ELF3

ELF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E8P
Ідентифікатори
Символи	ELF3, EPR-1, ERT, ESE-1, ESX, E74 like ETS transcription factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602191 MGI: 1101781 HomoloGene: 3265 GeneCards: ELF3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • epithelial cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • extracellular matrix organization • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • epidermis development • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • blastocyst development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • mammary gland involution • positive regulation of Notch signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1999	13710
Ensembl	ENSG00000163435	ENSMUSG00000003051
UniProt	P78545	Q3UPW2
RefSeq (мРНК)	NM_001114309 NM_004433	NM_001163131 NM_007921
RefSeq (білок)	NP_001107781 NP_004424	NP_001156603 NP_031947
Локус (UCSC)	Хр. 1: 202.01 – 202.02 Mb	Хр. 1: 135.18 – 135.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ELF3 (англ. E74 like ETS transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 371 амінокислот, а молекулярна маса — 41 454.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAATCEISNI		FSNYFSAMYS		SEDSTLASVP		PAATFGADDL		VLTLSNPQMS
LEGTEKASWL		GEQPQFWSKT		QVLDWISYQV		EKNKYDASAI		DFSRCDMDGA
TLCNCALEEL		RLVFGPLGDQ		LHAQLRDLTS		SSSDELSWII		ELLEKDGMAF
QEALDPGPFD		QGSPFAQELL		DDGQQASPYH		PGSCGAGAPS		PGSSDVSTAG
TGASRSSHSS		DSGGSDVDLD		PTDGKLFPSD		GFRDCKKGDP		KHGKRKRGRP
RKLSKEYWDC		LEGKKSKHAP		RGTHLWEFIR		DILIHPELNE		GLMKWENRHE
GVFKFLRSEA		VAQLWGQKKK		NSNMTYEKLS		RAMRYYYKRE		ILERVDGRRL
VYKFGKNSSG		WKEEEVLQSR		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Chang C.-H., Scott G.K., Baldwin M.A., Benz C.C. (1999). Exon 4-encoded acidic domain in the epithelium-restricted Ets factor, ESX, confers potent transactivating capacity and binds to TATA-binding protein (TBP). Oncogene. 18: 3682—3695. PMID 10391676 DOI:10.1038/sj.onc.1202674
• Kaplan M.H., Wang X.P., Xu H.P., Dosik M.H. (2004). Partially unspliced and fully spliced ELF3 mRNA, including a new Alu element in human breast cancer. Breast Cancer Res. Treat. 83: 171—187. PMID 14997048 DOI:10.1023/B:BREA.0000010710.51614.2d
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brembeck F.H., Opitz O.G., Libermann T.A., Rustgi A.K. (2000). Dual function of the epithelial specific ets transcription factor, ELF3, in modulating differentiation. Oncogene. 19: 1941—1949. PMID 10773884 DOI:10.1038/sj.onc.1203441
• Park S.H., Kim Y.S., Park B.-K., Hougaard S., Kim S.-J. (2001). Sequence-specific enhancer binding protein is responsible for the differential expression of ERT/ESX/ELF-3/ESE-1/jen gene in human gastric cancer cell lines: implication for the loss of TGF-beta type II receptor expression. Oncogene. 20: 1235—1245. PMID 11313868 DOI:10.1038/sj.onc.1204227
• Neve R.M., Ylstra B., Chang C.-H., Albertson D.G., Benz C.C. (2002). ErbB2 activation of ESX gene expression. Oncogene. 21: 3934—3938. PMID 12032832 DOI:10.1038/sj.onc.1205503

Див. також

• Хромосома 1