DHX16

DHX16
Ідентифікатори
Символи	DHX16, DBP2, DDX16, PRO2014, PRP8, PRPF2, Prp2, DEAH-box helicase 16, NMOAS
Зовнішні ІД	OMIM: 603405 MGI: 1916442 HomoloGene: 2658 GeneCards: DHX16
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA helicase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • ATPase activity • RNA binding • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity Клітинна компонента • spliceosomal complex • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8449	69192
Ensembl	ENSG00000233561 ENSG00000206486 ENSG00000233418 ENSG00000231377 ENSG00000227222 ENSG00000204560 ENSG00000233049 ENSG00000226171	ENSMUSG00000024422
UniProt	O60231 Q5SQH5	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001164239 NM_003587 NM_001363515	NM_026987
RefSeq (білок)	NP_001157711 NP_003578 NP_001350444	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.65 – 30.67 Mb	Хр. 17: 36.19 – 36.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DHX16 (англ. DEAH-box helicase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 041 амінокислот, а молекулярна маса — 119 264.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPAGLERW		VQDELHSVLG		LSERHVAQFL		IGTAQRCTSA		EEFVQRLRDT
DTLDLSGPAR		DFALRLWNKV		PRKAVVEKPA		RAAEREARAL		LEKNRSYRLL
EDSEESSEET		VSRAGSSLQK		KRKKRKHLRK		KREEEEEEEA		SEKGKKKTGG
SKQQTEKPES		EDEWERTERE		RLQDLEERDA		FAERVRQRDK		DRTRNVLERS
DKKAYEEAQK		RLKMAEEDRK		AMVPELRKKS		RREYLAKRER		EKLEDLEAEL
ADEEFLFGDV		ELSRHERQEL		KYKRRVRDLA		REYRAAGEQE		KLEATNRYHM
PKETRGQPAR		AVDLVEEESG		APGEEQRRWE		EARLGAASLK		FGARDAASQE
PKYQLVLEEE		ETIEFVRATQ		LQGDEEPSAP		PTSTQAQQKE		SIQAVRRSLP
VFPFREELLA		AIANHQVLII		EGETGSGKTT		QIPQYLFEEG		YTNKGMKIAC
TQPRRVAAMS		VAARVAREMG		VKLGNEVGYS		IRFEDCTSER		TVLRYMTDGM
LLREFLSEPD		LASYSVVMVD		EAHERTLHTD		ILFGLIKDVA		RFRPELKVLV
ASATMDTARF		STFFDDAPVF		RIPGRRFPVD		IFYTKAPEAD		YLEACVVSVL
QIHVTQPPGD		ILVFLTGQEE		IEAACEMLQD		RCRRLGSKIR		ELLVLPIYAN
LPSDMQARIF		QPTPPGARKV		VVATNIAETS		LTIEGIIYVL		DPGFCKQKSY
NPRTGMESLT		VTPCSKASAN		QRAGRAGRVA		AGKCFRLYTA		WAYQHELEET
TVPEIQRTSL		GNVVLLLKSL		GIHDLMHFDF		LDPPPYETLL		LALEQLYALG
ALNHLGELTT		SGRKMAELPV		DPMLSKMILA		SEKYSCSEEI		LTVAAMLSVN
NSIFYRPKDK		VVHADNARVN		FFLPGGDHLV		LLNVYTQWAE		SGYSSQWCYE
NFVQFRSMRR		ARDVREQLEG		LLERVEVGLS		SCQGDYIRVR		KAITAGYFYH
TARLTRSGYR		TVKQQQTVFI		HPNSSLFEQQ		PRWLLYHELV		LTTKEFMRQV
LEIESSWLLE		VAPHYYKAKE		LEDPHAKKMP		KKIGKTREEL		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 6