FIGNL1

FIGNL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3D8B
Ідентифікатори
Символи	FIGNL1, fidgetin like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615383 MGI: 1890648 HomoloGene: 11063 GeneCards: FIGNL1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • ATPase activity • microtubule-severing ATPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear chromosome • екзосома • клітинне ядро • perinuclear region of cytoplasm Біологічний процес • cellular response to ionizing radiation • ATP metabolic process • negative regulation of apoptotic process • osteoblast proliferation • osteoblast differentiation • regulation of double-strand break repair via homologous recombination • regulation of cell cycle • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • male meiotic nuclear division • cytoplasmic microtubule organization • microtubule severing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63979	60530
Ensembl	ENSG00000132436	ENSMUSG00000035455
UniProt	Q6PIW4	Q8BPY9
RefSeq (мРНК)	NM_001042762 NM_001287492 NM_001287493 NM_001287494 NM_001287495 NM_001287496 NM_001346558 NM_001346559 NM_001346560 NM_001346561 NM_001346562 NM_001346563 NM_001346564 NM_001346565 NM_022116	NM_001163359 NM_001163360 NM_021891
RefSeq (білок)	NP_001036227 NP_001274421 NP_001274422 NP_001274423 NP_001274424 NP_001274425 NP_001333487 NP_001333488 NP_001333489 NP_001333490 NP_001333491 NP_001333492 NP_001333493 NP_001333494 NP_071399	NP_001156831 NP_001156832 NP_068691
Локус (UCSC)	Хр. 7: 50.44 – 50.54 Mb	Хр. 11: 11.74 – 11.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FIGNL1 (англ. Fidgetin like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 674 амінокислот, а молекулярна маса — 74 077.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQTSSSRSVH		LSEWQKNYFA		ITSGICTGPK		ADAYRAQILR		IQYAWANSEI
SQVCATKLFK		KYAEKYSAII		DSDNVESGLN		NYAENILTLA		GSQQTDSDKW
QSGLSINNVF		KMSSVQKMMQ		AGKKFKDSLL		EPALASVVIH		KEATVFDLPK
FSVCGSSQES		DSLPNSAHDR		DRTQDFPESN		RLKLLQNAQP		PMVTNTARTC
PTFSAPVGES		ATAKFHVTPL		FGNVKKENHS		SAKENIGLNV		FLSNQSCFPA
ACENPQRKSF		YGSGTIDALS		NPILNKACSK		TEDNGPKEDS		SLPTFKTAKE
QLWVDQQKKY		HQPQRASGSS		YGGVKKSLGA		SRSRGILGKF		VPPIPKQDGG
EQNGGMQCKP		YGAGPTEPAH		PVDERLKNLE		PKMIELIMNE		IMDHGPPVNW
EDIAGVEFAK		ATIKEIVVWP		MLRPDIFTGL		RGPPKGILLF		GPPGTGKTLI
GKCIASQSGA		TFFSISASSL		TSKWVGEGEK		MVRALFAVAR		CQQPAVIFID
EIDSLLSQRG		DGEHESSRRI		KTEFLVQLDG		ATTSSEDRIL		VVGATNRPQE
IDEAARRRLV		KRLYIPLPEA		SARKQIVINL		MSKEQCCLSE		EEIEQIVQQS
DAFSGADMTQ		LCREASLGPI		RSLQTADIAT		ITPDQVRPIA		YIDFENAFRT
VRPSVSPKDL		ELYENWNKTF		GCGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yuan J., Chen J. (2013). FIGNL1-containing protein complex is required for efficient homologous recombination repair. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 10640—10645. PMID 23754376 DOI:10.1073/pnas.1220662110

Див. також

• Хромосома 7