FDPS

FDPS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YQ7, 1YV5, 1ZW5, 2F7M, 2F89, 2F8C, 2F8Z, 2F92, 2F94, 2F9K, 2OPM, 2OPN, 2QIS, 2RAH, 2VF6, 3B7L, 3CP6, 3N1V, 3N1W, 3N3L, 3N45, 3N46, 3N49, 3N5H, 3N5J, 3N6K, 3RYE, 3S4J, 4DEM, 4GA3, 4H5C, 4H5D, 4H5E, 4JVJ, 4KFA, 4KPD, 4KPJ, 4KQ5, 4KQS, 4KQU, 4L2X, 4LFV, 4LPG, 4LPH, 4N1Z, 4N9U, 4NFI, 4NFJ, 4NFK, 4NG6, 4NKE, 4NKF, 4NUA, 4OGU, 4P0V, 4P0W, 4P0X, 4PVX, 4PVY, 4Q23, 4QPF, 4QXS, 4RXA, 4XQR, 5CG5, 5DIQ, 5CG6, 5DJR, 5DJP, 4XQS, 5DJV, 5DGN, 4XQT, 5DGM, 5DGS
Ідентифікатори
Символи	FDPS, FPPS, FPS, POROK9, farnesyl diphosphate synthase
Зовнішні ІД	OMIM: 134629 MGI: 104888 HomoloGene: 1519 GeneCards: FDPS
шифр КФ	2.5.1.1
Реагує на сполуку
	cimadronate, Пірофосфатна кислота, ibandronic acid, isopentenyl pyrophosphate, minodronic acid, zoledronic acid
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • зв'язування з іоном металу; • geranyltranstransferase activity; • dimethylallyltranstransferase activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма; • мітохондрія;
Біологічний процес	• cholesterol biosynthetic process; • steroid metabolic process; • GO:0022415 viral process; • cholesterol metabolic process; • geranyl diphosphate biosynthetic process; • sterol biosynthetic process; • isoprenoid biosynthetic process; • lipid metabolism; • steroid biosynthetic process; • farnesyl diphosphate biosynthetic process; • regulation of cholesterol biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2224
	110196
	ENSG00000160752
	ENSMUSG00000059743
	P14324
	Q920E5
NM_001135821; NM_001135822; NM_001242824; NM_001242825; NM_002004;
	NM_001378424; NM_001378425
	NM_001253751; NM_134469; NM_180985
NP_001129293; NP_001129294; NP_001229753; NP_001229754; NP_001995;
	NP_001365353; NP_001365354
	NP_001240680; NP_608219
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FDPS (англ. Farnesyl diphosphate synthase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 48 275^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLSRWLRSV	GVFLLPAPYW	APRERWLGSL	RRPSLVHGYP	VLAWHSARCW
CQAWTEEPRA	LCSSLRMNGD	QNSDVYAQEK	QDFVQHFSQI	VRVLTEDEMG
HPEIGDAIAR	LKEVLEYNAI	GGKYNRGLTV	VVAFRELVEP	RKQDADSLQR
AWTVGWCVEL	LQAFFLVADD	IMDSSLTRRG	QICWYQKPGV	GLDAINDANL
LEACIYRLLK	LYCREQPYYL	NLIELFLQSS	YQTEIGQTLD	LLTAPQGNVD
LVRFTEKRYK	SIVKYKTAFY	SFYLPIAAAM	YMAGIDGEKE	HANAKKILLE
MGEFFQIQDD	YLDLFGDPSV	TGKIGTDIQD	NKCSWLVVQC	LQRATPEQYQ
ILKENYGQKE	AEKVARVKAL	YEELDLPAVF	LQYEEDSYSH	IMALIEQYAA
PLPPAVFLGL	ARKIYKRRK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, біосинтез ліпідів, біосинтез холестеролу, біосинтез стероїдів, біосинтез стеролів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang X., Hinson E.R., Cresswell P. (2007). The interferon-inducible protein viperin inhibits influenza virus release by perturbing lipid rafts. Cell Host Microbe. 2: 96—105. PMID 18005724 DOI:10.1016/j.chom.2007.06.009
Wilkin D.J., Kutsunai S.Y., Edwards P.A. (1990). Isolation and sequence of the human farnesyl pyrophosphate synthetase cDNA. Coordinate regulation of the mRNAs for farnesyl pyrophosphate synthetase, 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase, and 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase by phorbol ester. J. Biol. Chem. 265: 4607—4614. PMID 1968462
Szkopinska A., Plochocka D. (2005). Farnesyl diphosphate synthase; regulation of product specificity. Acta Biochim. Pol. 52: 45—55. PMID 15827605

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з farnesyl diphosphate synthase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3631 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.
↑ UniProt, P14324 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з farnesyl diphosphate synthase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3631 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P14324 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

FDPS

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук