ECD

ECD
Ідентифікатори
Символи	ECD, GCR2, HSGT1, SGT1, ecdysoneless cell cycle regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 616464 MGI: 1917851 HomoloGene: 5256 GeneCards: ECD
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • R2TP complex • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of glycolytic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Сплайсинг РНК • mRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11319	70601
Ensembl	ENSG00000122882	ENSMUSG00000021810
UniProt	O95905	Q9CS74
RefSeq (мРНК)	NM_001135752 NM_001135753 NM_007265	NM_027475
RefSeq (білок)	NP_001129224 NP_001129225 NP_009196	NP_081751
Локус (UCSC)	Хр. 10: 73.13 – 73.17 Mb	Хр. 14: 20.37 – 20.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ECD (англ. Ecdysoneless cell cycle regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 644 амінокислот, а молекулярна маса — 72 758.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEETMKLATM		EDTVEYCLFL		IPDESRDSDK		HKEILQKYIE		RIITRFAPML
VPYIWQNQPF		NLKYKPGKGG		VPAHMFGVTK		FGDNIEDEWF		IVYVIKQITK
EFPELVARIE		DNDGEFLLIE		AADFLPKWLD		PENSTNRVFF		CHGELCIIPA
PRKSGAESWL		PTTPPTIPQA		LNIITAHSEK		ILASESIRAA		VNRRIRGYPE
KIQASLHRAH		CFLPAGIVAV		LKQRPRLVAA		AVQAFYLRDP		IDLRACRVFK
TFLPETRIMT		SVTFTKCLYA		QLVQQRFVPD		RRSGYRLPPP		SDPQYRAHEL
GMKLAHGFEI		LCSKCSPHFS		DCKKSLVTAS		PLWASFLESL		KKNDYFKGLI
EGSAQYRERL		EMAENYFQLS		VDWPESSLAM		SPGEEILTLL		QTIPFDIEDL
KKEAANLPPE		DDDQWLDLSP		DQLDQLLQEA		VGKKESESVS		KEEKEQNYDL
TEVSESMKAF		ISKVSTHKGA		ELPREPSEAP		ITFDADSFLN		YFDKILGPRP
NESDSDDLDD		EDFECLDSDD		DLDFETHEPG		EEASLKGTLD		NLKSYMAQMD
QELAHTCISK		SFTTRNQVEP		VSQTTDNNSD		EEDSGTGESV		MAPVDVDLNL
VSNILESYSS		QAGLAGPASN		LLQSMGVQLP		DNTDHRPTSK		PTKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Sato T., Jigami Y., Suzuki T., Uemura H. (1999). A human gene, hSGT1, can substitute for GCR2, which encodes a general regulatory factor of glycolytic gene expression in Saccharomyces cerevisiae. Mol. Gen. Genet. 260: 535—540. PMID 9928932 DOI:10.1007/s004380050926
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim J.H., Gurumurthy C.B., Band H., Band V. (2010). Biochemical characterization of human Ecdysoneless reveals a role in transcriptional regulation. Biol. Chem. 391: 9—19. PMID 19919181 DOI:10.1515/BC.2010.004
• Claudius A.K., Romani P., Lamkemeyer T., Jindra M., Uhlirova M. (2014). Unexpected role of the steroid-deficiency protein ecdysoneless in pre-mRNA splicing. PLoS Genet. 10: E1004287—E1004287. PMID 24722212 DOI:10.1371/journal.pgen.1004287

Див. також

• Хромосома 10