HTATSF1

HTATSF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DIT
Ідентифікатори
Символи	HTATSF1, TAT-SF1, TATSF1, dJ196E23.2, HIV-1 Tat specific factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 300346 MGI: 1919709 HomoloGene: 40950 GeneCards: HTATSF1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • U2-type spliceosomal complex • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • viral genome replication • regulation of DNA-templated transcription, elongation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27336	72459
Ensembl	ENSG00000102241	ENSMUSG00000067873
UniProt	O43719	Q8BGC0
RefSeq (мРНК)	NM_001163280 NM_014500	NM_028242 NM_029371
RefSeq (білок)	NP_001156752 NP_055315	NP_082518 NP_083647
Локус (UCSC)	Хр. X: 136.5 – 136.51 Mb	Хр. X: 56.1 – 56.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HTATSF1 (англ. HIV-1 Tat specific factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 755 амінокислот, а молекулярна маса — 85 853.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGTNLDGND		EFDEQLRMQE		LYGDGKDGDT		QTDAGGEPDS		LGQQPTDTPY
EWDLDKKAWF		PKITEDFIAT		YQANYGFSND		GASSSTANVE		DVHARTAEEP
PQEKAPEPTD		ARKKGEKRKA		ESGWFHVEED		RNTNVYVSGL		PPDITVDEFI
QLMSKFGIIM		RDPQTEEFKV		KLYKDNQGNL		KGDGLCCYLK		RESVELALKL
LDEDEIRGYK		LHVEVAKFQL		KGEYDASKKK		KKCKDYKKKL		SMQQKQLDWR
PERRAGPSRM		RHERVVIIKN		MFHPMDFEDD		PLVLNEIRED		LRVECSKFGQ
IRKLLLFDRH		PDGVASVSFR		DPEEADYCIQ		TLDGRWFGGR		QITAQAWDGT
TDYQVEETSR		EREERLRGWE		AFLNAPEANR		GLRRSDSVSA		SERAGPSRAR
HFSEHPSTSK		MNAQETATGM		AFEEPIDEKK		FEKTEDGGEF		EEGASENNAK
ESSPEKEAEE		GCPEKESEEG		CPKRGFEGSC		SQKESEEGNP		VRGSEEDSPK
KESKKKTLKN		DCEENGLAKE		SEDDLNKESE		EEVGPTKESE		EDDSEKESDE
DCSEKQSEDG		SEREFEENGL		EKDLDEEGSE		KELHENVLDK		ELEENDSENS
EFEDDGSEKV		LDEEGSEREF		DEDSDEKEEE		EDTYEKVFDD		ESDEKEDEEY
ADEKGLEAAD		KKAEEGDADE		KLFEESDDKE		DEDADGKEVE		DADEKLFEDD
DSNEKLFDEE		EDSSEKLFDD		SDERGTLGGF		GSVEEGPLST		GSSFILSSDD
DDDDI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhou Q., Sharp P.A. (1996). Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat. Science. 274: 605—610. PMID 8849451 DOI:10.1126/science.274.5287.605
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhou Q., Chen D., Pierstorff E., Luo K. (1998). Transcription elongation factor P-TEFb mediates Tat activation of HIV-1 transcription at multiple stages. EMBO J. 17: 3681—3691. PMID 9649438 DOI:10.1093/emboj/17.13.3681
• Li X.-Y., Green M.R. (1998). The HIV-1 Tat cellular coactivator Tat-SF1 is a general transcription elongation factor. Genes Dev. 12: 2992—2996. PMID 9765201 DOI:10.1101/gad.12.19.2992
• Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
• Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 DOI:10.1128/MCB.19.9.5960

Див. також

• Хромосома X