE		QIREVASGAA		RIRGETLGII		GLGRVGQAVA		LRAKAFGFNV
LFYDPYLSDG		VERALGLQRV		STLQDLLFHS		DCVTLHCGLN		EHNHHLINDF
TVKQMRQGAF		LVNTARGGLV		DEKALAQALK		EGRIRGAALD		VHESEPFSFS
QGPLKDAPNL		ICTPHAAWYS		EQASIEMREE		AAREIRRAIT		GRIPDSLKNC
VNKDHLTAAT		HWASMDPAVV		HPELNGAAYR		YPPGVVGVAP		TGIPAAVEGI
VPSAMSLSHG		LPPVAHPPHA		PSPGQTVKPE		ADRDHASDQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Sewalt R.G.A.B., Gunster M.J., van der Vlag J., Satijn D.P.E., Otte A.P. (1999). C-terminal binding protein is a transcriptional repressor that interacts with a specific class of vertebrate polycomb proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 777—787. PMID 9858600 DOI:10.1128/MCB.19.1.777
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chakraborty S., Senyuk V., Sitailo S., Chi Y., Nucifora G. (2001). Interaction of EVI1 with cAMP-responsive element-binding protein-binding protein (CBP) and p300/CBP-associated factor (P/CAF) results in reversible acetylation of EVI1 and in co-localization in nuclear speckles. J. Biol. Chem. 276: 44936—44943. PMID 11568182 DOI:10.1074/jbc.M106733200
• Touitou R., Hickabottom M., Parker G., Crook T., Allday M.J. (2001). Physical and functional interactions between the corepressor CtBP and the Epstein-Barr virus nuclear antigen EBNA3C. J. Virol. 75: 7749—7755. PMID 11462050 DOI:10.1128/JVI.75.16.7749-7755.2001
• Vo N., Fjeld C., Goodman R.H. (2001). Acetylation of nuclear hormone receptor-interacting protein RIP140 regulates binding of the transcriptional corepressor CtBP. Mol. Cell. Biol. 21: 6181—6188. PMID 11509661 DOI:10.1128/MCB.21.18.6181-6188.2001
• Hickabottom M., Parker G.A., Freemont P., Crook T., Allday M.J. (2002). Two nonconsensus sites in the Epstein-Barr virus oncoprotein EBNA3A cooperate to bind the co-repressor carboxyl-terminal-binding protein (CtBP). J. Biol. Chem. 277: 47197—47204. PMID 12372828 DOI:10.1074/jbc.M208116200

Див. також

• Хромосома 4