GRID2

GRID2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5KCA, 5KC8
Ідентифікатори
Символи	GRID2, GluD2, SCAR18, glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602368 MGI: 95813 HomoloGene: 74399 GeneCards: GRID2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, autosomal recessive spinocerebellar ataxia 18
Онтологія гена Молекулярна функція • glutamate receptor activity • PDZ domain binding • scaffold protein binding • ion channel activity • ionotropic glutamate receptor activity • extracellularly glutamate-gated ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • dendritic spine • синапс • integral component of plasma membrane • Міжклітинні контакти • ionotropic glutamate receptor complex • somatodendritic compartment • parallel fiber to Purkinje cell synapse • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • glutamate receptor signaling pathway • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • regulation of neuron projection development • synaptic transmission, glutamatergic • regulation of neuron apoptotic process • ion transport • ion transmembrane transport • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • excitatory postsynaptic potential • cerebellar granule cell differentiation • prepulse inhibition • positive regulation of synapse assembly • positive regulation of long-term synaptic depression • excitatory synapse assembly • regulation of postsynaptic density assembly • modulation of chemical synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2895	14804
Ensembl	ENSG00000152208	ENSMUSG00000071424
UniProt	O43424	Q61625
RefSeq (мРНК)	NM_001286838 NM_001510	NM_008167 NM_001370966
RefSeq (білок)	NP_001273767 NP_001501	NP_032193 NP_001357895
Локус (UCSC)	Хр. 4: 92.3 – 93.81 Mb	Хр. 6: 63.23 – 64.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GRID2 (англ. Glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 113 356.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVFPFLLVL		SVWWSRTWDS		ANADSIIHIG		AIFDESAKKD		DEVFRTAVGD
LNQNEEILQT		EKITFSVTFV		DGNNPFQAVQ		EACELMNQGI		LALVSSIGCT
SAGSLQSLAD		AMHIPHLFIQ		RSTAGTPRSG		CGLTRSNRND		DYTLSVRPPV
YLHDVILRVV		TEYAWQKFII		FYDSEYDIRG		IQEFLDKVSQ		QGMDVALQKV
ENNINKMITT		LFDTMRIEEL		NRYRDTLRRA		ILVMNPATAK		SFITEVVETN
LVAFDCHWII		INEEINDVDV		QELVRRSIGR		LTIIRQTFPV		PQNISQRCFR
GNHRISSTLC		DPKDPFAQNM		EISNLYIYDT		VLLLANAFHK		KLEDRKWHSM
ASLSCIRKNS		KPWQGGRSML		ETIKKGGVSG		LTGELEFGEN		GGNPNVHFEI
LGTNYGEELG		RGVRKLGCWN		PVTGLNGSLT		DKKLENNMRG		VVLRVVTVLE
EPFVMVSENV		LGKPKKYQGF		SIDVLDALSN		YLGFNYEIYV		APDHKYGSPQ
EDGTWNGLVG		ELVFKRADIG		ISALTITPDR		ENVVDFTTRY		MDYSVGVLLR
RAEKTVDMFA		CLAPFDLSLW		ACIAGTVLLV		GLLVYLLNWL		NPPRLQMGSM
TSTTLYNSMW		FVYGSFVQQG		GEVPYTTLAT		RMMMGAWWLF		ALIVISSYTA
NLAAFLTITR		IESSIQSLQD		LSKQTEIPYG		TVLDSAVYEH		VRMKGLNPFE
RDSMYSQMWR		MINRSNGSEN		NVLESQAGIQ		KVKYGNYAFV		WDAAVLEYVA
INDPDCSFYT		IGNTVADRGY		GIALQHGSPY		RDVFSQRILE		LQQNGDMDIL
KHKWWPKNGQ		CDLYSSVDTK		QKGGALDIKS		FAGVFCILAA		GIVLSCFIAM
LETWWNKRKG		SRVPSKEDDK		EIDLEHLHRR		VNSLCTDDDS		PHKQFSTSSI
DLTPLDIDTL		PTRQALEQIS		DFRNTHITTT		TFIPEQIQTL		SRTLSAKAAS
GFTFGNVPEH		RTGPFRHRAP		NGGFFRSPIK		TMSSIPYQPT		PTLGLNLGND
PDRGTSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Hu W., Zuo J., De Jager P.L., Heintz N. (1998). The human glutamate receptor delta 2 gene (GRID2) maps to chromosome 4q22. Genomics. 47: 143—145. PMID 9465309 DOI:10.1006/geno.1997.5108
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4