NFRKB

NFRKB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3U21, 4UF6, 4WLP
Ідентифікатори
Символи	NFRKB, INO80G, nuclear factor related to kappaB binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 164013 MGI: 2442410 HomoloGene: 4492 GeneCards: NFRKB
Онтологія гена Молекулярна функція • protease binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Ino80 complex • Нуклеоплазма Біологічний процес • DNA recombination • inflammatory response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4798	235134
Ensembl	ENSG00000170322	ENSMUSG00000042185
UniProt	Q6P4R8	Q6PIJ4
RefSeq (мРНК)	NM_001143835 NM_006165	NM_172766 NM_001359654
RefSeq (білок)	NP_001137307 NP_006156 NP_001137307.1	NP_766354 NP_001346583 NP_001392026 NP_001392027 NP_001392028 NP_001392030 NP_001392031
Локус (UCSC)	Хр. 11: 129.86 – 129.9 Mb	Хр. 9: 31.3 – 31.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFRKB (англ. Nuclear factor related to kappaB binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 299 амінокислот, а молекулярна маса — 139 001.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSLDHMLTD		PLELGPCGDG		HGTRIMEDCL		LGGTRVSLPE		DLLEDPEIFF
DVVSLSTWQE		VLSDSQREHL		QQFLPQFPED		SAEQQNELIL		ALFSGENFRF
GNPLHIAQKL		FRDGHFNPEV		VKYRQLCFKS		QYKRYLNSQQ		QYFHRLLKQI
LASRSDLLEM		ARRSGPALPF		RQKRPSPSRT		PEEREWRTQQ		RYLKVLREVK
EECGDTALSS		DEEDLSSWLP		SSPARSPSPA		VPLRVVPTLS		TTDMKTADKV
ELGDSDLKIM		LKKHHEKRKH		QPDHPDLLTG		DLTLNDIMTR		VNAGRKGSLA
ALYDLAVLKK		KVKEKEEKKK		KKIKTIKSEA		EDLAEPLSST		EGVAPLSQAP
SPLAIPAIKE		EPLEDLKPCL		GINEISSSFF		SLLLEILLLE		SQASLPMLEE
RVLDWQSSPA		SSLNSWFSAA		PNWAELVLPA		LQYLAGESRA		VPSSFSPFVE
FKEKTQQWKL		LGQSQDNEKE		LAALFQLWLE		TKDQAFCKQE		NEDSSDATTP
VPRVRTDYVV		RPSTGEEKRV		FQEQERYRYS		QPHKAFTFRM		HGFESVVGPV
KGVFDKETSL		NKAREHSLLR		SDRPAYVTIL		SLVRDAAARL		PNGEGTRAEI
CELLKDSQFL		APDVTSTQVN		TVVSGALDRL		HYEKDPCVKY		DIGRKLWIYL
HRDRSEEEFE		RIHQAQAAAA		KARKALQQKP		KPPSKVKSSS		KESSIKVLSS
GPSEQSQMSL		SDSSMPPTPV		TPVTPTTPAL		PAIPISPPPV		SAVNKSGPST
VSEPAKSSSG		VLLVSSPTMP		HLGTMLSPAS		SQTAPSSQAA		ARVVSHSGSA
GLSQVRVVAQ		PSLPAVPQQS		GGPAQTLPQM		PAGPQIRVPA		TATQTKVVPQ
TVMATVPVKA		QTTAATVQRP		GPGQTGLTVT		SLPATASPVS		KPATSSPGTS
APSASTAAVI		QNVTGQNIIK		QVAITGQLGV		KPQTGNSIPL		TATNFRIQGK
DVLRLPPSSI		TTDAKGQTVL		RITPDMMATL		AKSQVTTVKL		TQDLFGTGGN
TTGKGISATL		HVTSNPVHAA		DSPAKASSAS		APSSTPTGTT		VVKVTPDLKP
TEASSSAFRL		MPALGVSVAD		QKGKSTVASS		EAKPAATIRI		VQGLGVMPPK
AGQTITVATH		AKQGASVASG		SGTVHTSAVS		LPSMNAAVSK		TVAVASGAAS
TPISISTGAP		TVRQVPVSTT		VVSTSQAGKL		PTRITVPLSV		ISQPMKGKSV
VTAPIIKGNL		GANLSGLGRN		IILTTMPAGT		KLIAGNKPVS		FLTAQQLQQL
QQQGQATQVR		IQTVPASHLQ		QGTASGSSKA		VSTVVVTTAP		SPKQAPEQQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Adams B.S., Leung K.Y., Hanley E.W., Nabel G.J. (1991). Cloning of R kappa B, a novel DNA-binding protein that recognizes the interleukin-2 receptor alpha chain kappa B site. New Biol. 3: 1063—1073. PMID 1777480

Див. також

• Хромосома 11