DDX46

DDX46
Ідентифікатори
Символи	DDX46, PRPF5, Prp5, DEAD-box helicase 46
Зовнішні ІД	OMIM: 617848 MGI: 1920895 HomoloGene: 5430 GeneCards: DDX46
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • Тільце Кахаля • мембрана • клітинне ядро • fibrillar center • нуклеоплазма • nuclear speck • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • регуляція експресії генів • mRNA processing • RNA secondary structure unwinding • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9879	212880
Ensembl	ENSG00000145833	ENSMUSG00000021500
UniProt	Q7L014	Q569Z5
RefSeq (мРНК)	NM_001300860 NM_014829	NM_001282055 NM_145975
RefSeq (білок)	NP_001287789 NP_055644	NP_001268984
Локус (UCSC)	Хр. 5: 134.76 – 134.86 Mb	Хр. 13: 55.78 – 55.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX46 (англ. DEAD-box helicase 46) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 031 амінокислот, а молекулярна маса — 117 362.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRESRHYRK		RSASRGRSGS		RSRSRSPSDK		RSKRGDDRRS		RSRDRDRRRE
RSRSRDKRRS		RSRDRKRLRR		SRSRERDRSR		ERRRSRSRDR		RRSRSRSRGR
RSRSSSPGNK		SKKTENRSRS		KEKTDGGESS		KEKKKDKDDK		EDEKEKDAGN
FDQNKLEEEM		RKRKERVEKW		REEQRKKAME		NIGELKKEIE		EMKQGKKWSL
EDDDDDEDDP		AEAEKEGNEM		EGEELDPLDA		YMEEVKEEVK		KFNMRSVKGG
GGNEKKSGPT		VTKVVTVVTT		KKAVVDSDKK		KGELMENDQD		AMEYSSEEEE
VDLQTALTGY		QTKQRKLLEP		VDHGKIEYEP		FRKNFYVEVP		ELAKMSQEEV
NVFRLEMEGI		TVKGKGCPKP		IKSWVQCGIS		MKILNSLKKH		GYEKPTPIQT
QAIPAIMSGR		DLIGIAKTGS		GKTIAFLLPM		FRHIMDQRSL		EEGEGPIAVI
MTPTRELALQ		ITKECKKFSK		TLGLRVVCVY		GGTGISEQIA		ELKRGAEIIV
CTPGRMIDML		AANSGRVTNL		RRVTYVVLDE		ADRMFDMGFE		PQVMRIVDNV
RPDRQTVMFS		ATFPRAMEAL		ARRILSKPIE		VQVGGRSVVC		SDVEQQVIVI
EEEKKFLKLL		ELLGHYQESG		SVIIFVDKQE		HADGLLKDLM		RASYPCMSLH
GGIDQYDRDS		IINDFKNGTC		KLLVATSVAA		RGLDVKHLIL		VVNYSCPNHY
EDYVHRAGRT		GRAGNKGYAY		TFITEDQARY		AGDIIKALEL		SGTAVPPDLE
KLWSDFKDQQ		KAEGKIIKKS		SGFSGKGFKF		DETEQALANE		RKKLQKAALG
LQDSDDEDAA		VDIDEQIESM		FNSKKRVKDM		AAPGTSSVPA		PTAGNAEKLE
IAKRLALRIN		AQKNLGIESQ		DVMQQATNAI		LRGGTILAPT		VSAKTIAEQL
AEKINAKLNY		VPLEKQEEER		QDGGQNESFK		RYEEELEIND		FPQTARWKVT
SKEALQRISE		YSEAAITIRG		TYFPPGKEPK		EGERKIYLAI		ESANELAVQK
AKAEITRLIK		EELIRLQNSY		QPTNKGRYKV		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5