DDX47

DDX47
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BER
Ідентифікатори
Символи	DDX47, E4-DBP, HQ0256, MSTP162, RRP3, DEAD-box helicase 47
Зовнішні ІД	OMIM: 615428 MGI: 1915005 HomoloGene: 6092 GeneCards: DDX47
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • mRNA processing • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • RNA secondary structure unwinding • Сплайсинг РНК • GO:0097285 апоптоз • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51202	67755
Ensembl	ENSG00000213782	ENSMUSG00000030204
UniProt	Q9H0S4	Q9CWX9
RefSeq (мРНК)	NM_201224 NM_016355	NM_026360
RefSeq (білок)	NP_057439 NP_957518	NP_080636
Локус (UCSC)	Хр. 12: 12.81 – 12.83 Mb	Хр. 6: 134.99 – 135 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX47 (англ. DEAD-box helicase 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 455 амінокислот, а молекулярна маса — 50 647.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPEEHDSP		TEASQPIVEE		EETKTFKDLG		VTDVLCEACD		QLGWTKPTKI
QIEAIPLALQ		GRDIIGLAET		GSGKTGAFAL		PILNALLETP		QRLFALVLTP
TRELAFQISE		QFEALGSSIG		VQSAVIVGGI		DSMSQSLALA		KKPHIIIATP
GRLIDHLENT		KGFNLRALKY		LVMDEADRIL		NMDFETEVDK		ILKVIPRDRK
TFLFSATMTK		KVQKLQRAAL		KNPVKCAVSS		KYQTVEKLQQ		YYIFIPSKFK
DTYLVYILNE		LAGNSFMIFC		STCNNTQRTA		LLLRNLGFTA		IPLHGQMSQS
KRLGSLNKFK		AKARSILLAT		DVASRGLDIP		HVDVVVNFDI		PTHSKDYIHR
VGRTARAGRS		GKAITFVTQY		DVELFQRIEH		LIGKKLPGFP		TQDDEVMMLT
ERVAEAQRFA		RMELREHGEK		KKRSREDAGD		NDDTEGAIGV		RNKVAGGKMK
KRKGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, процесмнг рРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee J.H., Rho S.B., Chun T. (2005). GABAA receptor-associated protein (GABARAP) induces apoptosis by interacting with DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 47 (DDX 47). Biotechnol. Lett. 27: 623—628. PMID 15977068 DOI:10.1007/s10529-005-3628-2
• Sekiguchi T., Hayano T., Yanagida M., Takahashi N., Nishimoto T. (2006). NOP132 is required for proper nucleolus localization of DEAD-box RNA helicase DDX47. Nucleic Acids Res. 34: 4593—4608. PMID 16963496 DOI:10.1093/nar/gkl603

Див. також

• Хромосома 12