DHX8

DHX8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EQS, 3I4U
Ідентифікатори
Символи	DHX8, DDX8, HRH1, PRP22, PRPF22, DEAH-box helicase 8, Dhr2
Зовнішні ІД	OMIM: 600396 MGI: 1306823 HomoloGene: 3628 GeneCards: DHX8
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity • identical protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • ядерні тільця • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • spliceosomal complex disassembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1659	217207
Ensembl	ENSG00000067596	ENSMUSG00000034931
UniProt	Q14562 Q05CV4	A2A4P0
RefSeq (мРНК)	NM_001302623 NM_004941 NM_001322216 NM_001322217 NM_001322218 NM_001322219 NM_001322220 NM_001322221	NM_144831
RefSeq (білок)	NP_001289552 NP_001309145 NP_001309146 NP_001309147 NP_001309148 NP_001309149 NP_001309150 NP_004932 NP_001289552.1 NP_004932.1	NP_659080
Локус (UCSC)	Хр. 17: 43.48 – 43.61 Mb	Хр. 11: 101.62 – 101.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DHX8 (англ. DEAH-box helicase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 220 амінокислот, а молекулярна маса — 139 315.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVAVAMAGA		LIGSEPGPAE		ELAKLEYLSL		VSKVCTELDN		HLGINDKDLA
EFVISLAEKN		TTFDTFKASL		VKNGAEFTDS		LISNLLRLIQ		TMRPPAKPST
SKDPVVKPKT		EKEKLKELFP		VLCQPDNPSV		RTMLDEDDVK		VAVDVLKELE
ALMPSAAGQE		KQRDAEHRDR		TKKKKRSRSR		DRNRDRDRDR		ERNRDRDHKR
RHRSRSRSRS		RTRERNKVKS		RYRSRSRSQS		PPKDRKDRDK		YGERNLDRWR
DKHVDRPPPE		EPTIGDIYNG		KVTSIMQFGC		FVQLEGLRKR		WEGLVHISEL
RREGRVANVA		DVVSKGQRVK		VKVLSFTGTK		TSLSMKDVDQ		ETGEDLNPNR
RRNLVGETNE		ETSMRNPDRP		THLSLVSAPE		VEDDSLERKR		LTRISDPEKW
EIKQMIAANV		LSKEEFPDFD		EETGILPKVD		DEEDEDLEIE		LVEEEPPFLR
GHTKQSMDMS		PIKIVKNPDG		SLSQAAMMQS		ALAKERRELK		QAQREAEMDS
IPMGLNKHWV		DPLPDAEGRQ		IAANMRGIGM		MPNDIPEWKK		HAFGGNKASY
GKKTQMSILE		QRESLPIYKL		KEQLVQAVHD		NQILIVIGET		GSGKTTQITQ
YLAEAGYTSR		GKIGCTQPRR		VAAMSVAKRV		SEEFGCCLGQ		EVGYTIRFED
CTSPETVIKY		MTDGMLLREC		LIDPDLTQYA		IIMLDEAHER		TIHTDVLFGL
LKKTVQKRQD		MKLIVTSATL		DAVKFSQYFY		EAPIFTIPGR		TYPVEILYTK
EPETDYLDAS		LITVMQIHLT		EPPGDILVFL		TGQEEIDTAC		EILYERMKSL
GPDVPELIIL		PVYSALPSEM		QTRIFDPAPP		GSRKVVIATN		IAETSLTIDG
IYYVVDPGFV		KQKVYNSKTG		IDQLVVTPIS		QAQAKQRAGR		AGRTGPGKCY
RLYTERAYRD		EMLTTNVPEI		QRTNLASTVL		SLKAMGINDL		LSFDFMDAPP
METLITAMEQ		LYTLGALDDE		GLLTRLGRRM		AEFPLEPMLC		KMLIMSVHLG
CSEEMLTIVS		MLSVQNVFYR		PKDKQALADQ		KKAKFHQTEG		DHLTLLAVYN
SWKNNKFSNP		WCYENFIQAR		SLRRAQDIRK		QMLGIMDRHK		LDVVSCGKST
VRVQKAICSG		FFRNAAKKDP		QEGYRTLIDQ		QVVYIHPSSA		LFNRQPEWVV
YHELVLTTKE		YMREVTTIDP		RWLVEFAPAF		FKVSDPTKLS		KQKKQQRLEP
LYNRYEEPNA		WRISRAFRRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Ono Y., Ohno M., Shimura Y. (1994). Identification of a putative RNA helicase (HRH1), a human homolog of yeast Prp22. Mol. Cell. Biol. 14: 7611—7620. PMID 7935475 DOI:10.1128/MCB.14.11.7611
• Ohno M., Shimura Y. (1996). A human RNA helicase-like protein, HRH1, facilitates nuclear export of spliced mRNA by releasing the RNA from the spliceosome. Genes Dev. 10: 997—1007. PMID 8608946 DOI:10.1101/gad.10.8.997
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Neuhaus E.M., Mashukova A., Barbour J., Wolters D., Hatt H. (2006). Novel function of beta-arrestin2 in the nucleus of mature spermatozoa. J. Cell Sci. 119: 3047—3056. PMID 16820410 DOI:10.1242/jcs.03046

Див. також

• Хромосома 17