INSM1

INSM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LV2, 3ZMS
Ідентифікатори
Символи	INSM1, IA-1, IA1, INSM transcriptional repressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600010 MGI: 1859980 HomoloGene: 31080 GeneCards: INSM1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • nucleic acid binding • chromatin DNA binding • cyclin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription repressor complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • sympathetic ganglion development • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • noradrenergic neuron development • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • norepinephrine biosynthetic process • positive regulation of cell migration • pancreatic A cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • positive regulation of neural precursor cell proliferation • adrenal chromaffin cell differentiation • endocrine system development • positive regulation of cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • регуляція експресії генів • клітинний цикл • type B pancreatic cell development • GO:0106159 regulation of protein-containing complex assembly • type B pancreatic cell differentiation • endocrine pancreas development • negative regulation of cell population proliferation • transdifferentiation • regulation of cell cycle process • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3642	53626
Ensembl	ENSG00000173404	ENSMUSG00000068154
UniProt	Q01101	Q63ZV0
RefSeq (мРНК)	NM_002196	NM_016889
RefSeq (білок)	NP_002187	NP_058585
Локус (UCSC)	Хр. 20: 20.37 – 20.37 Mb	Хр. 2: 146.06 – 146.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

INSM1 (англ. INSM transcriptional repressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 52 923.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRGFLVKRS		KKSTPVSYRV		RGGEDGDRAL		LLSPSCGGAR		AEPPAPSPVP
GPLPPPPPAE		RAHAALAAAL		ACAPGPQPPP		QGPRAAHFGN		PEAAHPAPLY
SPTRPVSREH		EKHKYFERSF		NLGSPVSAES		FPTPAALLGG		GGGGGASGAG
GGGTCGGDPL		LFAPAELKMG		TAFSAGAEAA		RGPGPGPPLP		PAAALRPPGK
RPPPPTAAEP		PAKAVKAPGA		KKPKAIRKLH		FEDEVTTSPV		LGLKIKEGPV
EAPRGRAGGA		ARPLGEFICQ		LCKEEYADPF		ALAQHKCSRI		VRVEYRCPEC
AKVFSCPANL		ASHRRWHKPR		PAPAAARAPE		PEAAARAEAR		EAPGGGSDRD
TPSPGGVSES		GSEDGLYECH		HCAKKFRRQA		YLRKHLLAHH		QALQAKGAPL
APPAEDLLAL		YPGPDEKAPQ		EAAGDGEGAG		VLGLSASAEC		HLCPVCGESF
ASKGAQERHL		RLLHAAQVFP		CKYCPATFYS		SPGLTRHINK		CHPSENRQVI
LLQVPVRPAC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Breslin M.B., Zhu M., Notkins A.L., Lan M.S. (2002). Neuroendocrine differentiation factor, IA-1, is a transcriptional repressor and contains a specific DNA-binding domain: identification of consensus IA-1 binding sequence. Nucleic Acids Res. 30: 1038—1045. PMID 11842116 DOI:10.1093/nar/30.4.1038
• Breslin M.B., Zhu M., Lan M.S. (2003). NeuroD1/E47 regulates the E-box element of a novel zinc finger transcription factor, IA-1, in developing nervous system. J. Biol. Chem. 278: 38991—38997. PMID 12890672 DOI:10.1074/jbc.M306795200
• Liu W.D., Wang H.W., Muguira M., Breslin M.B., Lan M.S. (2006). INSM1 functions as a transcriptional repressor of the neuroD/beta2 gene through the recruitment of cyclin D1 and histone deacetylases. Biochem. J. 397: 169—177. PMID 16569215 DOI:10.1042/BJ20051669
• Zhang T., Liu W.D., Saunee N.A., Breslin M.B., Lan M.S. (2009). Zinc finger transcription factor INSM1 interrupts cyclin D1 and CDK4 binding and induces cell cycle arrest. J. Biol. Chem. 284: 5574—5581. PMID 19124461 DOI:10.1074/jbc.M808843200
• Lan M.S., Breslin M.B. (2009). Structure, expression, and biological function of INSM1 transcription factor in neuroendocrine differentiation. FASEB J. 23: 2024—2033. PMID 19246490 DOI:10.1096/fj.08-125971
• Lan M.S., Li Q., Lu J., Modi W.S., Notkins A.L. (1994). Genomic organization, 5'-upstream sequence, and chromosomal localization of an insulinoma-associated intronless gene, IA-1. J. Biol. Chem. 269: 14170—14174. PMID 8188699

Див. також

• Хромосома 20