HCFC1

HCFC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GO6, 4N39, 4N3A, 4N3B, 4N3C
Ідентифікатори
Символи	HCFC1, CFF, HCF-1, HCF1, HFC1, MRX3, PPP1R89, VCAF, HCF, Host cell factor C1, XLID3, MAHCX
Зовнішні ІД	OMIM: 300019 MGI: 105942 HomoloGene: 3898 GeneCards: HCFC1
Пов'язані генетичні захворювання
methylmalonic acidemia with homocystinuria, type cblX
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific) • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific) • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific) • cadherin binding • protein-macromolecule adaptor activity • sequence-specific double-stranded DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • SAGA-type complex • Set1C/COMPASS complex • аксон • neuronal cell body • MLL1 complex • дендрит (нейробіологія) • histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • release from viral latency • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • protein stabilization • mitochondrion organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H4-K5 acetylation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of cell cycle • клітинний цикл • histone H4-K16 acetylation • GO:0022415 viral process • histone H4-K8 acetylation • GO:0106159 regulation of protein-containing complex assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • blastocyst hatching • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3054	15161
Ensembl	ENSG00000172534	ENSMUSG00000031386
UniProt	P51610	Q61191
RefSeq (мРНК)	NM_005334	NM_008224
RefSeq (білок)	NP_005325	NP_032250
Локус (UCSC)	Хр. X: 153.95 – 153.97 Mb	Хр. X: 72.99 – 73.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HCFC1 (англ. Host cell factor C1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 035 амінокислот, а молекулярна маса — 208 732.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASAVSPANL		PAVLLQPRWK		RVVGWSGPVP		RPRHGHRAVA		IKELIVVFGG
GNEGIVDELH		VYNTATNQWF		IPAVRGDIPP		GCAAYGFVCD		GTRLLVFGGM
VEYGKYSNDL		YELQASRWEW		KRLKAKTPKN		GPPPCPRLGH		SFSLVGNKCY
LFGGLANDSE		DPKNNIPRYL		NDLYILELRP		GSGVVAWDIP		ITYGVLPPPR
ESHTAVVYTE		KDNKKSKLVI		YGGMSGCRLG		DLWTLDIDTL		TWNKPSLSGV
APLPRSLHSA		TTIGNKMYVF		GGWVPLVMDD		VKVATHEKEW		KCTNTLACLN
LDTMAWETIL		MDTLEDNIPR		ARAGHCAVAI		NTRLYIWSGR		DGYRKAWNNQ
VCCKDLWYLE		TEKPPPPARV		QLVRANTNSL		EVSWGAVATA		DSYLLQLQKY
DIPATAATAT		SPTPNPVPSV		PANPPKSPAP		AAAAPAVQPL		TQVGITLLPQ
AAPAPPTTTT		IQVLPTVPGS		SISVPTAART		QGVPAVLKVT		GPQATTGTPL
VTMRPASQAG		KAPVTVTSLP		AGVRMVVPTQ		SAQGTVIGSS		PQMSGMAALA
AAAAATQKIP		PSSAPTVLSV		PAGTTIVKTM		AVTPGTTTLP		ATVKVASSPV
MVSNPATRML		KTAAAQVGTS		VSSATNTSTR		PIITVHKSGT		VTVAQQAQVV
TTVVGGVTKT		ITLVKSPISV		PGGSALISNL		GKVMSVVQTK		PVQTSAVTGQ
ASTGPVTQII		QTKGPLPAGT		ILKLVTSADG		KPTTIITTTQ		ASGAGTKPTI
