ITCH

ITCH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DMV, 2KYK, 2NQ3, 2P4R, 2YSF, 3TUG, 4ROF, 5CQ2, 5DWS, 5DZD, 5C7M
Ідентифікатори
Символи	ITCH, AIF4, AIP4, NAPP1, dJ468O1.1, ADMFD, itchy E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 606409 MGI: 1202301 HomoloGene: 88442 GeneCards: ITCH
Пов'язані генетичні захворювання
syndromic multisystem autoimmune disease due to ICTH deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • CXCR chemokine receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ribonucleoprotein complex binding • ubiquitin-like protein transferase activity • transferase activity • ligase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin-like protein ligase binding • arrestin family protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • екзосома • клітинна мембрана • мембрана • Нуклеоплазма • клітинне ядро • cell cortex • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • цитоплазма • early endosome • ендосома • endosome membrane • early endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • protein K29-linked ubiquitination • процес імунної системи • protein K63-linked ubiquitination • negative regulation of apoptotic process • defense response to virus • regulation of cell growth • viral entry into host cell • negative regulation of type I interferon production • inflammatory response • GO:0022415 viral process • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • вроджений імунітет • protein polyubiquitination • positive regulation of T cell anergy • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • negative regulation of JNK cascade • negative regulation of alpha-beta T cell proliferation • negative regulation of defense response to virus • protein K48-linked ubiquitination • regulation of protein deubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • positive regulation of receptor catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83737	16396
Ensembl	ENSG00000078747	ENSMUSG00000027598
UniProt	Q96J02	Q8C863
RefSeq (мРНК)	NM_001257137 NM_001257138 NM_031483 NM_001324197 NM_001324198	NM_001243712 NM_008395
RefSeq (білок)	NP_001244066 NP_001244067 NP_001311126 NP_001311127 NP_113671	NP_001230641 NP_032421
Локус (UCSC)	Хр. 20: 34.36 – 34.54 Mb	Хр. 2: 154.98 – 155.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITCH (англ. Itchy E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 903 амінокислот, а молекулярна маса — 102 803.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSGSQLGS		MGSLTMKSQL		QITVISAKLK		ENKKNWFGPS		PYVEVTVDGQ
SKKTEKCNNT		NSPKWKQPLT		VIVTPVSKLH		FRVWSHQTLK		SDVLLGTAAL
DIYETLKSNN		MKLEEVVVTL		QLGGDKEPTE		TIGDLSICLD		GLQLESEVVT
NGETTCSENG		VSLCLPRLEC		NSAISAHCNL		CLPGLSDSPI		SASRVAGFTG
ASQNDDGSRS		KDETRVSTNG		SDDPEDAGAG		ENRRVSGNNS		PSLSNGGFKP
SRPPRPSRPP		PPTPRRPASV		NGSPSATSES		DGSSTGSLPP		TNTNTNTSEG
ATSGLIIPLT		ISGGSGPRPL		NPVTQAPLPP		GWEQRVDQHG		RVYYVDHVEK
RTTWDRPEPL		PPGWERRVDN		MGRIYYVDHF		TRTTTWQRPT		LESVRNYEQW
QLQRSQLQGA		MQQFNQRFIY		GNQDLFATSQ		SKEFDPLGPL		PPGWEKRTDS
NGRVYFVNHN		TRITQWEDPR		SQGQLNEKPL		PEGWEMRFTV		DGIPYFVDHN
RRTTTYIDPR		TGKSALDNGP		QIAYVRDFKA		KVQYFRFWCQ		QLAMPQHIKI
TVTRKTLFED		SFQQIMSFSP		QDLRRRLWVI		FPGEEGLDYG		GVAREWFFLL
SHEVLNPMYC		LFEYAGKDNY		CLQINPASYI		NPDHLKYFRF		IGRFIAMALF
HGKFIDTGFS		LPFYKRILNK		PVGLKDLESI		DPEFYNSLIW		VKENNIEECD
LEMYFSVDKE		ILGEIKSHDL		KPNGGNILVT		EENKEEYIRM		VAEWRLSRGV
EEQTQAFFEG		FNEILPQQYL		QYFDAKELEV		LLCGMQEIDL		NDWQRHAIYR
HYARTSKQIM		WFWQFVKEID		NEKRMRLLQF		VTGTCRLPVG		GFADLMGSNG
PQKFCIEKVG		KENWLPRSHT		CFNRLDLPPY		KSYEQLKEKL		LFAIEETEGF
GQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Slagsvold T., Marchese A., Brech A., Stenmark H. (2006). CISK attenuates degradation of the chemokine receptor CXCR4 via the ubiquitin ligase AIP4. EMBO J. 25: 3738—3749. PMID 16888620 DOI:10.1038/sj.emboj.7601267
• Chastagner P., Israel A., Brou C. (2006). Itch/AIP4 mediates Deltex degradation through the formation of K29-linked polyubiquitin chains. EMBO Rep. 7: 1147—1153. PMID 17028573 DOI:10.1038/sj.embor.7400822
• Lee T.-L., Shyu Y.-C., Hsu T.-Y., Shen C.-K.J. (2008). Itch regulates p45/NF-E2 in vivo by Lys63-linked ubiquitination. Biochem. Biophys. Res. Commun. 375: 326—330. PMID 18718448 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.07.164
• Chastagner P., Israel A., Brou C. (2008). AIP4/Itch regulates Notch receptor degradation in the absence of ligand. PLoS ONE. 3: E2735—E2735. PMID 18628966 DOI:10.1371/journal.pone.0002735
• Shembade N., Parvatiyar K., Harhaj N.S., Harhaj E.W. (2009). The ubiquitin-editing enzyme A20 requires RNF11 to downregulate NF-kappaB signalling. EMBO J. 28: 513—522. PMID 19131965 DOI:10.1038/emboj.2008.285

Див. також

• Хромосома 20