DHX38

DHX38
Ідентифікатори
Символи	DHX38, DDX38, PRP16, PRPF16, DEAH-box helicase 38, RP84
Зовнішні ІД	OMIM: 605584 MGI: 1927617 HomoloGene: 8512 GeneCards: DHX38
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • RNA binding • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9785	64340
Ensembl	ENSG00000140829	ENSMUSG00000037993
UniProt	Q92620	Q80X98
RefSeq (мРНК)	NM_014003	NM_178380
RefSeq (білок)	NP_054722	NP_848467
Локус (UCSC)	Хр. 16: 72.09 – 72.11 Mb	Хр. 8: 110.27 – 110.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DHX38 (англ. DEAH-box helicase 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 227 амінокислот, а молекулярна маса — 140 503.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDTSEDASI		HRLEGTDLDC		QVGGLICKSK		SAASEQHVFK		APAPRPSLLG
LDLLASLKRR		EREEKDDGED		KKKSKVSSYK		DWEESKDDQK		DAEEEGGDQA
GQNIRKDRHY		RSARVETPSH		PGGVSEEFWE		RSRQRERERR		EHGVYASSKE
EKDWKKEKSR		DRDYDRKRDR		DERDRSRHSS		RSERDGGSER		SSRRNEPESP
RHRPKDAATP		SRSTWEEEDS		GYGSSRRSQW		ESPSPTPSYR		DSERSHRLST
RDRDRSVRGK		YSDDTPLPTP		SYKYNEWADD		RRHLGSTPRL		SRGRGRREEG
EEGISFDTEE		ERQQWEDDQR		QADRDWYMMD		EGYDEFHNPL		AYSSEDYVRR
REQHLHKQKQ		KRISAQRRQI		NEDNERWETN		RMLTSGVVHR		LEVDEDFEED
NAAKVHLMVH		NLVPPFLDGR		IVFTKQPEPV		IPVKDATSDL		AIIARKGSQT
VRKHREQKER		KKAQHKHWEL		AGTKLGDIMG		VKKEEEPDKA		VTEDGKVDYR
TEQKFADHMK		RKSEASSEFA		KKKSILEQRQ		YLPIFAVQQE		LLTIIRDNSI
VIVVGETGSG		KTTQLTQYLH		EDGYTDYGMI		GCTQPRRVAA		MSVAKRVSEE
MGGNLGEEVG		YAIRFEDCTS		ENTLIKYMTD		GILLRESLRE		ADLDHYSAII
MDEAHERSLN		TDVLFGLLRE		VVARRSDLKL		IVTSATMDAE		KFAAFFGNVP
IFHIPGRTFP		VDILFSKTPQ		EDYVEAAVKQ		SLQVHLSGAP		GDILIFMPGQ
EDIEVTSDQI		VEHLEELENA		PALAVLPIYS		QLPSDLQAKI		FQKAPDGVRK
CIVATNIAET		SLTVDGIMFV		IDSGYCKLKV		FNPRIGMDAL		QIYPISQANA
NQRSGRAGRT		GPGQCFRLYT		QSAYKNELLT		TTVPEIQRTN		LANVVLLLKS
LGVQDLLQFH		FMDPPPEDNM		LNSMYQLWIL		GALDNTGGLT		STGRLMVEFP
LDPALSKMLI		VSCDMGCSSE		ILLIVSMLSV		PAIFYRPKGR		EEESDQIREK
FAVPESDHLT		YLNVYLQWKN		NNYSTIWCND		HFIHAKAMRK		VREVRAQLKD
IMVQQRMSLA		SCGTDWDIVR		KCICAAYFHQ		AAKLKGIGEY		VNIRTGMPCH
LHPTSSLFGM		GYTPDYIVYH		ELVMTTKEYM		QCVTAVDGEW		LAELGPMFYS
VKQAGKSRQE		NRRRAKEEAS		AMEEEMALAE		EQLRARRQEQ		EKRSPLGSVR
STKIYTPGRK		EQGEPMTPRR		TPARFGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhou Z., Reed R. (1998). Human homologs of yeast prp16 and prp17 reveal conservation of the mechanism for catalytic step II of pre-mRNA splicing. EMBO J. 17: 2095—2106. PMID 9524131 DOI:10.1093/emboj/17.7.2095
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 16