DCLK1

DCLK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MFW, 1MG4, 1UF0
Ідентифікатори
Символи	DCLK1, CL1, CLICK1, DCAMKL1, DCDC3A, DCLK, doublecortin like kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604742 MGI: 1330861 HomoloGene: 130530 GeneCards: DCLK1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • kinase activity • ATP binding • protein serine/threonine kinase activity Клітинна компонента • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення Біологічний процес • диференціація клітин • аксоноґенеза • dendrite morphogenesis • фосфорилювання • response to virus • neuron migration • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • endosomal transport • protein phosphorylation • central nervous system development • brain development • axon extension • forebrain development • central nervous system projection neuron axonogenesis • negative regulation of protein localization to nucleus • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0007243 intracellular signal transduction • neuron projection morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9201	13175
Ensembl	ENSG00000133083	ENSMUSG00000027797
UniProt	O15075	Q9JLM8
RefSeq (мРНК)	NM_001195415 NM_001195416 NM_001195430 NM_004734 NM_001330071 NM_001330072	NM_001111051 NM_001111052 NM_001111053 NM_001195538 NM_001195539 NM_001195540 NM_019978 NM_001357466 NM_001357468 NM_001357469 NM_001357475 NM_001357476
RefSeq (білок)	NP_001182344 NP_001182345 NP_001182359 NP_001317000 NP_001317001 NP_004725	NP_001104521 NP_001104522 NP_001104523 NP_001182467 NP_001182468 NP_001182469 NP_064362 NP_001344395 NP_001344397 NP_001344398 NP_001344404 NP_001344405
Локус (UCSC)	Хр. 13: 35.77 – 36.13 Mb	Хр. 3: 55.15 – 55.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCLK1 (англ. Doublecortin like kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 82 224.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFGRDMELE		HFDERDKAQR		YSRGSRVNGL		PSPTHSAHCS		FYRTRTLQTL
SSEKKAKKVR		FYRNGDRYFK		GIVYAISPDR		FRSFEALLAD		LTRTLSDNVN
LPQGVRTIYT		IDGLKKISSL		DQLVEGESYV		CGSIEPFKKL		EYTKNVNPNW
SVNVKTTSAS		RAVSSLATAK		GSPSEVRENK		DFIRPKLVTI		IRSGVKPRKA
VRILLNKKTA		HSFEQVLTDI		TDAIKLDSGV		VKRLYTLDGK		QVMCLQDFFG
DDDIFIACGP		EKFRYQDDFL		LDESECRVVK		STSYTKIASS		SRRSTTKSPG
PSRRSKSPAS		TSSVNGTPGS		QLSTPRSGKS		PSPSPTSPGS		LRKQRSSQHG
GSSTSLASTK		VCSSMDENDG		PGEEVSEEGF		QIPATITERY		KVGRTIGDGN
FAVVKECVER		STAREYALKI		IKKSKCRGKE		HMIQNEVSIL		RRVKHPNIVL
LIEEMDVPTE		LYLVMELVKG		GDLFDAITST		NKYTERDASG		MLYNLASAIK
YLHSLNIVHR		DIKPENLLVY		EHQDGSKSLK		LGDFGLATIV		DGPLYTVCGT
PTYVAPEIIA		ETGYGLKVDI		WAAGVITYIL		LCGFPPFRGS		GDDQEVLFDQ
ILMGQVDFPS		PYWDNVSDSA		KELITMMLLV		DVDQRFSAVQ		VLEHPWVNDD
GLPENEHQLS		VAGKIKKHFN		TGPKPNSTAA		GVSVIATTAL		DKERQVFRRR
RNQDVRSRYK		AQPAPPELNS		ESEDYSPSSS		ETVRSPNSPF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Sossey-Alaoui K., Srivastava A.K. (1999). DCAMKL1, a brain-specific transmembrane protein on 13q12.3 that is similar to doublecortin (DCX). Genomics. 56: 121—126. PMID 10036192 DOI:10.1006/geno.1998.5718
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matsumoto N., Pilz D.T., Ledbetter D.H. (1999). Genomic structure, chromosomal mapping, and expression pattern of human DCAMKL1 (KIAA0369), a homologue of DCX (XLIS). Genomics. 56: 179—183. PMID 10051403 DOI:10.1006/geno.1998.5673
• Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x

Див. також

• Хромосома 13