GLIS3

GLIS3
Ідентифікатори
Символи	GLIS3, ZNF515, GLIS family zinc finger 3, NDH
Зовнішні ІД	OMIM: 610192 MGI: 2444289 HomoloGene: 34989 GeneCards: GLIS3
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу, хвороба Альцгеймера, цукровий діабет тип 1, neonatal diabetes mellitus with congenital hypothyroidism
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	169792	226075
Ensembl	ENSG00000107249	ENSMUSG00000052942
UniProt	Q8NEA6	Q6XP49
RefSeq (мРНК)	NM_001042413 NM_152629	NM_175459 NM_001305671
RefSeq (білок)	NP_001035878 NP_689842	NP_001292600 NP_780668 NP_001391053
Локус (UCSC)	Хр. 9: 3.82 – 4.35 Mb	Хр. 19: 28.24 – 28.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GLIS3 (англ. GLIS family zinc finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 775 амінокислот, а молекулярна маса — 83 636.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMVQRLGLIS		PPASQVSTAC		NQISPSLQRA		MNAANLNIPP		SDTRSLISRE
SLASTTLSLT		ESQSASSMKQ		EWSQGYRALP		SLSNHGSQNG		LDLGDLLSLP
PGTSMSSNSV		SNSLPSYLFG		TESSHSPYPS		PRHSSTRSHS		ARSKKRALSL
SPLSDGIGID		FNTIIRTSPT		SLVAYINGSR		ASPANLSPQP		EVYGHFLGVR
GSCIPQPRPV		PGSQKGVLVA		PGGLALPAYG		EDGALEHERM		QQLEHGGLQP
GLVNHMVVQH		GLPGPDSQSA		GLFKTERLEE		FPGSTVDLPP		APPLPPLPPP
PGPPPPYHAH		AHLHHPELGP		HAQQLALPQA		TLDDDGEMDG		IGGKHCCRWI
DCSALYDQQE		ELVRHIEKVH		IDQRKGEDFT		CFWAGCPRRY		KPFNARYKLL
IHMRVHSGEK		PNKCTFEGCE		KAFSRLENLK		IHLRSHTGEK		PYLCQHPGCQ
KAFSNSSDRA		KHQRTHLDTK		PYACQIPGCT		KRYTDPSSLR		KHVKAHSSKE
QQARKKLRSS		TELHPDLLTD		CLTVQSLQPA		TSPRDAAAEG		TVGRSPGPGP
DLYSAPIFSS		NYSSRSGTAA		GAVPPPHPVS		HPSPGHNVQG		SPHNPSSQLP
PLTAVDAGAE		RFAPSAPSPH		HISPRRVPAP		SSILQRTQPP		YTQQPSGSHL
KSYQPETNSS		FQPNGIHVHG		FYGQLQKFCP		PHYPDSQRIV		PPVSSCSVVP
SFEDCLVPTS		MGQASFDVFH		RAFSTHSGIT		VYDLPSSSSS		LFGESLRSGA
EDATFLQIST		VDRCPSQLSS		VYTEG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim Y.-S., Nakanishi G., Lewandoski M., Jetten A.M. (2003). GLIS3, a novel member of the GLIS subfamily of Kruppel-like zinc finger proteins with repressor and activation functions. Nucleic Acids Res. 31: 5513—5525. PMID 14500813 DOI:10.1093/nar/gkg776

Див. також

• Хромосома 9