LGISSVSPST		TKPGTTTIIK		TIPMSAIITQ		AGATGVTSSP		GIKSPITIIT
TKVMTSGTGA		PAKIITAVPK		IATGHGQQGV		TQVVLKGAPG		QPGTILRTVP
MGGVRLVTPV		TVSAVKPAVT		TLVVKGTTGV		TTLGTVTGTV		STSLAGAGGH
STSASLATPI		TTLGTIATLS		SQVINPTAIT		VSAAQTTLTA		AGGLTTPTIT
MQPVSQPTQV		TLITAPSGVE		AQPVHDLPVS		ILASPTTEQP		TATVTIADSG
QGDVQPGTVT		LVCSNPPCET		HETGTTNTAT		TTVVANLGGH		PQPTQVQFVC
DRQEAAASLV		TSTVGQQNGS		VVRVCSNPPC		ETHETGTTNT		ATTATSNMAG
QHGCSNPPCE		THETGTTNTA		TTAMSSVGAN		HQRDARRACA		AGTPAVIRIS
VATGALEAAQ		GSKSQCQTRQ		TSATSTTMTV		MATGAPCSAG		PLLGPSMARE
PGGRSPAFVQ		LAPLSSKVRL		SSPSIKDLPA		GRHSHAVSTA		AMTRSSVGAG
EPRMAPVCES		LQGGSPSTTV		TVTALEALLC		PSATVTQVCS		NPPCETHETG
TTNTATTSNA		GSAQRVCSNP		PCETHETGTT		HTATTATSNG		GTGQPEGGQQ
PPAGRPCETH		QTTSTGTTMS		VSVGALLPDA		TSSHRTVESG		LEVAAAPSVT
PQAGTALLAP		FPTQRVCSNP		PCETHETGTT		HTATTVTSNM		SSNQDPPPAA
SDQGEVESTQ		GDSVNITSSS		AITTTVSSTL		TRAVTTVTQS		TPVPGPSVPP
PEELQVSPGP		RQQLPPRQLL		QSASTALMGE		SAEVLSASQT		PELPAAVDLS
STGEPSSGQE		SAGSAVVATV		VVQPPPPTQS		EVDQLSLPQE		LMAEAQAGTT
TLMVTGLTPE		ELAVTAAAEA		AAQAAATEEA		QALAIQAVLQ		AAQQAVMGTG
EPMDTSEAAA		TVTQAELGHL		SAEGQEGQAT		TIPIVLTQQE		LAALVQQQQL
QEAQAQQQHH		HLPTEALAPA		DSLNDPAIES		NCLNELAGTV		PSTVALLPST
ATESLAPSNT		FVAPQPVVVA		SPAKLQAAAT		LTEVANGIES		LGVKPDLPPP
PSKAPMKKEN		QWFDVGVIKG		TNVMVTHYFL		PPDDAVPSDD		DLGTVPDYNQ
LKKQELQPGT		AYKFRVAGIN		ACGRGPFSEI		SAFKTCLPGF		PGAPCAIKIS
KSPDGAHLTW		EPPSVTSGKI		IEYSVYLAIQ		SSQAGGELKS		STPAQLAFMR
VYCGPSPSCL		VQSSSLSNAH		IDYTTKPAII		FRIAARNEKG		YGPATQVRWL
QETSKDSSGT		KPANKRPMSS		PEMKSAPKKS		KADGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Wilson A.C., Lamarco K., Peterson M.G., Herr W. (1993). The VP16 accessory protein HCF is a family of polypeptides processed from a large precursor protein. Cell. 74: 115—125. PMID 8392914 DOI:10.1016/0092-8674(93)90299-6
• Kristie T.M., Pomerantz J.L., Twomey T.C., Parent S.A., Sharp P.A. (1995). The cellular C1 factor of the herpes simplex virus enhancer complex is a family of polypeptides. J. Biol. Chem. 270: 4387—4394. PMID 7876203 DOI:10.1074/jbc.270.9.4387
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vogel J.L., Kristie T.M. (2000). Autocatalytic proteolysis of the transcription factor-coactivator C1 (HCF): a potential role for proteolytic regulation of coactivator function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 9425—9430. PMID 10920196 DOI:10.1073/pnas.160266697
• Wilson A.C., Peterson M.G., Herr W. (1995). The HCF repeat is an unusual proteolytic cleavage signal. Genes Dev. 9: 2445—2458. PMID 7590226 DOI:10.1101/gad.9.20.2445
• Lu R., Yang P., O'Hare P., Misra V. (1997). Luman, a new member of the CREB/ATF family, binds to herpes simplex virus VP16-associated host cellular factor. Mol. Cell. Biol. 17: 5117—5126. PMID 9271389 DOI:10.1128/MCB.17.9.5117

Див. також

• Хромосома X