HTATIP2

HTATIP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2BKA
Ідентифікатори
Символи	HTATIP2, CC3, SDR44U1, TIP30, HIV-1 Tat interactive protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605628 MGI: 1859271 HomoloGene: 4676 GeneCards: HTATIP2
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear envelope • мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0022415 viral process • negative regulation of apoptotic process • regulation of angiogenesis • Ангіогенез • import into nucleus • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10553	53415
Ensembl	ENSG00000109854	ENSMUSG00000039745
UniProt	Q9BUP3	Q9Z2G9
RefSeq (мРНК)	NM_006410 NM_001098520 NM_001098521 NM_001098522 NM_001098523	NM_001146049 NM_001146050 NM_001146052 NM_001146053 NM_016865
RefSeq (білок)	NP_001091990 NP_001091991 NP_001091992 NP_001091993 NP_006401	NP_001139521 NP_001139522 NP_001139524 NP_001139525 NP_058561
Локус (UCSC)	Хр. 11: 20.36 – 20.38 Mb	Хр. 7: 49.41 – 49.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HTATIP2 (англ. HIV-1 Tat interactive protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 242 амінокислот, а молекулярна маса — 27 049.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAETEALSKL		REDFRMQNKS		VFILGASGET		GRVLLKEILE		QGLFSKVTLI
GRRKLTFDEE		AYKNVNQEVV		DFEKLDDYAS		AFQGHDVGFC		CLGTTRGKAG
AEGFVRVDRD		YVLKSAELAK		AGGCKHFNLL		SSKGADKSSN		FLYLQVKGEV
EAKVEELKFD		RYSVFRPGVL		LCDRQESRPG		EWLVRKFFGS		LPDSWASGHS
VPVVTVVRAM		LNNVVRPRDK		QMELLENKAI		HDLGKAHGSL		KP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, ангіогенез, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАДФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Shtivelman E. (1997). A link between metastasis and resistance to apoptosis of variant small cell lung carcinoma. Oncogene. 14: 2167—2173. PMID 9174052 DOI:10.1038/sj.onc.1201059
• Xiao H., Tao Y., Greenblatt J., Roeder R.G. (1998). A cofactor, TIP30, specifically enhances HIV-1 Tat-activated transcription. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 2146—2151. PMID 9482853 DOI:10.1073/pnas.95.5.2146
• Whitman S., Wang X., Shalaby R., Shtivelman E. (2000). Alternatively spliced products CC3 and TC3 have opposing effects on apoptosis. Mol. Cell. Biol. 20: 583—593. PMID 10611237 DOI:10.1128/MCB.20.2.583-593.2000
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Xiao H., Palhan V., Yang Y., Roeder R.G. (2000). TIP30 has an intrinsic kinase activity required for up-regulation of a subset of apoptotic genes. EMBO J. 19: 956—963. PMID 10698937 DOI:10.1093/emboj/19.5.956
• NicAmhlaoibh R., Shtivelman E. (2001). Metastasis suppressor CC3 inhibits angiogenic properties of tumor cells in vitro. Oncogene. 20: 270—275. PMID 11313954 DOI:10.1038/sj.onc.1204075

Див. також

• Хромосома 11